Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCE3A1L190 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCE3A1L190 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCE3A1L190 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms