RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C FAP1P53971 965 aa9.74□□□□□ -0.85
HDA3YPR179C PRY3P47033 881 aa9.21□□□□□ -0.94
HDA3YPR179C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HDA3YPR179C MTC1P47018 478 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HDA3YPR179C YCK3P39962 524 aa8.39□□□□□ -1.07
HDA3YPR179C AAD16Q02895 342 aa8.3□□□□□ -1.08
HDA3YPR179C PRI1P10363 409 aa8.03□□□□□ -1.12
HDA3YPR179C DRS1P32892 752 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
HDA3YPR179C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
HDA3YPR179C YGL015CP33199 130 aa7.54□□□□□ -1.2
HDA3YPR179C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
HDA3YPR179C ISW2Q08773 1120 aa7.37□□□□□ -1.23
HDA3YPR179C MRPL32P25348 183 aa7.31□□□□□ -1.24
HDA3YPR179C SIS1P25294 352 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDA3YPR179C RPG1P38249 964 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HDA3YPR179C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
HDA3YPR179C UBP9P39967 754 aa6.88□□□□□ -1.31
HDA3YPR179C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDA3YPR179C AVT3P36062 692 aa6.66□□□□□ -1.34
HDA3YPR179C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HDA3YPR179C MAP2P38174 421 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HDA3YPR179C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
HDA3YPR179C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
HDA3YPR179C REB1P21538 810 aa6.45□□□□□ -1.38
HDA3YPR179C CDC27P38042 758 aa6.45□□□□□ -1.38
HDA3YPR179C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDA3YPR179C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDA3YPR179C TGL3P40308 642 aa6.37□□□□□ -1.39
HDA3YPR179C SPT21P35209 758 aa6.22□□□□□ -1.41
HDA3YPR179C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
HDA3YPR179C SLX5P32828 619 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
HDA3YPR179C YJL171CP46992 396 aa6.15□□□□□ -1.42
HDA3YPR179C SCY1P53009 804 aa6.08□□□□□ -1.44
HDA3YPR179C YBL029C-AQ3E756 94 aa6.07□□□□□ -1.44
HDA3YPR179C TFC8Q12308 588 aa6.05□□□□□ -1.44
HDA3YPR179C RIM101P33400 625 aa6□□□□□ -1.45
HDA3YPR179C HOP09932 586 aa5.99□□□□□ -1.45
HDA3YPR179C RGA2Q06407 1009 aa5.98□□□□□ -1.45
HDA3YPR179C DCD1P06773 312 aa5.95□□□□□ -1.46
HDA3YPR179C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HDA3YPR179C SPP1Q03012 353 aa5.92□□□□□ -1.46
HDA3YPR179C VNX1P42839 908 aa5.9□□□□□ -1.46
HDA3YPR179C FKH1P40466 484 aa5.87□□□□□ -1.47
HDA3YPR179C BMT6Q12291 365 aa5.84□□□□□ -1.47
HDA3YPR179C BCH2P36122 765 aa5.84□□□□□ -1.48
HDA3YPR179C MST1P07236 462 aa5.8□□□□□ -1.48
HDA3YPR179C YOR238WQ08634 303 aa5.78□□□□□ -1.48
HDA3YPR179C OXP1P28273 1286 aa5.76□□□□□ -1.49
HDA3YPR179C TFA1P36100 482 aa5.76□□□□□ -1.49
HDA3YPR179C WSC3Q12215 556 aa5.73□□□□□ -1.49
HDA3YPR179C TIF11P38912 153 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HDA3YPR179C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
HDA3YPR179C EPS1P40557 701 aa5.67□□□□□ -1.5
HDA3YPR179C BDF1P35817 686 aa5.67□□□□□ -1.5
HDA3YPR179C PTP3P40048 928 aa5.66□□□□□ -1.5
HDA3YPR179C RSM7P47150 247 aa5.62□□□□□ -1.51
HDA3YPR179C LDB19Q12502 818 aa5.6□□□□□ -1.51
HDA3YPR179C BBC1P47068 1157 aa5.59□□□□□ -1.51
HDA3YPR179C RGA1P39083 1007 aa5.58□□□□□ -1.52
HDA3YPR179C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data5.57□□□□□ -1.52not detected
HDA3YPR179C AI2P03876 854 aa5.56□□□□□ -1.52
HDA3YPR179C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
HDA3YPR179C BCK2P33306 851 aa5.51□□□□□ -1.53
HDA3YPR179C GTT3P39996 337 aa5.51□□□□□ -1.53
HDA3YPR179C ULI1P43604 169 aa5.49□□□□□ -1.53
HDA3YPR179C YLR271WQ06152 274 aa5.49□□□□□ -1.53
HDA3YPR179C YAP5P40574 245 aa5.47□□□□□ -1.53
HDA3YPR179C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
HDA3YPR179C IOC2Q12072 812 aa5.42□□□□□ -1.54
HDA3YPR179C SSP1P38871 571 aa5.41□□□□□ -1.54
HDA3YPR179C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data5.4□□□□□ -1.54not detected
HDA3YPR179C NCR1Q12200 1170 aa5.35□□□□□ -1.55
HDA3YPR179C RTG1P32607 177 aa5.34□□□□□ -1.55
HDA3YPR179C MRM1P25270 412 aa5.33□□□□□ -1.56
HDA3YPR179C MGA2P40578 1113 aa5.31□□□□□ -1.56
HDA3YPR179C EAP1P36041 632 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
HDA3YPR179C CST9Q06032 482 aa5.28□□□□□ -1.56
HDA3YPR179C RTG3P38165 486 aa5.27□□□□□ -1.57
HDA3YPR179C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data5.26□□□□□ -1.57not detected
HDA3YPR179C VPS29P38759 282 aa5.25□□□□□ -1.57
HDA3YPR179C MSB4Q12317 492 aa5.25□□□□□ -1.57
HDA3YPR179C DPS1P04802 557 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
HDA3YPR179C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
HDA3YPR179C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
HDA3YPR179C PIB1Q06651 286 aa5.24□□□□□ -1.57
HDA3YPR179C DBP1P24784 617 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
HDA3YPR179C XDJ1P39102 459 aa5.22□□□□□ -1.57
HDA3YPR179C SEC61P32915 480 aa5.21□□□□□ -1.58
HDA3YPR179C STS1P38637 319 aa5.18□□□□□ -1.58
HDA3YPR179C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
HDA3YPR179C SAM3Q08986 587 aa5.18□□□□□ -1.58
HDA3YPR179C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
HDA3YPR179C YOL036WQ08206 761 aa5.18□□□□□ -1.58
HDA3YPR179C RCR1P38212 213 aa5.15□□□□□ -1.58
HDA3YPR179C SAP30P38429 201 aa5.15□□□□□ -1.58
HDA3YPR179C SET4P42948 560 aa5.15□□□□□ -1.58
HDA3YPR179C YFR006WP43590 535 aa5.15□□□□□ -1.58
HDA3YPR179C TRP5P00931 707 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
HDA3YPR179C PRE3P38624 215 aa5.13□□□□□ -1.59
HDA3YPR179C ABP1P15891 592 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.8 ms