RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	15.63	■□□□□ 0.09
MIA40	YKL195W	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
MIA40	YKL195W	FAP1	P53971	965 aa		14.02	□□□□□ -0.17
MIA40	YKL195W	PRI1	P10363	409 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIA40	YKL195W	PRY3	P47033	881 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIA40	YKL195W	AAD16	Q02895	342 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MIA40	YKL195W	ISW2	Q08773	1120 aa		12.94	□□□□□ -0.34
MIA40	YKL195W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
MIA40	YKL195W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
MIA40	YKL195W	YCK3	P39962	524 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIA40	YKL195W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
MIA40	YKL195W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
MIA40	YKL195W	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
MIA40	YKL195W	AVT3	P36062	692 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MIA40	YKL195W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
MIA40	YKL195W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MIA40	YKL195W	MRPL32	P25348	183 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MIA40	YKL195W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MIA40	YKL195W	REB1	P21538	810 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MIA40	YKL195W	SPT21	P35209	758 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MIA40	YKL195W	YGL015C	P33199	130 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MIA40	YKL195W	SGS1	P35187	1447 aa		11.4	□□□□□ -0.58
MIA40	YKL195W	CDC27	P38042	758 aa		11.38	□□□□□ -0.59
MIA40	YKL195W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
MIA40	YKL195W	TFA1	P36100	482 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MIA40	YKL195W	INO80	P53115	1489 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MIA40	YKL195W	TFC8	Q12308	588 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MIA40	YKL195W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
MIA40	YKL195W	HO	P09932	586 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MIA40	YKL195W	RIM101	P33400	625 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MIA40	YKL195W	DCD1	P06773	312 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MIA40	YKL195W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
MIA40	YKL195W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
MIA40	YKL195W	SSN2	P38931	1420 aa		10.87	□□□□□ -0.67
MIA40	YKL195W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
MIA40	YKL195W	SCY1	P53009	804 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MIA40	YKL195W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		10.74	□□□□□ -0.69
MIA40	YKL195W	BCH2	P36122	765 aa		10.73	□□□□□ -0.69
MIA40	YKL195W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
MIA40	YKL195W	OXP1	P28273	1286 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MIA40	YKL195W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MIA40	YKL195W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MIA40	YKL195W	HSL1	P34244	1518 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MIA40	YKL195W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
MIA40	YKL195W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	10.56	□□□□□ -0.72
MIA40	YKL195W	TGL3	P40308	642 aa		10.56	□□□□□ -0.72
MIA40	YKL195W	SWR1	Q05471	1514 aa		10.55	□□□□□ -0.72
MIA40	YKL195W	PTP3	P40048	928 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MIA40	YKL195W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
MIA40	YKL195W	EPS1	P40557	701 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MIA40	YKL195W	BDF1	P35817	686 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MIA40	YKL195W	HIR3	P47171	1648 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MIA40	YKL195W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
MIA40	YKL195W	RSM7	P47150	247 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MIA40	YKL195W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MIA40	YKL195W	AI2	P03876	854 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MIA40	YKL195W	BBC1	P47068	1157 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MIA40	YKL195W	DNA2	P38859	1522 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MIA40	YKL195W	REV3	P14284	1504 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MIA40	YKL195W	UBP9	P39967	754 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MIA40	YKL195W	KOG1	P38873	1557 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MIA40	YKL195W	TAF2	P23255	1407 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MIA40	YKL195W	YLR271W	Q06152	274 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MIA40	YKL195W	MST1	P07236	462 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MIA40	YKL195W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.14	□□□□□ -0.79	not detected
MIA40	YKL195W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MIA40	YKL195W	SIN3	P22579	1536 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MIA40	YKL195W	BUD4	P47136	1447 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MIA40	YKL195W	ECM5	Q03214	1411 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MIA40	YKL195W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
MIA40	YKL195W	YOR238W	Q08634	303 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MIA40	YKL195W	SSK2	P53599	1579 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MIA40	YKL195W	SSP1	P38871	571 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MIA40	YKL195W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MIA40	YKL195W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MIA40	YKL195W	YAP5	P40574	245 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MIA40	YKL195W	ESP1	Q03018	1630 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MIA40	YKL195W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	9.97	□□□□□ -0.81	not detected
MIA40	YKL195W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
MIA40	YKL195W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MIA40	YKL195W	ATG2	P53855	1592 aa		9.92	□□□□□ -0.82
MIA40	YKL195W	MRM1	P25270	412 aa		9.88	□□□□□ -0.83
MIA40	YKL195W	MDS3	P53094	1487 aa		9.87	□□□□□ -0.83
MIA40	YKL195W	YPK9	Q12697	1472 aa		9.86	□□□□□ -0.83
MIA40	YKL195W	VNX1	P42839	908 aa		9.85	□□□□□ -0.83
MIA40	YKL195W	POL1	P13382	1468 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MIA40	YKL195W	PEP1	P32319	1579 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MIA40	YKL195W	STU1	P38198	1513 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MIA40	YKL195W	CST9	Q06032	482 aa		9.82	□□□□□ -0.84
MIA40	YKL195W	YTA7	P40340	1379 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MIA40	YKL195W	MGA2	P40578	1113 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MIA40	YKL195W	WSC3	Q12215	556 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MIA40	YKL195W	CHD1	P32657	1468 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MIA40	YKL195W	SCC2	Q04002	1493 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MIA40	YKL195W	GTT3	P39996	337 aa		9.76	□□□□□ -0.85
MIA40	YKL195W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	9.76	□□□□□ -0.85
MIA40	YKL195W	MMS22	Q06164	1454 aa		9.76	□□□□□ -0.85
MIA40	YKL195W	SPP1	Q03012	353 aa		9.74	□□□□□ -0.85
MIA40	YKL195W	UFD4	P33202	1483 aa		9.73	□□□□□ -0.85
MIA40	YKL195W	PIB1	Q06651	286 aa		9.73	□□□□□ -0.85

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