Protein–RNA interactions for Protein: Q04002

SCC2, Sister chromatid cohesion protein 2, yeastyeast

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Length 1,493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SCC2Q04002 YML009W-BYML009W-B 477 nt33.99■■■■□ 3.03
SCC2Q04002 NOP1YDL014W 984 nt32.86■■■□□ 2.85
SCC2Q04002 NSR1YGR159C 1245 nt32.54■■■□□ 2.8
SCC2Q04002 YKL036CYKL036C 393 nt31.31■■■□□ 2.6
SCC2Q04002 YJL027CYJL027C 417 nt29.43■■■□□ 2.3
SCC2Q04002 Q0297Q0297 156 nt29.13■■■□□ 2.25
SCC2Q04002 SCS3YGL126W 1143 nt29.12■■■□□ 2.25
SCC2Q04002 SRX1YKL086W 384 nt28.91■■■□□ 2.22
SCC2Q04002 MDJ1YFL016C 1536 nt28.71■■■□□ 2.19
SCC2Q04002 YCR051WYCR051W 669 nt27.64■■■□□ 2.02
SCC2Q04002 YOL085CYOL085C 342 nt27.05■■□□□ 1.92
SCC2Q04002 PKP1YIL042C 1185 nt26.87■■□□□ 1.89
SCC2Q04002 SCJ1YMR214W 1134 nt26.35■■□□□ 1.81
SCC2Q04002 RPP1BYDL130W 321 nt26.18■■□□□ 1.78
SCC2Q04002 ATS1YAL020C 1002 nt26.04■■□□□ 1.76
SCC2Q04002 TRN1tP(UGG)A 72 nt25.8■■□□□ 1.72
SCC2Q04002 SUF9tP(UGG)F 72 nt25.8■■□□□ 1.72
SCC2Q04002 SUF8tP(UGG)H 72 nt25.8■■□□□ 1.72
SCC2Q04002 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt25.8■■□□□ 1.72
SCC2Q04002 SUF7tP(UGG)M 72 nt25.8■■□□□ 1.72
SCC2Q04002 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt25.8■■□□□ 1.72
SCC2Q04002 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt25.8■■□□□ 1.72
SCC2Q04002 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt25.8■■□□□ 1.72
SCC2Q04002 SUF11tP(UGG)O2 72 nt25.8■■□□□ 1.72
SCC2Q04002 CCC1YLR220W 969 nt25.59■■□□□ 1.69
SCC2Q04002 DBP2YNL112W 1641 nt25.56■■□□□ 1.68
SCC2Q04002 PET122YER153C 765 nt25.18■■□□□ 1.62
SCC2Q04002 SCR1SCR1 522 nt24.86■■□□□ 1.57
SCC2Q04002 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt24.6■■□□□ 1.53
SCC2Q04002 RTC3YHR087W 336 nt24.34■■□□□ 1.49
SCC2Q04002 RRN5YLR141W 1092 nt24.34■■□□□ 1.49
SCC2Q04002 RSB1YOR049C 1065 nt24.25■■□□□ 1.47
SCC2Q04002 RVS167YDR388W 1449 nt24.02■■□□□ 1.44
SCC2Q04002 PST2YDR032C 597 nt23.92■■□□□ 1.42
SCC2Q04002 YER088W-BYER088W-B 147 nt23.9■■□□□ 1.42
SCC2Q04002 YBR190WYBR190W 312 nt23.82■■□□□ 1.4
SCC2Q04002 YDJ1YNL064C 1230 nt23.61■■□□□ 1.37
SCC2Q04002 YKL097CYKL097C 411 nt23.58■■□□□ 1.37
SCC2Q04002 SHR5YOL110W 714 nt23.45■■□□□ 1.34
SCC2Q04002 GAR1YHR089C 618 nt23.2■■□□□ 1.3
SCC2Q04002 SHU1YHL006C 453 nt23■■□□□ 1.27
SCC2Q04002 DEP1YAL013W 1218 nt22.79■■□□□ 1.24
SCC2Q04002 YOR139CYOR139C 393 nt22.58■■□□□ 1.2
SCC2Q04002 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt22.52■■□□□ 1.2
SCC2Q04002 URN1YPR152C 1398 nt22.41■■□□□ 1.18
SCC2Q04002 TIR1YER011W 765 nt22.31■■□□□ 1.16
SCC2Q04002 YNL208WYNL208W 600 nt22.16■■□□□ 1.14
SCC2Q04002 NPL3YDR432W 1245 nt22.13■■□□□ 1.13
SCC2Q04002 RPN10YHR200W 807 nt22.04■■□□□ 1.12
SCC2Q04002 SRB2YHR041C 633 nt22.03■■□□□ 1.12
SCC2Q04002 MNP1YGL068W 585 nt21.97■■□□□ 1.11
SCC2Q04002 SSA1YAL005C 1929 nt21.96■■□□□ 1.11
SCC2Q04002 OPI9YLR338W 858 nt21.73■■□□□ 1.07
SCC2Q04002 WWM1YFL010C 636 nt21.62■■□□□ 1.05
SCC2Q04002 HOM6YJR139C 1080 nt21.62■■□□□ 1.05
SCC2Q04002 SAH1YER043C 1350 nt21.59■■□□□ 1.05
SCC2Q04002 YOL037CYOL037C 354 nt21.56■■□□□ 1.04
SCC2Q04002 YGR021WYGR021W 873 nt21.52■■□□□ 1.03
SCC2Q04002 YJR120WYJR120W 351 nt21.44■■□□□ 1.02
SCC2Q04002 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt21.42■■□□□ 1.02
SCC2Q04002 IMT4tM(CAU)E 72 nt21.42■■□□□ 1.02
SCC2Q04002 IMT3tM(CAU)J3 72 nt21.42■■□□□ 1.02
SCC2Q04002 IMT1tM(CAU)O1 72 nt21.42■■□□□ 1.02
SCC2Q04002 IMT2tM(CAU)P 72 nt21.42■■□□□ 1.02
SCC2Q04002 YJR018WYJR018W 363 nt21.31■■□□□ 1
SCC2Q04002 RKM5YLR137W 1104 nt21.3■■□□□ 1
SCC2Q04002 PUT4YOR348C 1884 nt21.14■□□□□ 0.98
SCC2Q04002 MOT3YMR070W 1473 nt21.1■□□□□ 0.97
SCC2Q04002 ARE1YCR048W 1833 nt21.1■□□□□ 0.97
SCC2Q04002 PUS2YGL063W 1113 nt21.08■□□□□ 0.97
SCC2Q04002 PUN1YLR414C 792 nt21.07■□□□□ 0.96
SCC2Q04002 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt21.06■□□□□ 0.96
SCC2Q04002 RPP2BYDR382W 333 nt21.02■□□□□ 0.96
SCC2Q04002 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt21.02■□□□□ 0.96
SCC2Q04002 SSA3YBL075C 1950 nt20.99■□□□□ 0.95
SCC2Q04002 YLR281CYLR281C 468 nt20.92■□□□□ 0.94
SCC2Q04002 BDH2YAL061W 1254 nt20.81■□□□□ 0.92
SCC2Q04002 WHI5YOR083W 888 nt20.81■□□□□ 0.92
SCC2Q04002 BSC6YOL137W 1494 nt20.79■□□□□ 0.92
SCC2Q04002 PTC2YER089C 1395 nt20.78■□□□□ 0.92
SCC2Q04002 FMP45YDL222C 930 nt20.71■□□□□ 0.91
SCC2Q04002 YLR236CYLR236C 324 nt20.71■□□□□ 0.91
SCC2Q04002 POA1YBR022W 534 nt20.62■□□□□ 0.89
SCC2Q04002 YPR011CYPR011C 981 nt20.61■□□□□ 0.89
SCC2Q04002 BUD23YCR047C 828 nt20.54■□□□□ 0.88
SCC2Q04002 DSK2YMR276W 1122 nt20.5■□□□□ 0.87
SCC2Q04002 YBL100CYBL100C 315 nt20.49■□□□□ 0.87
SCC2Q04002 FIS1YIL065C 468 nt20.44■□□□□ 0.86
SCC2Q04002 LSM3YLR438C-A 270 nt20.43■□□□□ 0.86
SCC2Q04002 FPR4YLR449W 1179 nt20.39■□□□□ 0.85
SCC2Q04002 YCH1YGR203W 447 nt20.32■□□□□ 0.84
SCC2Q04002 NAB2YGL122C 1578 nt20.29■□□□□ 0.84
SCC2Q04002 PHO4YFR034C 939 nt20.24■□□□□ 0.83
SCC2Q04002 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt20.24■□□□□ 0.83
SCC2Q04002 LPX1YOR084W 1164 nt20.24■□□□□ 0.83
SCC2Q04002 DAL1YIR027C 1383 nt20.24■□□□□ 0.83
SCC2Q04002 MRPL8YJL063C 717 nt20.24■□□□□ 0.83
SCC2Q04002 SPP1YPL138C 1062 nt20.21■□□□□ 0.83
SCC2Q04002 UBX6YJL048C 1191 nt20.19■□□□□ 0.82
SCC2Q04002 INM2YDR287W 879 nt20.18■□□□□ 0.82
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