RNA–Protein interactions for RNA: YKL056C

TMA19, Transcript of Protein that associates with ribosomes, yeastyeast

Gene TMA19, Length 504 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA19YKL056C FAP1P53971 965 aa9.09□□□□□ -0.95
TMA19YKL056C PRY3P47033 881 aa8.65□□□□□ -1.02
TMA19YKL056C YCK3P39962 524 aa8.2□□□□□ -1.1
TMA19YKL056C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TMA19YKL056C AAD16Q02895 342 aa7.78□□□□□ -1.16
TMA19YKL056C MTC1P47018 478 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
TMA19YKL056C PRI1P10363 409 aa7.61□□□□□ -1.19
TMA19YKL056C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TMA19YKL056C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TMA19YKL056C YGL015CP33199 130 aa7□□□□□ -1.29
TMA19YKL056C RPG1P38249 964 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TMA19YKL056C ISW2Q08773 1120 aa6.8□□□□□ -1.32
TMA19YKL056C MRPL32P25348 183 aa6.77□□□□□ -1.33
TMA19YKL056C SIS1P25294 352 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TMA19YKL056C INO80P53115 1489 aa6.63□□□□□ -1.35
TMA19YKL056C SGS1P35187 1447 aa6.57□□□□□ -1.36
TMA19YKL056C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TMA19YKL056C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TMA19YKL056C TY1B-DR4Q07793 1604 aa6.4□□□□□ -1.38
TMA19YKL056C SWR1Q05471 1514 aa6.32□□□□□ -1.4
TMA19YKL056C UBP9P39967 754 aa6.28□□□□□ -1.4
TMA19YKL056C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TMA19YKL056C HSL1P34244 1518 aa6.26□□□□□ -1.41
TMA19YKL056C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
TMA19YKL056C DRS1P32892 752 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
TMA19YKL056C KOG1P38873 1557 aa6.21□□□□□ -1.42
TMA19YKL056C SSN2P38931 1420 aa6.2□□□□□ -1.42
TMA19YKL056C CDC27P38042 758 aa6.19□□□□□ -1.42
TMA19YKL056C MAP2P38174 421 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TMA19YKL056C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
TMA19YKL056C DNA2P38859 1522 aa6.16□□□□□ -1.42
TMA19YKL056C HIR3P47171 1648 aa6.12□□□□□ -1.43
TMA19YKL056C THO2P53552 1597 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TMA19YKL056C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TMA19YKL056C BUD4P47136 1447 aa6.02□□□□□ -1.45
TMA19YKL056C SIN3P22579 1536 aa6□□□□□ -1.45
TMA19YKL056C REV3P14284 1504 aa5.99□□□□□ -1.45
TMA19YKL056C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TMA19YKL056C ECM5Q03214 1411 aa5.95□□□□□ -1.46
TMA19YKL056C TGL3P40308 642 aa5.94□□□□□ -1.46
TMA19YKL056C SSK2P53599 1579 aa5.91□□□□□ -1.46
TMA19YKL056C MDS3P53094 1487 aa5.9□□□□□ -1.46
TMA19YKL056C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
TMA19YKL056C ATG2P53855 1592 aa5.88□□□□□ -1.47
TMA19YKL056C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
TMA19YKL056C PEP1P32319 1579 aa5.87□□□□□ -1.47
TMA19YKL056C TAF2P23255 1407 aa5.84□□□□□ -1.47
TMA19YKL056C ESP1Q03018 1630 aa5.82□□□□□ -1.48
TMA19YKL056C YPK9Q12697 1472 aa5.82□□□□□ -1.48
TMA19YKL056C REB1P21538 810 aa5.8□□□□□ -1.48
TMA19YKL056C SKI3P17883 1432 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TMA19YKL056C RPO31P04051 1460 aa5.74□□□□□ -1.49
TMA19YKL056C SCC2Q04002 1493 aa5.74□□□□□ -1.49
TMA19YKL056C POL1P13382 1468 aa5.73□□□□□ -1.49
TMA19YKL056C YBL029C-AQ3E756 94 aa5.73□□□□□ -1.49
TMA19YKL056C SLX5P32828 619 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
TMA19YKL056C SCY1P53009 804 aa5.72□□□□□ -1.49
TMA19YKL056C BPT1P14772 1559 aa5.72□□□□□ -1.49
TMA19YKL056C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
TMA19YKL056C UFD4P33202 1483 aa5.7□□□□□ -1.5
TMA19YKL056C RGA2Q06407 1009 aa5.69□□□□□ -1.5
TMA19YKL056C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TMA19YKL056C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TMA19YKL056C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TMA19YKL056C YCF1P39109 1515 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TMA19YKL056C YTA7P40340 1379 aa5.66□□□□□ -1.5
TMA19YKL056C SMC4Q12267 1418 aa5.65□□□□□ -1.5
TMA19YKL056C DCD1P06773 312 aa5.65□□□□□ -1.5
TMA19YKL056C YOR1P53049 1477 aa5.64□□□□□ -1.51
TMA19YKL056C RKR1Q04781 1562 aa5.64□□□□□ -1.51
TMA19YKL056C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
TMA19YKL056C MYO4P32492 1471 aa5.63□□□□□ -1.51
TMA19YKL056C CHD1P32657 1468 aa5.63□□□□□ -1.51
TMA19YKL056C STU1P38198 1513 aa5.63□□□□□ -1.51
TMA19YKL056C YJL171CP46992 396 aa5.6□□□□□ -1.51
TMA19YKL056C CDC25P04821 1589 aa5.59□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C HOP09932 586 aa5.58□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa5.57□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C TY2B-FP0CX63 1770 aa5.57□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa5.57□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C TY2B-CP25384 1770 aa5.57□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C TY2B-DR2Q03494 1770 aa5.57□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C TY1B-DR1Q03855 1755 aa5.57□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C TY2B-OR1Q12113 1770 aa5.57□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C TY2B-DR1Q12472 1770 aa5.57□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C TY2B-OR2Q12501 1770 aa5.57□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C PAN1P32521 1480 aa5.57□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C VNX1P42839 908 aa5.56□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C TFC8Q12308 588 aa5.56□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C MMS22Q06164 1454 aa5.56□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C SPP41P38904 1435 aa5.55□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C FKH1P40466 484 aa5.53□□□□□ -1.52
TMA19YKL056C TSC11P40061 1430 aa5.52□□□□□ -1.53
TMA19YKL056C MET5P47169 1442 aa5.52□□□□□ -1.53
TMA19YKL056C TY1B-DR3Q99231 1755 aa5.52□□□□□ -1.53
TMA19YKL056C TRM732Q03496 1420 aa5.51□□□□□ -1.53
TMA19YKL056C TAF7Q05021 590 aa5.51□□□□□ -1.53
TMA19YKL056C TY2B-BQ12491 1770 aa5.51□□□□□ -1.53
TMA19YKL056C TY1B-BRQ12193 1756 aa5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.1 ms