Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 YML009W-BYML009W-B 477 nt33.21■■■□□ 2.91
TY2B-BQ12491 NOP1YDL014W 984 nt31.79■■■□□ 2.68
TY2B-BQ12491 NSR1YGR159C 1245 nt31.59■■■□□ 2.65
TY2B-BQ12491 YKL036CYKL036C 393 nt30.54■■■□□ 2.48
TY2B-BQ12491 YJL027CYJL027C 417 nt28.62■■■□□ 2.17
TY2B-BQ12491 SCS3YGL126W 1143 nt28.5■■■□□ 2.15
TY2B-BQ12491 Q0297Q0297 156 nt28.41■■■□□ 2.14
TY2B-BQ12491 SRX1YKL086W 384 nt28.31■■■□□ 2.12
TY2B-BQ12491 MDJ1YFL016C 1536 nt28.05■■■□□ 2.08
TY2B-BQ12491 YCR051WYCR051W 669 nt26.97■■□□□ 1.91
TY2B-BQ12491 YOL085CYOL085C 342 nt26.27■■□□□ 1.8
TY2B-BQ12491 PKP1YIL042C 1185 nt26.23■■□□□ 1.79
TY2B-BQ12491 SCJ1YMR214W 1134 nt25.67■■□□□ 1.7
TY2B-BQ12491 RPP1BYDL130W 321 nt25.45■■□□□ 1.66
TY2B-BQ12491 ATS1YAL020C 1002 nt25.35■■□□□ 1.65
TY2B-BQ12491 TRN1tP(UGG)A 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY2B-BQ12491 SUF9tP(UGG)F 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY2B-BQ12491 SUF8tP(UGG)H 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY2B-BQ12491 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY2B-BQ12491 SUF7tP(UGG)M 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY2B-BQ12491 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY2B-BQ12491 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY2B-BQ12491 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY2B-BQ12491 SUF11tP(UGG)O2 72 nt25.24■■□□□ 1.63
TY2B-BQ12491 DBP2YNL112W 1641 nt25.02■■□□□ 1.6
TY2B-BQ12491 CCC1YLR220W 969 nt24.9■■□□□ 1.58
TY2B-BQ12491 PET122YER153C 765 nt24.59■■□□□ 1.53
TY2B-BQ12491 SCR1SCR1 522 nt24.19■■□□□ 1.46
TY2B-BQ12491 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt23.99■■□□□ 1.43
TY2B-BQ12491 RTC3YHR087W 336 nt23.75■■□□□ 1.39
TY2B-BQ12491 RRN5YLR141W 1092 nt23.7■■□□□ 1.39
TY2B-BQ12491 RSB1YOR049C 1065 nt23.67■■□□□ 1.38
TY2B-BQ12491 RVS167YDR388W 1449 nt23.34■■□□□ 1.33
TY2B-BQ12491 PST2YDR032C 597 nt23.31■■□□□ 1.32
TY2B-BQ12491 YER088W-BYER088W-B 147 nt23.27■■□□□ 1.32
TY2B-BQ12491 YBR190WYBR190W 312 nt23.14■■□□□ 1.3
TY2B-BQ12491 YKL097CYKL097C 411 nt23.01■■□□□ 1.27
TY2B-BQ12491 YDJ1YNL064C 1230 nt22.94■■□□□ 1.26
TY2B-BQ12491 SHR5YOL110W 714 nt22.84■■□□□ 1.25
TY2B-BQ12491 GAR1YHR089C 618 nt22.58■■□□□ 1.2
TY2B-BQ12491 SHU1YHL006C 453 nt22.48■■□□□ 1.19
TY2B-BQ12491 DEP1YAL013W 1218 nt22.29■■□□□ 1.16
TY2B-BQ12491 YOR139CYOR139C 393 nt22.15■■□□□ 1.14
TY2B-BQ12491 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt22.12■■□□□ 1.13
TY2B-BQ12491 URN1YPR152C 1398 nt21.91■■□□□ 1.1
TY2B-BQ12491 TIR1YER011W 765 nt21.71■■□□□ 1.07
TY2B-BQ12491 SRB2YHR041C 633 nt21.63■■□□□ 1.05
TY2B-BQ12491 NPL3YDR432W 1245 nt21.57■■□□□ 1.04
TY2B-BQ12491 MNP1YGL068W 585 nt21.55■■□□□ 1.04
TY2B-BQ12491 YNL208WYNL208W 600 nt21.5■■□□□ 1.03
TY2B-BQ12491 SSA1YAL005C 1929 nt21.42■■□□□ 1.02
TY2B-BQ12491 RPN10YHR200W 807 nt21.36■■□□□ 1.01
TY2B-BQ12491 WWM1YFL010C 636 nt21.18■□□□□ 0.98
TY2B-BQ12491 OPI9YLR338W 858 nt21.17■□□□□ 0.98
TY2B-BQ12491 HOM6YJR139C 1080 nt21.11■□□□□ 0.97
TY2B-BQ12491 SAH1YER043C 1350 nt21.09■□□□□ 0.97
TY2B-BQ12491 YJR120WYJR120W 351 nt21.08■□□□□ 0.96
TY2B-BQ12491 YOL037CYOL037C 354 nt21.04■□□□□ 0.96
TY2B-BQ12491 YGR021WYGR021W 873 nt20.93■□□□□ 0.94
TY2B-BQ12491 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt20.85■□□□□ 0.93
TY2B-BQ12491 IMT4tM(CAU)E 72 nt20.85■□□□□ 0.93
TY2B-BQ12491 IMT3tM(CAU)J3 72 nt20.85■□□□□ 0.93
TY2B-BQ12491 IMT1tM(CAU)O1 72 nt20.85■□□□□ 0.93
TY2B-BQ12491 IMT2tM(CAU)P 72 nt20.85■□□□□ 0.93
TY2B-BQ12491 YJR018WYJR018W 363 nt20.79■□□□□ 0.92
TY2B-BQ12491 RKM5YLR137W 1104 nt20.71■□□□□ 0.91
TY2B-BQ12491 ARE1YCR048W 1833 nt20.64■□□□□ 0.89
TY2B-BQ12491 SSA3YBL075C 1950 nt20.6■□□□□ 0.89
TY2B-BQ12491 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt20.59■□□□□ 0.89
TY2B-BQ12491 PUT4YOR348C 1884 nt20.59■□□□□ 0.89
TY2B-BQ12491 MOT3YMR070W 1473 nt20.58■□□□□ 0.88
TY2B-BQ12491 PUS2YGL063W 1113 nt20.57■□□□□ 0.88
TY2B-BQ12491 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt20.53■□□□□ 0.88
TY2B-BQ12491 PUN1YLR414C 792 nt20.47■□□□□ 0.87
TY2B-BQ12491 YLR281CYLR281C 468 nt20.4■□□□□ 0.86
TY2B-BQ12491 RPP2BYDR382W 333 nt20.39■□□□□ 0.85
TY2B-BQ12491 BDH2YAL061W 1254 nt20.31■□□□□ 0.84
TY2B-BQ12491 WHI5YOR083W 888 nt20.31■□□□□ 0.84
TY2B-BQ12491 YLR236CYLR236C 324 nt20.29■□□□□ 0.84
TY2B-BQ12491 BSC6YOL137W 1494 nt20.24■□□□□ 0.83
TY2B-BQ12491 FMP45YDL222C 930 nt20.2■□□□□ 0.82
TY2B-BQ12491 YPR011CYPR011C 981 nt20.19■□□□□ 0.82
TY2B-BQ12491 PTC2YER089C 1395 nt20.16■□□□□ 0.82
TY2B-BQ12491 POA1YBR022W 534 nt20.08■□□□□ 0.81
TY2B-BQ12491 BUD23YCR047C 828 nt20.06■□□□□ 0.8
TY2B-BQ12491 FIS1YIL065C 468 nt20■□□□□ 0.79
TY2B-BQ12491 YBL100CYBL100C 315 nt19.97■□□□□ 0.79
TY2B-BQ12491 DSK2YMR276W 1122 nt19.96■□□□□ 0.79
TY2B-BQ12491 LPX1YOR084W 1164 nt19.85■□□□□ 0.77
TY2B-BQ12491 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt19.81■□□□□ 0.76
TY2B-BQ12491 PHO4YFR034C 939 nt19.79■□□□□ 0.76
TY2B-BQ12491 LSM3YLR438C-A 270 nt19.79■□□□□ 0.76
TY2B-BQ12491 NAB2YGL122C 1578 nt19.76■□□□□ 0.75
TY2B-BQ12491 YCH1YGR203W 447 nt19.75■□□□□ 0.75
TY2B-BQ12491 FPR4YLR449W 1179 nt19.75■□□□□ 0.75
TY2B-BQ12491 SPP1YPL138C 1062 nt19.75■□□□□ 0.75
TY2B-BQ12491 RTG1YOL067C 534 nt19.73■□□□□ 0.75
TY2B-BQ12491 UBX6YJL048C 1191 nt19.72■□□□□ 0.75
TY2B-BQ12491 MRPL8YJL063C 717 nt19.72■□□□□ 0.75
TY2B-BQ12491 IMP2'YIL154C 1041 nt19.65■□□□□ 0.74
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