Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeastyeast

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Length 1,418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC4Q12267 YML009W-BYML009W-B 477 nt33.05■■■□□ 2.88
SMC4Q12267 NOP1YDL014W 984 nt31.99■■■□□ 2.71
SMC4Q12267 NSR1YGR159C 1245 nt31.83■■■□□ 2.69
SMC4Q12267 YKL036CYKL036C 393 nt30.28■■■□□ 2.44
SMC4Q12267 YJL027CYJL027C 417 nt28.45■■■□□ 2.15
SMC4Q12267 Q0297Q0297 156 nt28.23■■■□□ 2.11
SMC4Q12267 MDJ1YFL016C 1536 nt28.13■■■□□ 2.09
SMC4Q12267 SRX1YKL086W 384 nt28.05■■■□□ 2.08
SMC4Q12267 SCS3YGL126W 1143 nt28.03■■■□□ 2.08
SMC4Q12267 YCR051WYCR051W 669 nt26.85■■□□□ 1.89
SMC4Q12267 YOL085CYOL085C 342 nt26.16■■□□□ 1.78
SMC4Q12267 PKP1YIL042C 1185 nt25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q12267 RPP1BYDL130W 321 nt25.39■■□□□ 1.66
SMC4Q12267 SCJ1YMR214W 1134 nt25.23■■□□□ 1.63
SMC4Q12267 TRN1tP(UGG)A 72 nt25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q12267 SUF9tP(UGG)F 72 nt25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q12267 SUF8tP(UGG)H 72 nt25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q12267 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q12267 SUF7tP(UGG)M 72 nt25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q12267 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q12267 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q12267 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q12267 SUF11tP(UGG)O2 72 nt25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q12267 ATS1YAL020C 1002 nt25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q12267 CCC1YLR220W 969 nt24.95■■□□□ 1.59
SMC4Q12267 DBP2YNL112W 1641 nt24.95■■□□□ 1.58
SMC4Q12267 PET122YER153C 765 nt24.39■■□□□ 1.5
SMC4Q12267 SCR1SCR1 522 nt24.13■■□□□ 1.45
SMC4Q12267 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q12267 RRN5YLR141W 1092 nt23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q12267 RVS167YDR388W 1449 nt23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q12267 RSB1YOR049C 1065 nt23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q12267 YBR190WYBR190W 312 nt23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q12267 RTC3YHR087W 336 nt23.33■■□□□ 1.32
SMC4Q12267 YER088W-BYER088W-B 147 nt23.16■■□□□ 1.3
SMC4Q12267 PST2YDR032C 597 nt23.03■■□□□ 1.28
SMC4Q12267 YDJ1YNL064C 1230 nt22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q12267 SHR5YOL110W 714 nt22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q12267 YKL097CYKL097C 411 nt22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q12267 GAR1YHR089C 618 nt22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q12267 DEP1YAL013W 1218 nt22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q12267 SHU1YHL006C 453 nt22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q12267 URN1YPR152C 1398 nt21.97■■□□□ 1.11
SMC4Q12267 TIR1YER011W 765 nt21.73■■□□□ 1.07
SMC4Q12267 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt21.73■■□□□ 1.07
SMC4Q12267 YNL208WYNL208W 600 nt21.72■■□□□ 1.07
SMC4Q12267 RPN10YHR200W 807 nt21.64■■□□□ 1.06
SMC4Q12267 YOR139CYOR139C 393 nt21.64■■□□□ 1.06
SMC4Q12267 SSA1YAL005C 1929 nt21.38■■□□□ 1.01
SMC4Q12267 OPI9YLR338W 858 nt21.35■■□□□ 1.01
SMC4Q12267 SRB2YHR041C 633 nt21.33■■□□□ 1.01
SMC4Q12267 NPL3YDR432W 1245 nt21.32■■□□□ 1
SMC4Q12267 MNP1YGL068W 585 nt21.22■□□□□ 0.99
SMC4Q12267 SAH1YER043C 1350 nt21.21■□□□□ 0.99
SMC4Q12267 WWM1YFL010C 636 nt21■□□□□ 0.95
SMC4Q12267 HOM6YJR139C 1080 nt20.93■□□□□ 0.94
SMC4Q12267 YGR021WYGR021W 873 nt20.9■□□□□ 0.94
SMC4Q12267 YJR018WYJR018W 363 nt20.9■□□□□ 0.94
SMC4Q12267 PUT4YOR348C 1884 nt20.87■□□□□ 0.93
SMC4Q12267 YJR120WYJR120W 351 nt20.87■□□□□ 0.93
SMC4Q12267 YOL037CYOL037C 354 nt20.83■□□□□ 0.93
SMC4Q12267 ARE1YCR048W 1833 nt20.77■□□□□ 0.91
SMC4Q12267 PUN1YLR414C 792 nt20.74■□□□□ 0.91
SMC4Q12267 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt20.7■□□□□ 0.9
SMC4Q12267 RKM5YLR137W 1104 nt20.64■□□□□ 0.89
SMC4Q12267 RPP2BYDR382W 333 nt20.63■□□□□ 0.89
SMC4Q12267 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt20.6■□□□□ 0.89
SMC4Q12267 IMT4tM(CAU)E 72 nt20.6■□□□□ 0.89
SMC4Q12267 IMT3tM(CAU)J3 72 nt20.6■□□□□ 0.89
SMC4Q12267 IMT1tM(CAU)O1 72 nt20.6■□□□□ 0.89
SMC4Q12267 IMT2tM(CAU)P 72 nt20.6■□□□□ 0.89
SMC4Q12267 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt20.48■□□□□ 0.87
SMC4Q12267 PTC2YER089C 1395 nt20.45■□□□□ 0.86
SMC4Q12267 POA1YBR022W 534 nt20.37■□□□□ 0.85
SMC4Q12267 PUS2YGL063W 1113 nt20.35■□□□□ 0.85
SMC4Q12267 BDH2YAL061W 1254 nt20.33■□□□□ 0.84
SMC4Q12267 SSA3YBL075C 1950 nt20.33■□□□□ 0.84
SMC4Q12267 BUD23YCR047C 828 nt20.27■□□□□ 0.83
SMC4Q12267 YLR281CYLR281C 468 nt20.21■□□□□ 0.83
SMC4Q12267 MOT3YMR070W 1473 nt20.21■□□□□ 0.83
SMC4Q12267 WHI5YOR083W 888 nt20.13■□□□□ 0.81
SMC4Q12267 FPR4YLR449W 1179 nt20.1■□□□□ 0.81
SMC4Q12267 YBL100CYBL100C 315 nt20.08■□□□□ 0.8
SMC4Q12267 FIS1YIL065C 468 nt20.04■□□□□ 0.8
SMC4Q12267 NAB2YGL122C 1578 nt20■□□□□ 0.79
SMC4Q12267 LSM3YLR438C-A 270 nt19.98■□□□□ 0.79
SMC4Q12267 FMP45YDL222C 930 nt19.97■□□□□ 0.79
SMC4Q12267 YLR236CYLR236C 324 nt19.94■□□□□ 0.78
SMC4Q12267 DAL1YIR027C 1383 nt19.91■□□□□ 0.78
SMC4Q12267 INM2YDR287W 879 nt19.87■□□□□ 0.77
SMC4Q12267 PHO4YFR034C 939 nt19.87■□□□□ 0.77
SMC4Q12267 BSC6YOL137W 1494 nt19.85■□□□□ 0.77
SMC4Q12267 YPR011CYPR011C 981 nt19.84■□□□□ 0.77
SMC4Q12267 DSK2YMR276W 1122 nt19.82■□□□□ 0.76
SMC4Q12267 FUN26YAL022C 1554 nt19.78■□□□□ 0.76
SMC4Q12267 TRM9YML014W 840 nt19.76■□□□□ 0.75
SMC4Q12267 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt19.68■□□□□ 0.74
SMC4Q12267 YCH1YGR203W 447 nt19.6■□□□□ 0.73
SMC4Q12267 CCT6YDR188W 1641 nt19.54■□□□□ 0.72
SMC4Q12267 LPX1YOR084W 1164 nt19.53■□□□□ 0.72
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