Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 YML009W-BYML009W-B 477 nt33,25■■■□□ 2,91
TY1B-BRQ12193 NOP1YDL014W 984 nt31,89■■■□□ 2,69
TY1B-BRQ12193 NSR1YGR159C 1245 nt31,56■■■□□ 2,64
TY1B-BRQ12193 YKL036CYKL036C 393 nt30,71■■■□□ 2,51
TY1B-BRQ12193 YJL027CYJL027C 417 nt28,8■■■□□ 2,2
TY1B-BRQ12193 SCS3YGL126W 1143 nt28,69■■■□□ 2,18
TY1B-BRQ12193 Q0297Q0297 156 nt28,52■■■□□ 2,16
TY1B-BRQ12193 SRX1YKL086W 384 nt28,37■■■□□ 2,13
TY1B-BRQ12193 MDJ1YFL016C 1536 nt27,93■■■□□ 2,06
TY1B-BRQ12193 YCR051WYCR051W 669 nt27,05■■□□□ 1,92
TY1B-BRQ12193 YOL085CYOL085C 342 nt26,42■■□□□ 1,82
TY1B-BRQ12193 PKP1YIL042C 1185 nt26,37■■□□□ 1,81
TY1B-BRQ12193 SCJ1YMR214W 1134 nt25,95■■□□□ 1,74
TY1B-BRQ12193 ATS1YAL020C 1002 nt25,56■■□□□ 1,68
TY1B-BRQ12193 RPP1BYDL130W 321 nt25,55■■□□□ 1,68
TY1B-BRQ12193 TRN1tP(UGG)A 72 nt25,24■■□□□ 1,63
TY1B-BRQ12193 SUF9tP(UGG)F 72 nt25,24■■□□□ 1,63
TY1B-BRQ12193 SUF8tP(UGG)H 72 nt25,24■■□□□ 1,63
TY1B-BRQ12193 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt25,24■■□□□ 1,63
TY1B-BRQ12193 SUF7tP(UGG)M 72 nt25,24■■□□□ 1,63
TY1B-BRQ12193 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt25,24■■□□□ 1,63
TY1B-BRQ12193 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt25,24■■□□□ 1,63
TY1B-BRQ12193 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt25,24■■□□□ 1,63
TY1B-BRQ12193 SUF11tP(UGG)O2 72 nt25,24■■□□□ 1,63
TY1B-BRQ12193 DBP2YNL112W 1641 nt24,94■■□□□ 1,58
TY1B-BRQ12193 CCC1YLR220W 969 nt24,93■■□□□ 1,58
TY1B-BRQ12193 PET122YER153C 765 nt24,67■■□□□ 1,54
TY1B-BRQ12193 SCR1SCR1 522 nt24,29■■□□□ 1,48
TY1B-BRQ12193 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt24,03■■□□□ 1,44
TY1B-BRQ12193 RTC3YHR087W 336 nt24,02■■□□□ 1,44
TY1B-BRQ12193 RRN5YLR141W 1092 nt23,8■■□□□ 1,4
TY1B-BRQ12193 RSB1YOR049C 1065 nt23,78■■□□□ 1,4
TY1B-BRQ12193 PST2YDR032C 597 nt23,49■■□□□ 1,35
TY1B-BRQ12193 YER088W-BYER088W-B 147 nt23,37■■□□□ 1,33
TY1B-BRQ12193 RVS167YDR388W 1449 nt23,3■■□□□ 1,32
TY1B-BRQ12193 YKL097CYKL097C 411 nt23,22■■□□□ 1,31
TY1B-BRQ12193 YBR190WYBR190W 312 nt23,02■■□□□ 1,28
TY1B-BRQ12193 YDJ1YNL064C 1230 nt22,99■■□□□ 1,27
TY1B-BRQ12193 SHR5YOL110W 714 nt22,81■■□□□ 1,24
TY1B-BRQ12193 SHU1YHL006C 453 nt22,63■■□□□ 1,21
TY1B-BRQ12193 GAR1YHR089C 618 nt22,62■■□□□ 1,21
TY1B-BRQ12193 YOR139CYOR139C 393 nt22,35■■□□□ 1,17
TY1B-BRQ12193 DEP1YAL013W 1218 nt22,25■■□□□ 1,15
TY1B-BRQ12193 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt22,25■■□□□ 1,15
TY1B-BRQ12193 URN1YPR152C 1398 nt21,83■■□□□ 1,08
TY1B-BRQ12193 NPL3YDR432W 1245 nt21,74■■□□□ 1,07
TY1B-BRQ12193 TIR1YER011W 765 nt21,74■■□□□ 1,07
TY1B-BRQ12193 SRB2YHR041C 633 nt21,64■■□□□ 1,06
TY1B-BRQ12193 MNP1YGL068W 585 nt21,62■■□□□ 1,05
TY1B-BRQ12193 YNL208WYNL208W 600 nt21,46■■□□□ 1,03
TY1B-BRQ12193 SSA1YAL005C 1929 nt21,42■■□□□ 1,02
TY1B-BRQ12193 RPN10YHR200W 807 nt21,31■■□□□ 1
TY1B-BRQ12193 WWM1YFL010C 636 nt21,22■□□□□ 0,99
TY1B-BRQ12193 HOM6YJR139C 1080 nt21,17■□□□□ 0,98
TY1B-BRQ12193 YOL037CYOL037C 354 nt21,14■□□□□ 0,97
TY1B-BRQ12193 OPI9YLR338W 858 nt21,08■□□□□ 0,96
TY1B-BRQ12193 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt21,03■□□□□ 0,96
TY1B-BRQ12193 IMT4tM(CAU)E 72 nt21,03■□□□□ 0,96
TY1B-BRQ12193 IMT3tM(CAU)J3 72 nt21,03■□□□□ 0,96
TY1B-BRQ12193 IMT1tM(CAU)O1 72 nt21,03■□□□□ 0,96
TY1B-BRQ12193 IMT2tM(CAU)P 72 nt21,03■□□□□ 0,96
TY1B-BRQ12193 YJR120WYJR120W 351 nt21,02■□□□□ 0,96
TY1B-BRQ12193 YGR021WYGR021W 873 nt20,99■□□□□ 0,95
TY1B-BRQ12193 SAH1YER043C 1350 nt20,98■□□□□ 0,95
TY1B-BRQ12193 MOT3YMR070W 1473 nt20,78■□□□□ 0,92
TY1B-BRQ12193 RKM5YLR137W 1104 nt20,77■□□□□ 0,92
TY1B-BRQ12193 YJR018WYJR018W 363 nt20,72■□□□□ 0,91
TY1B-BRQ12193 PUS2YGL063W 1113 nt20,72■□□□□ 0,91
TY1B-BRQ12193 SSA3YBL075C 1950 nt20,57■□□□□ 0,88
TY1B-BRQ12193 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt20,56■□□□□ 0,88
TY1B-BRQ12193 BSC6YOL137W 1494 nt20,53■□□□□ 0,88
TY1B-BRQ12193 YLR281CYLR281C 468 nt20,51■□□□□ 0,87
TY1B-BRQ12193 ARE1YCR048W 1833 nt20,46■□□□□ 0,87
TY1B-BRQ12193 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt20,43■□□□□ 0,86
TY1B-BRQ12193 WHI5YOR083W 888 nt20,41■□□□□ 0,86
TY1B-BRQ12193 PUT4YOR348C 1884 nt20,39■□□□□ 0,86
TY1B-BRQ12193 PUN1YLR414C 792 nt20,39■□□□□ 0,85
TY1B-BRQ12193 YLR236CYLR236C 324 nt20,38■□□□□ 0,85
TY1B-BRQ12193 RPP2BYDR382W 333 nt20,35■□□□□ 0,85
TY1B-BRQ12193 FMP45YDL222C 930 nt20,34■□□□□ 0,85
TY1B-BRQ12193 YPR011CYPR011C 981 nt20,31■□□□□ 0,84
TY1B-BRQ12193 BDH2YAL061W 1254 nt20,29■□□□□ 0,84
TY1B-BRQ12193 PTC2YER089C 1395 nt20,07■□□□□ 0,8
TY1B-BRQ12193 DSK2YMR276W 1122 nt20,06■□□□□ 0,8
TY1B-BRQ12193 UBX6YJL048C 1191 nt20■□□□□ 0,79
TY1B-BRQ12193 MRPL8YJL063C 717 nt19,94■□□□□ 0,78
TY1B-BRQ12193 LPX1YOR084W 1164 nt19,93■□□□□ 0,78
TY1B-BRQ12193 BUD23YCR047C 828 nt19,92■□□□□ 0,78
TY1B-BRQ12193 POA1YBR022W 534 nt19,92■□□□□ 0,78
TY1B-BRQ12193 YBL100CYBL100C 315 nt19,91■□□□□ 0,78
TY1B-BRQ12193 YCH1YGR203W 447 nt19,9■□□□□ 0,78
TY1B-BRQ12193 RTG1YOL067C 534 nt19,88■□□□□ 0,77
TY1B-BRQ12193 SPP1YPL138C 1062 nt19,88■□□□□ 0,77
TY1B-BRQ12193 FIS1YIL065C 468 nt19,88■□□□□ 0,77
TY1B-BRQ12193 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt19,84■□□□□ 0,77
TY1B-BRQ12193 LSM3YLR438C-A 270 nt19,8■□□□□ 0,76
TY1B-BRQ12193 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt19,77■□□□□ 0,76
TY1B-BRQ12193 YEL076CYEL076C 651 nt19,77■□□□□ 0,76
TY1B-BRQ12193 YLR464WYLR464W 651 nt19,77■□□□□ 0,76
TY1B-BRQ12193 IMP2'YIL154C 1041 nt19,72■□□□□ 0,75
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