Protein–RNA interactions for Protein: P53049

YOR1, Oligomycin resistance ATP-dependent permease YOR1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR1P53049 YML009W-BYML009W-B 477 nt33.15■■■□□ 2.9
YOR1P53049 NOP1YDL014W 984 nt32.01■■■□□ 2.71
YOR1P53049 NSR1YGR159C 1245 nt31.91■■■□□ 2.7
YOR1P53049 YKL036CYKL036C 393 nt30.3■■■□□ 2.44
YOR1P53049 YJL027CYJL027C 417 nt28.45■■■□□ 2.14
YOR1P53049 MDJ1YFL016C 1536 nt28.32■■■□□ 2.12
YOR1P53049 Q0297Q0297 156 nt28.29■■■□□ 2.12
YOR1P53049 SRX1YKL086W 384 nt28.12■■■□□ 2.09
YOR1P53049 SCS3YGL126W 1143 nt28.07■■■□□ 2.08
YOR1P53049 YCR051WYCR051W 669 nt26.89■■□□□ 1.9
YOR1P53049 YOL085CYOL085C 342 nt26.17■■□□□ 1.78
YOR1P53049 PKP1YIL042C 1185 nt26.01■■□□□ 1.75
YOR1P53049 RPP1BYDL130W 321 nt25.43■■□□□ 1.66
YOR1P53049 TRN1tP(UGG)A 72 nt25.21■■□□□ 1.63
YOR1P53049 SUF9tP(UGG)F 72 nt25.21■■□□□ 1.63
YOR1P53049 SUF8tP(UGG)H 72 nt25.21■■□□□ 1.63
YOR1P53049 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt25.21■■□□□ 1.63
YOR1P53049 SUF7tP(UGG)M 72 nt25.21■■□□□ 1.63
YOR1P53049 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt25.21■■□□□ 1.63
YOR1P53049 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt25.21■■□□□ 1.63
YOR1P53049 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt25.21■■□□□ 1.63
YOR1P53049 SUF11tP(UGG)O2 72 nt25.21■■□□□ 1.63
YOR1P53049 SCJ1YMR214W 1134 nt25.17■■□□□ 1.62
YOR1P53049 DBP2YNL112W 1641 nt25.11■■□□□ 1.61
YOR1P53049 ATS1YAL020C 1002 nt25.06■■□□□ 1.6
YOR1P53049 CCC1YLR220W 969 nt25.01■■□□□ 1.59
YOR1P53049 PET122YER153C 765 nt24.46■■□□□ 1.51
YOR1P53049 SCR1SCR1 522 nt24.13■■□□□ 1.45
YOR1P53049 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt23.97■■□□□ 1.43
YOR1P53049 RRN5YLR141W 1092 nt23.63■■□□□ 1.37
YOR1P53049 RVS167YDR388W 1449 nt23.62■■□□□ 1.37
YOR1P53049 YBR190WYBR190W 312 nt23.58■■□□□ 1.37
YOR1P53049 RSB1YOR049C 1065 nt23.49■■□□□ 1.35
YOR1P53049 RTC3YHR087W 336 nt23.28■■□□□ 1.32
YOR1P53049 YER088W-BYER088W-B 147 nt23.2■■□□□ 1.3
YOR1P53049 PST2YDR032C 597 nt23.04■■□□□ 1.28
YOR1P53049 YDJ1YNL064C 1230 nt23.01■■□□□ 1.27
YOR1P53049 SHR5YOL110W 714 nt22.98■■□□□ 1.27
YOR1P53049 GAR1YHR089C 618 nt22.66■■□□□ 1.22
YOR1P53049 YKL097CYKL097C 411 nt22.62■■□□□ 1.21
YOR1P53049 DEP1YAL013W 1218 nt22.4■■□□□ 1.18
YOR1P53049 SHU1YHL006C 453 nt22.19■■□□□ 1.14
YOR1P53049 URN1YPR152C 1398 nt22.07■■□□□ 1.12
YOR1P53049 TIR1YER011W 765 nt21.79■■□□□ 1.08
YOR1P53049 YNL208WYNL208W 600 nt21.78■■□□□ 1.08
YOR1P53049 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt21.77■■□□□ 1.08
YOR1P53049 RPN10YHR200W 807 nt21.71■■□□□ 1.07
YOR1P53049 YOR139CYOR139C 393 nt21.67■■□□□ 1.06
YOR1P53049 SRB2YHR041C 633 nt21.47■■□□□ 1.03
YOR1P53049 SSA1YAL005C 1929 nt21.46■■□□□ 1.03
YOR1P53049 OPI9YLR338W 858 nt21.46■■□□□ 1.03
YOR1P53049 SAH1YER043C 1350 nt21.35■■□□□ 1.01
YOR1P53049 NPL3YDR432W 1245 nt21.31■■□□□ 1
YOR1P53049 MNP1YGL068W 585 nt21.31■■□□□ 1
YOR1P53049 WWM1YFL010C 636 nt21.07■□□□□ 0.96
YOR1P53049 PUT4YOR348C 1884 nt21.05■□□□□ 0.96
YOR1P53049 YJR120WYJR120W 351 nt21.03■□□□□ 0.96
YOR1P53049 HOM6YJR139C 1080 nt21■□□□□ 0.95
YOR1P53049 YJR018WYJR018W 363 nt20.99■□□□□ 0.95
YOR1P53049 ARE1YCR048W 1833 nt20.94■□□□□ 0.94
YOR1P53049 YGR021WYGR021W 873 nt20.94■□□□□ 0.94
YOR1P53049 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt20.87■□□□□ 0.93
YOR1P53049 YOL037CYOL037C 354 nt20.86■□□□□ 0.93
YOR1P53049 PUN1YLR414C 792 nt20.82■□□□□ 0.92
YOR1P53049 RKM5YLR137W 1104 nt20.69■□□□□ 0.9
YOR1P53049 RPP2BYDR382W 333 nt20.68■□□□□ 0.9
YOR1P53049 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt20.59■□□□□ 0.89
YOR1P53049 IMT4tM(CAU)E 72 nt20.59■□□□□ 0.89
YOR1P53049 IMT3tM(CAU)J3 72 nt20.59■□□□□ 0.89
YOR1P53049 IMT1tM(CAU)O1 72 nt20.59■□□□□ 0.89
YOR1P53049 IMT2tM(CAU)P 72 nt20.59■□□□□ 0.89
YOR1P53049 PTC2YER089C 1395 nt20.56■□□□□ 0.88
YOR1P53049 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt20.53■□□□□ 0.88
YOR1P53049 POA1YBR022W 534 nt20.52■□□□□ 0.88
YOR1P53049 SSA3YBL075C 1950 nt20.49■□□□□ 0.87
YOR1P53049 BDH2YAL061W 1254 nt20.4■□□□□ 0.86
YOR1P53049 BUD23YCR047C 828 nt20.39■□□□□ 0.85
YOR1P53049 PUS2YGL063W 1113 nt20.34■□□□□ 0.85
YOR1P53049 YLR281CYLR281C 468 nt20.24■□□□□ 0.83
YOR1P53049 FIS1YIL065C 468 nt20.2■□□□□ 0.82
YOR1P53049 MOT3YMR070W 1473 nt20.2■□□□□ 0.82
YOR1P53049 YBL100CYBL100C 315 nt20.18■□□□□ 0.82
YOR1P53049 FPR4YLR449W 1179 nt20.17■□□□□ 0.82
YOR1P53049 WHI5YOR083W 888 nt20.16■□□□□ 0.82
YOR1P53049 NAB2YGL122C 1578 nt20.1■□□□□ 0.81
YOR1P53049 BSC6YOL137W 1494 nt20.02■□□□□ 0.8
YOR1P53049 YLR236CYLR236C 324 nt20.02■□□□□ 0.8
YOR1P53049 DAL1YIR027C 1383 nt20.01■□□□□ 0.79
YOR1P53049 LSM3YLR438C-A 270 nt20.01■□□□□ 0.79
YOR1P53049 PHO4YFR034C 939 nt20■□□□□ 0.79
YOR1P53049 FMP45YDL222C 930 nt19.98■□□□□ 0.79
YOR1P53049 INM2YDR287W 879 nt19.92■□□□□ 0.78
YOR1P53049 YPR011CYPR011C 981 nt19.89■□□□□ 0.77
YOR1P53049 FUN26YAL022C 1554 nt19.86■□□□□ 0.77
YOR1P53049 DSK2YMR276W 1122 nt19.84■□□□□ 0.77
YOR1P53049 TRM9YML014W 840 nt19.79■□□□□ 0.76
YOR1P53049 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt19.74■□□□□ 0.75
YOR1P53049 CCT6YDR188W 1641 nt19.63■□□□□ 0.73
YOR1P53049 YCH1YGR203W 447 nt19.6■□□□□ 0.73
YOR1P53049 LPX1YOR084W 1164 nt19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms