Protein–RNA interactions for Protein: P25384

TY2B-C, Transposon Ty2-C Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-CP25384 YML009W-BYML009W-B 477 nt33,57■■■□□ 2,96
TY2B-CP25384 NOP1YDL014W 984 nt32,15■■■□□ 2,74
TY2B-CP25384 NSR1YGR159C 1245 nt31,91■■■□□ 2,7
TY2B-CP25384 YKL036CYKL036C 393 nt30,91■■■□□ 2,54
TY2B-CP25384 YJL027CYJL027C 417 nt28,96■■■□□ 2,23
TY2B-CP25384 SCS3YGL126W 1143 nt28,85■■■□□ 2,21
TY2B-CP25384 Q0297Q0297 156 nt28,73■■■□□ 2,19
TY2B-CP25384 SRX1YKL086W 384 nt28,62■■■□□ 2,17
TY2B-CP25384 MDJ1YFL016C 1536 nt28,32■■■□□ 2,12
TY2B-CP25384 YCR051WYCR051W 669 nt27,27■■□□□ 1,96
TY2B-CP25384 YOL085CYOL085C 342 nt26,58■■□□□ 1,85
TY2B-CP25384 PKP1YIL042C 1185 nt26,54■■□□□ 1,84
TY2B-CP25384 SCJ1YMR214W 1134 nt26■■□□□ 1,75
TY2B-CP25384 RPP1BYDL130W 321 nt25,74■■□□□ 1,71
TY2B-CP25384 ATS1YAL020C 1002 nt25,67■■□□□ 1,7
TY2B-CP25384 TRN1tP(UGG)A 72 nt25,51■■□□□ 1,67
TY2B-CP25384 SUF9tP(UGG)F 72 nt25,51■■□□□ 1,67
TY2B-CP25384 SUF8tP(UGG)H 72 nt25,51■■□□□ 1,67
TY2B-CP25384 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt25,51■■□□□ 1,67
TY2B-CP25384 SUF7tP(UGG)M 72 nt25,51■■□□□ 1,67
TY2B-CP25384 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt25,51■■□□□ 1,67
TY2B-CP25384 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt25,51■■□□□ 1,67
TY2B-CP25384 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt25,51■■□□□ 1,67
TY2B-CP25384 SUF11tP(UGG)O2 72 nt25,51■■□□□ 1,67
TY2B-CP25384 DBP2YNL112W 1641 nt25,27■■□□□ 1,64
TY2B-CP25384 CCC1YLR220W 969 nt25,17■■□□□ 1,62
TY2B-CP25384 PET122YER153C 765 nt24,87■■□□□ 1,57
TY2B-CP25384 SCR1SCR1 522 nt24,47■■□□□ 1,51
TY2B-CP25384 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt24,26■■□□□ 1,47
TY2B-CP25384 RTC3YHR087W 336 nt24,07■■□□□ 1,44
TY2B-CP25384 RRN5YLR141W 1092 nt23,98■■□□□ 1,43
TY2B-CP25384 RSB1YOR049C 1065 nt23,94■■□□□ 1,42
TY2B-CP25384 PST2YDR032C 597 nt23,6■■□□□ 1,37
TY2B-CP25384 RVS167YDR388W 1449 nt23,57■■□□□ 1,36
TY2B-CP25384 YER088W-BYER088W-B 147 nt23,55■■□□□ 1,36
TY2B-CP25384 YBR190WYBR190W 312 nt23,35■■□□□ 1,33
TY2B-CP25384 YKL097CYKL097C 411 nt23,3■■□□□ 1,32
TY2B-CP25384 YDJ1YNL064C 1230 nt23,19■■□□□ 1,3
TY2B-CP25384 SHR5YOL110W 714 nt23,06■■□□□ 1,28
TY2B-CP25384 GAR1YHR089C 618 nt22,83■■□□□ 1,24
TY2B-CP25384 SHU1YHL006C 453 nt22,76■■□□□ 1,23
TY2B-CP25384 DEP1YAL013W 1218 nt22,51■■□□□ 1,19
TY2B-CP25384 YOR139CYOR139C 393 nt22,44■■□□□ 1,18
TY2B-CP25384 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt22,38■■□□□ 1,17
TY2B-CP25384 URN1YPR152C 1398 nt22,11■■□□□ 1,13
TY2B-CP25384 TIR1YER011W 765 nt21,94■■□□□ 1,1
TY2B-CP25384 SRB2YHR041C 633 nt21,87■■□□□ 1,09
TY2B-CP25384 NPL3YDR432W 1245 nt21,84■■□□□ 1,09
TY2B-CP25384 MNP1YGL068W 585 nt21,8■■□□□ 1,08
TY2B-CP25384 YNL208WYNL208W 600 nt21,71■■□□□ 1,07
TY2B-CP25384 SSA1YAL005C 1929 nt21,65■■□□□ 1,06
TY2B-CP25384 RPN10YHR200W 807 nt21,56■■□□□ 1,04
TY2B-CP25384 WWM1YFL010C 636 nt21,41■■□□□ 1,02
TY2B-CP25384 OPI9YLR338W 858 nt21,36■■□□□ 1,01
TY2B-CP25384 HOM6YJR139C 1080 nt21,36■■□□□ 1,01
TY2B-CP25384 SAH1YER043C 1350 nt21,29■■□□□ 1
TY2B-CP25384 YJR120WYJR120W 351 nt21,28■■□□□ 1
TY2B-CP25384 YOL037CYOL037C 354 nt21,28■■□□□ 1
TY2B-CP25384 YGR021WYGR021W 873 nt21,17■□□□□ 0,98
TY2B-CP25384 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt21,11■□□□□ 0,97
TY2B-CP25384 IMT4tM(CAU)E 72 nt21,11■□□□□ 0,97
TY2B-CP25384 IMT3tM(CAU)J3 72 nt21,11■□□□□ 0,97
TY2B-CP25384 IMT1tM(CAU)O1 72 nt21,11■□□□□ 0,97
TY2B-CP25384 IMT2tM(CAU)P 72 nt21,11■□□□□ 0,97
TY2B-CP25384 YJR018WYJR018W 363 nt20,98■□□□□ 0,95
TY2B-CP25384 RKM5YLR137W 1104 nt20,95■□□□□ 0,94
TY2B-CP25384 MOT3YMR070W 1473 nt20,85■□□□□ 0,93
TY2B-CP25384 PUS2YGL063W 1113 nt20,82■□□□□ 0,92
TY2B-CP25384 SSA3YBL075C 1950 nt20,82■□□□□ 0,92
TY2B-CP25384 ARE1YCR048W 1833 nt20,81■□□□□ 0,92
TY2B-CP25384 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt20,77■□□□□ 0,91
TY2B-CP25384 PUT4YOR348C 1884 nt20,76■□□□□ 0,91
TY2B-CP25384 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt20,75■□□□□ 0,91
TY2B-CP25384 PUN1YLR414C 792 nt20,66■□□□□ 0,9
TY2B-CP25384 YLR281CYLR281C 468 nt20,64■□□□□ 0,89
TY2B-CP25384 RPP2BYDR382W 333 nt20,59■□□□□ 0,89
TY2B-CP25384 WHI5YOR083W 888 nt20,55■□□□□ 0,88
TY2B-CP25384 YLR236CYLR236C 324 nt20,54■□□□□ 0,88
TY2B-CP25384 BDH2YAL061W 1254 nt20,52■□□□□ 0,88
TY2B-CP25384 BSC6YOL137W 1494 nt20,52■□□□□ 0,88
TY2B-CP25384 FMP45YDL222C 930 nt20,45■□□□□ 0,86
TY2B-CP25384 YPR011CYPR011C 981 nt20,44■□□□□ 0,86
TY2B-CP25384 PTC2YER089C 1395 nt20,35■□□□□ 0,85
TY2B-CP25384 POA1YBR022W 534 nt20,25■□□□□ 0,83
TY2B-CP25384 BUD23YCR047C 828 nt20,23■□□□□ 0,83
TY2B-CP25384 DSK2YMR276W 1122 nt20,21■□□□□ 0,83
TY2B-CP25384 FIS1YIL065C 468 nt20,18■□□□□ 0,82
TY2B-CP25384 YBL100CYBL100C 315 nt20,16■□□□□ 0,82
TY2B-CP25384 LPX1YOR084W 1164 nt20,08■□□□□ 0,8
TY2B-CP25384 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt20,03■□□□□ 0,8
TY2B-CP25384 UBX6YJL048C 1191 nt20■□□□□ 0,79
TY2B-CP25384 YCH1YGR203W 447 nt20■□□□□ 0,79
TY2B-CP25384 LSM3YLR438C-A 270 nt20■□□□□ 0,79
TY2B-CP25384 SPP1YPL138C 1062 nt20■□□□□ 0,79
TY2B-CP25384 MRPL8YJL063C 717 nt19,98■□□□□ 0,79
TY2B-CP25384 RTG1YOL067C 534 nt19,98■□□□□ 0,79
TY2B-CP25384 PHO4YFR034C 939 nt19,97■□□□□ 0,79
TY2B-CP25384 FPR4YLR449W 1179 nt19,93■□□□□ 0,78
TY2B-CP25384 NAB2YGL122C 1578 nt19,93■□□□□ 0,78
TY2B-CP25384 IMP2'YIL154C 1041 nt19,86■□□□□ 0,77
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