RNA–Protein interactions for RNA: YFL063W

YFL063W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YFL063W, Length 456 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFL063WYFL063W FAP1P53971 965 aa11.75□□□□□ -0.53
YFL063WYFL063W MTC1P47018 478 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
YFL063WYFL063W PRY3P47033 881 aa11.1□□□□□ -0.63
YFL063WYFL063W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
YFL063WYFL063W YCK3P39962 524 aa10.26□□□□□ -0.77
YFL063WYFL063W AAD16Q02895 342 aa10.19□□□□□ -0.78
YFL063WYFL063W PRI1P10363 409 aa10.11□□□□□ -0.79
YFL063WYFL063W DRS1P32892 752 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
YFL063WYFL063W ISW2Q08773 1120 aa9.6□□□□□ -0.87
YFL063WYFL063W RPG1P38249 964 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
YFL063WYFL063W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
YFL063WYFL063W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
YFL063WYFL063W YGL015CP33199 130 aa9.17□□□□□ -0.94
YFL063WYFL063W MRPL32P25348 183 aa9.13□□□□□ -0.95
YFL063WYFL063W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
YFL063WYFL063W SIS1P25294 352 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
YFL063WYFL063W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
YFL063WYFL063W REB1P21538 810 aa8.53□□□□□ -1.04
YFL063WYFL063W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
YFL063WYFL063W CDC27P38042 758 aa8.45□□□□□ -1.06
YFL063WYFL063W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
YFL063WYFL063W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
YFL063WYFL063W AVT3P36062 692 aa8.38□□□□□ -1.07
YFL063WYFL063W MAP2P38174 421 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YFL063WYFL063W UBP9P39967 754 aa8.32□□□□□ -1.08
YFL063WYFL063W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
YFL063WYFL063W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
YFL063WYFL063W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
YFL063WYFL063W TGL3P40308 642 aa8.06□□□□□ -1.12
YFL063WYFL063W SPT21P35209 758 aa8.03□□□□□ -1.12
YFL063WYFL063W TFC8Q12308 588 aa8.02□□□□□ -1.13
YFL063WYFL063W HOP09932 586 aa7.98□□□□□ -1.13
YFL063WYFL063W DCD1P06773 312 aa7.96□□□□□ -1.14
YFL063WYFL063W SCY1P53009 804 aa7.96□□□□□ -1.14
YFL063WYFL063W SLX5P32828 619 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
YFL063WYFL063W BCH2P36122 765 aa7.7□□□□□ -1.18
YFL063WYFL063W MST1P07236 462 aa7.6□□□□□ -1.19
YFL063WYFL063W YBL029C-AQ3E756 94 aa7.6□□□□□ -1.19
YFL063WYFL063W RIM101P33400 625 aa7.57□□□□□ -1.2
YFL063WYFL063W YOR238WQ08634 303 aa7.5□□□□□ -1.21
YFL063WYFL063W VNX1P42839 908 aa7.49□□□□□ -1.21
YFL063WYFL063W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data7.43□□□□□ -1.22not detected
YFL063WYFL063W BDF1P35817 686 aa7.43□□□□□ -1.22
YFL063WYFL063W EPS1P40557 701 aa7.43□□□□□ -1.22
YFL063WYFL063W YJL171CP46992 396 aa7.43□□□□□ -1.22
YFL063WYFL063W SPP1Q03012 353 aa7.42□□□□□ -1.22
YFL063WYFL063W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
YFL063WYFL063W FKH1P40466 484 aa7.35□□□□□ -1.23
YFL063WYFL063W RGA2Q06407 1009 aa7.32□□□□□ -1.24
YFL063WYFL063W OXP1P28273 1286 aa7.3□□□□□ -1.24
YFL063WYFL063W YAP5P40574 245 aa7.3□□□□□ -1.24
YFL063WYFL063W WSC3Q12215 556 aa7.3□□□□□ -1.24
YFL063WYFL063W TIF11P38912 153 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
YFL063WYFL063W PTP3P40048 928 aa7.29□□□□□ -1.24
YFL063WYFL063W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YFL063WYFL063W BMT6Q12291 365 aa7.21□□□□□ -1.26
YFL063WYFL063W LDB19Q12502 818 aa7.18□□□□□ -1.26
YFL063WYFL063W GTT3P39996 337 aa7.17□□□□□ -1.26
YFL063WYFL063W BBC1P47068 1157 aa7.14□□□□□ -1.27
YFL063WYFL063W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
YFL063WYFL063W RSM7P47150 247 aa7.12□□□□□ -1.27
YFL063WYFL063W IOC2Q12072 812 aa7.12□□□□□ -1.27
YFL063WYFL063W ULI1P43604 169 aa7.11□□□□□ -1.27
YFL063WYFL063W AI2P03876 854 aa7.08□□□□□ -1.28
YFL063WYFL063W TFA1P36100 482 aa7.08□□□□□ -1.28
YFL063WYFL063W MSB4Q12317 492 aa7.01□□□□□ -1.29
YFL063WYFL063W EAP1P36041 632 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
YFL063WYFL063W RTG1P32607 177 aa6.94□□□□□ -1.3
YFL063WYFL063W YLR271WQ06152 274 aa6.94□□□□□ -1.3
YFL063WYFL063W NCR1Q12200 1170 aa6.93□□□□□ -1.3
YFL063WYFL063W PIB1Q06651 286 aa6.9□□□□□ -1.3
YFL063WYFL063W SEC61P32915 480 aa6.88□□□□□ -1.31
YFL063WYFL063W TRP5P00931 707 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
YFL063WYFL063W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
YFL063WYFL063W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
YFL063WYFL063W BCK2P33306 851 aa6.85□□□□□ -1.31
YFL063WYFL063W YOL036WQ08206 761 aa6.85□□□□□ -1.31
YFL063WYFL063W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data6.85□□□□□ -1.31not detected
YFL063WYFL063W MRM1P25270 412 aa6.83□□□□□ -1.32
YFL063WYFL063W SSP1P38871 571 aa6.82□□□□□ -1.32
YFL063WYFL063W SET4P42948 560 aa6.82□□□□□ -1.32
YFL063WYFL063W RGA1P39083 1007 aa6.8□□□□□ -1.32
YFL063WYFL063W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
YFL063WYFL063W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
YFL063WYFL063W SAP30P38429 201 aa6.73□□□□□ -1.33
YFL063WYFL063W CST9Q06032 482 aa6.7□□□□□ -1.34
YFL063WYFL063W PRE3P38624 215 aa6.69□□□□□ -1.34
YFL063WYFL063W MGA2P40578 1113 aa6.69□□□□□ -1.34
YFL063WYFL063W YDL129WQ07555 291 aa6.69□□□□□ -1.34
YFL063WYFL063W DAN4P47179 1161 aa6.68□□□□□ -1.34
YFL063WYFL063W JIP4Q03361 876 aa6.68□□□□□ -1.34
YFL063WYFL063W SAM3Q08986 587 aa6.68□□□□□ -1.34
YFL063WYFL063W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data6.67□□□□□ -1.34not detected
YFL063WYFL063W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
YFL063WYFL063W RTG3P38165 486 aa6.66□□□□□ -1.34
YFL063WYFL063W DBP1P24784 617 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
YFL063WYFL063W VPS29P38759 282 aa6.63□□□□□ -1.35
YFL063WYFL063W XDJ1P39102 459 aa6.63□□□□□ -1.35
YFL063WYFL063W YFR006WP43590 535 aa6.63□□□□□ -1.35
YFL063WYFL063W ABP1P15891 592 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.9 ms