RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR321CQ04898 105 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M SVF1Q05515 481 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M SPH1Q06160 661 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M ESF1Q06344 628 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M TUS1Q06412 1307 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data3.05□□□□□ -1.92not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC16P09798 840 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M HEM1P09950 548 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL8AP17076 256 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M MAK31P23059 88 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M PWP2P25635 923 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M GPT2P36148 743 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M MSC7P38694 644 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M CIC1P38779 376 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M CSM2P40465 213 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M KRI1P42846 591 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M SGM1P47166 707 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS7BP48164 190 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M UBP15P50101 1230 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M LIF1P53150 421 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M MDM1Q01846 1127 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M FMP30Q02883 468 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS13Q07878 3144 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data3.04□□□□□ -1.92not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M SRP54P20424 541 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC8P32855 1065 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M DUR3P33413 735 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M AAP1P37898 856 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M GRS1P38088 690 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M JHD1P40034 492 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M SAD1P43589 448 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M AZR1P50080 613 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M ASE1P50275 885 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M SMD2Q06217 110 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M TFC6Q06339 672 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M YLL058WQ12198 575 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG11Q12527 1178 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M HCA4P20448 770 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC48P25694 835 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M ORC6P38826 435 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR131CP38835 850 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M TVP23P38962 199 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M ALD5P40047 520 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M TPM2P40414 161 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M VID28P40547 921 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M MCM6P53091 1017 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M HUL5P53119 910 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M YGL081WP53156 320 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M HXT17P53631 564 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M MSC2Q03455 724 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M EST2Q06163 884 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M GPI13Q07830 1017 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M DSE3Q08729 430 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M LDB19Q12502 818 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M ARP6Q12509 438 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR111WQ99210 232 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)MtW(CCA)M TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M SES1P07284 462 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M PEP3P27801 918 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M DID4P36108 232 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M BRN1P38170 754 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M AKR1P39010 764 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M FMP10P40098 244 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M RSC8P43609 557 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M ALG2P43636 503 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M PSP2P50109 593 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M FOL2P51601 243 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR273CP53329 174 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M GIS4Q04233 774 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M EMI2Q04409 500 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M GUD1Q07729 489 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M NCR1Q12200 1170 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M CIT1P00890 479 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M MET6P05694 767 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M SWI6P09959 803 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M UGA4P32837 571 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M DRE2P36152 348 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M TVP38P36164 337 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M DSF2P38213 736 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M SUL1P38359 859 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M GUA1P38625 525 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M PES4P39684 611 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M HXT13P39924 564 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M EPL1P43572 832 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M ACF4P47129 309 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M ENT3P47160 408 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M ARP5P53946 755 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
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