Protein–RNA interactions for Protein: Q05515

SVF1, Survival factor 1, yeastyeast

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SVF1Q05515 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.77■■□□□ 1.24
SVF1Q05515 NSR1YGR159C 1245 nt22.59■■□□□ 1.21
SVF1Q05515 NOP1YDL014W 984 nt22.36■■□□□ 1.17
SVF1Q05515 YKL036CYKL036C 393 nt20.8■□□□□ 0.92
SVF1Q05515 Q0297Q0297 156 nt19.67■□□□□ 0.74
SVF1Q05515 MDJ1YFL016C 1536 nt19.66■□□□□ 0.74
SVF1Q05515 SRX1YKL086W 384 nt19.53■□□□□ 0.72
SVF1Q05515 YJL027CYJL027C 417 nt19.41■□□□□ 0.7
SVF1Q05515 SCS3YGL126W 1143 nt19■□□□□ 0.63
SVF1Q05515 YCR051WYCR051W 669 nt18.43■□□□□ 0.54
SVF1Q05515 YOL085CYOL085C 342 nt18■□□□□ 0.47
SVF1Q05515 RPP1BYDL130W 321 nt17.61■□□□□ 0.41
SVF1Q05515 DBP2YNL112W 1641 nt17.58■□□□□ 0.4
SVF1Q05515 PKP1YIL042C 1185 nt17.57■□□□□ 0.4
SVF1Q05515 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.51■□□□□ 0.39
SVF1Q05515 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.51■□□□□ 0.39
SVF1Q05515 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.51■□□□□ 0.39
SVF1Q05515 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.51■□□□□ 0.39
SVF1Q05515 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.51■□□□□ 0.39
SVF1Q05515 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.51■□□□□ 0.39
SVF1Q05515 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.51■□□□□ 0.39
SVF1Q05515 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.51■□□□□ 0.39
SVF1Q05515 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.51■□□□□ 0.39
SVF1Q05515 SCJ1YMR214W 1134 nt17.29■□□□□ 0.36
SVF1Q05515 CCC1YLR220W 969 nt17.19■□□□□ 0.34
SVF1Q05515 ATS1YAL020C 1002 nt17.09■□□□□ 0.33
SVF1Q05515 YBR190WYBR190W 312 nt16.86■□□□□ 0.29
SVF1Q05515 PET122YER153C 765 nt16.73■□□□□ 0.27
SVF1Q05515 SCR1SCR1 522 nt16.67■□□□□ 0.26
SVF1Q05515 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.61■□□□□ 0.25
SVF1Q05515 RVS167YDR388W 1449 nt16.61■□□□□ 0.25
SVF1Q05515 RTC3YHR087W 336 nt16.36■□□□□ 0.21
SVF1Q05515 RRN5YLR141W 1092 nt16.28■□□□□ 0.2
SVF1Q05515 YDJ1YNL064C 1230 nt16.16■□□□□ 0.18
SVF1Q05515 SHR5YOL110W 714 nt16.1■□□□□ 0.17
SVF1Q05515 Q0182Q0182 405 nt16.07■□□□□ 0.16
SVF1Q05515 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.98■□□□□ 0.15
SVF1Q05515 RSB1YOR049C 1065 nt15.97■□□□□ 0.15
SVF1Q05515 PST2YDR032C 597 nt15.82■□□□□ 0.12
SVF1Q05515 GAR1YHR089C 618 nt15.61■□□□□ 0.09
SVF1Q05515 MOT3YMR070W 1473 nt15.46■□□□□ 0.07
SVF1Q05515 URN1YPR152C 1398 nt15.44■□□□□ 0.06
SVF1Q05515 DEP1YAL013W 1218 nt15.4■□□□□ 0.06
SVF1Q05515 RPN10YHR200W 807 nt15.35■□□□□ 0.05
SVF1Q05515 YNL208WYNL208W 600 nt15.34■□□□□ 0.05
SVF1Q05515 YKL097CYKL097C 411 nt15.27■□□□□ 0.04
SVF1Q05515 OPI9YLR338W 858 nt15.24■□□□□ 0.03
SVF1Q05515 TIR1YER011W 765 nt15.14■□□□□ 0.01
SVF1Q05515 PUT4YOR348C 1884 nt15.08■□□□□ 0.01
SVF1Q05515 SHU1YHL006C 453 nt15.06■□□□□ 0
SVF1Q05515 SAH1YER043C 1350 nt14.99□□□□□ -0.01
SVF1Q05515 SSA1YAL005C 1929 nt14.88□□□□□ -0.03
SVF1Q05515 ARE1YCR048W 1833 nt14.87□□□□□ -0.03
SVF1Q05515 PUN1YLR414C 792 nt14.81□□□□□ -0.04
SVF1Q05515 YJR018WYJR018W 363 nt14.77□□□□□ -0.05
SVF1Q05515 SSA3YBL075C 1950 nt14.69□□□□□ -0.06
SVF1Q05515 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.65□□□□□ -0.06
SVF1Q05515 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.63□□□□□ -0.07
SVF1Q05515 SRB2YHR041C 633 nt14.61□□□□□ -0.07
SVF1Q05515 YOR139CYOR139C 393 nt14.6□□□□□ -0.07
SVF1Q05515 YJR120WYJR120W 351 nt14.58□□□□□ -0.08
SVF1Q05515 RPP2BYDR382W 333 nt14.56□□□□□ -0.08
SVF1Q05515 YGR021WYGR021W 873 nt14.56□□□□□ -0.08
SVF1Q05515 POA1YBR022W 534 nt14.56□□□□□ -0.08
SVF1Q05515 PTC2YER089C 1395 nt14.5□□□□□ -0.09
SVF1Q05515 HOM6YJR139C 1080 nt14.48□□□□□ -0.09
SVF1Q05515 WWM1YFL010C 636 nt14.45□□□□□ -0.1
SVF1Q05515 NPL3YDR432W 1245 nt14.43□□□□□ -0.1
SVF1Q05515 NAB2YGL122C 1578 nt14.35□□□□□ -0.11
SVF1Q05515 YOL037CYOL037C 354 nt14.34□□□□□ -0.11
SVF1Q05515 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.33□□□□□ -0.12
SVF1Q05515 MNP1YGL068W 585 nt14.33□□□□□ -0.12
SVF1Q05515 BDH2YAL061W 1254 nt14.33□□□□□ -0.12
SVF1Q05515 INM2YDR287W 879 nt14.28□□□□□ -0.12
SVF1Q05515 BUD23YCR047C 828 nt14.26□□□□□ -0.13
SVF1Q05515 RKM5YLR137W 1104 nt14.26□□□□□ -0.13
SVF1Q05515 LSM3YLR438C-A 270 nt14.24□□□□□ -0.13
SVF1Q05515 BSC6YOL137W 1494 nt14.23□□□□□ -0.13
SVF1Q05515 DAL1YIR027C 1383 nt14.2□□□□□ -0.14
SVF1Q05515 FIS1YIL065C 468 nt14.14□□□□□ -0.15
SVF1Q05515 YBL100CYBL100C 315 nt14.11□□□□□ -0.15
SVF1Q05515 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.05□□□□□ -0.16
SVF1Q05515 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.05□□□□□ -0.16
SVF1Q05515 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.05□□□□□ -0.16
SVF1Q05515 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.05□□□□□ -0.16
SVF1Q05515 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.05□□□□□ -0.16
SVF1Q05515 PHO4YFR034C 939 nt14.03□□□□□ -0.16
SVF1Q05515 FPR4YLR449W 1179 nt14.03□□□□□ -0.16
SVF1Q05515 TRM9YML014W 840 nt13.99□□□□□ -0.17
SVF1Q05515 YLR281CYLR281C 468 nt13.96□□□□□ -0.17
SVF1Q05515 FUN26YAL022C 1554 nt13.96□□□□□ -0.18
SVF1Q05515 CCT6YDR188W 1641 nt13.88□□□□□ -0.19
SVF1Q05515 WHI5YOR083W 888 nt13.83□□□□□ -0.2
SVF1Q05515 PUS2YGL063W 1113 nt13.82□□□□□ -0.2
SVF1Q05515 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SVF1Q05515 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SVF1Q05515 YPS1YLR120C 1710 nt13.7□□□□□ -0.22
SVF1Q05515 ALF1YNL148C 765 nt13.69□□□□□ -0.22
SVF1Q05515 YDR095CYDR095C 411 nt13.68□□□□□ -0.22
SVF1Q05515 IMP2'YIL154C 1041 nt13.66□□□□□ -0.22
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