Protein–RNA interactions for Protein: Q12509

ARP6, Actin-like protein ARP6, yeastyeast

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARP6Q12509 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.07■■□□□ 1.28
ARP6Q12509 NSR1YGR159C 1245 nt22.75■■□□□ 1.23
ARP6Q12509 NOP1YDL014W 984 nt22.47■■□□□ 1.19
ARP6Q12509 YKL036CYKL036C 393 nt20.91■□□□□ 0.94
ARP6Q12509 MDJ1YFL016C 1536 nt20.07■□□□□ 0.8
ARP6Q12509 Q0297Q0297 156 nt19.74■□□□□ 0.75
ARP6Q12509 SRX1YKL086W 384 nt19.64■□□□□ 0.73
ARP6Q12509 YJL027CYJL027C 417 nt19.57■□□□□ 0.72
ARP6Q12509 SCS3YGL126W 1143 nt19.14■□□□□ 0.65
ARP6Q12509 YCR051WYCR051W 669 nt18.68■□□□□ 0.58
ARP6Q12509 YOL085CYOL085C 342 nt18.14■□□□□ 0.49
ARP6Q12509 PKP1YIL042C 1185 nt17.87■□□□□ 0.45
ARP6Q12509 DBP2YNL112W 1641 nt17.83■□□□□ 0.45
ARP6Q12509 RPP1BYDL130W 321 nt17.72■□□□□ 0.43
ARP6Q12509 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.65■□□□□ 0.42
ARP6Q12509 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.65■□□□□ 0.42
ARP6Q12509 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.65■□□□□ 0.42
ARP6Q12509 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.65■□□□□ 0.42
ARP6Q12509 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.65■□□□□ 0.42
ARP6Q12509 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.65■□□□□ 0.42
ARP6Q12509 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.65■□□□□ 0.42
ARP6Q12509 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.65■□□□□ 0.42
ARP6Q12509 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.65■□□□□ 0.42
ARP6Q12509 CCC1YLR220W 969 nt17.54■□□□□ 0.4
ARP6Q12509 ATS1YAL020C 1002 nt17.19■□□□□ 0.34
ARP6Q12509 SCJ1YMR214W 1134 nt17.13■□□□□ 0.33
ARP6Q12509 YBR190WYBR190W 312 nt17.03■□□□□ 0.32
ARP6Q12509 PET122YER153C 765 nt16.93■□□□□ 0.3
ARP6Q12509 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.78■□□□□ 0.28
ARP6Q12509 SCR1SCR1 522 nt16.76■□□□□ 0.27
ARP6Q12509 RVS167YDR388W 1449 nt16.74■□□□□ 0.27
ARP6Q12509 RTC3YHR087W 336 nt16.69■□□□□ 0.26
ARP6Q12509 RRN5YLR141W 1092 nt16.48■□□□□ 0.23
ARP6Q12509 SHR5YOL110W 714 nt16.22■□□□□ 0.19
ARP6Q12509 YDJ1YNL064C 1230 nt16.21■□□□□ 0.19
ARP6Q12509 RSB1YOR049C 1065 nt16.17■□□□□ 0.18
ARP6Q12509 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.16■□□□□ 0.18
ARP6Q12509 PST2YDR032C 597 nt15.9■□□□□ 0.14
ARP6Q12509 GAR1YHR089C 618 nt15.86■□□□□ 0.13
ARP6Q12509 DEP1YAL013W 1218 nt15.77■□□□□ 0.12
ARP6Q12509 URN1YPR152C 1398 nt15.68■□□□□ 0.1
ARP6Q12509 YNL208WYNL208W 600 nt15.48■□□□□ 0.07
ARP6Q12509 RPN10YHR200W 807 nt15.44■□□□□ 0.06
ARP6Q12509 OPI9YLR338W 858 nt15.41■□□□□ 0.06
ARP6Q12509 PUT4YOR348C 1884 nt15.35■□□□□ 0.05
ARP6Q12509 YKL097CYKL097C 411 nt15.33■□□□□ 0.04
ARP6Q12509 TIR1YER011W 765 nt15.3■□□□□ 0.04
ARP6Q12509 SAH1YER043C 1350 nt15.3■□□□□ 0.04
ARP6Q12509 SHU1YHL006C 453 nt15.21■□□□□ 0.03
ARP6Q12509 ARE1YCR048W 1833 nt15.14■□□□□ 0.01
ARP6Q12509 SSA1YAL005C 1929 nt15.11■□□□□ 0.01
ARP6Q12509 YJR018WYJR018W 363 nt14.97□□□□□ -0.01
ARP6Q12509 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.97□□□□□ -0.01
ARP6Q12509 SRB2YHR041C 633 nt14.93□□□□□ -0.02
ARP6Q12509 PUN1YLR414C 792 nt14.93□□□□□ -0.02
ARP6Q12509 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.91□□□□□ -0.02
ARP6Q12509 POA1YBR022W 534 nt14.91□□□□□ -0.02
ARP6Q12509 YJR120WYJR120W 351 nt14.8□□□□□ -0.04
ARP6Q12509 PTC2YER089C 1395 nt14.77□□□□□ -0.04
ARP6Q12509 YOR139CYOR139C 393 nt14.72□□□□□ -0.05
ARP6Q12509 WWM1YFL010C 636 nt14.69□□□□□ -0.06
ARP6Q12509 RPP2BYDR382W 333 nt14.68□□□□□ -0.06
ARP6Q12509 BUD23YCR047C 828 nt14.61□□□□□ -0.07
ARP6Q12509 SSA3YBL075C 1950 nt14.6□□□□□ -0.07
ARP6Q12509 YGR021WYGR021W 873 nt14.58□□□□□ -0.08
ARP6Q12509 HOM6YJR139C 1080 nt14.58□□□□□ -0.08
ARP6Q12509 MNP1YGL068W 585 nt14.56□□□□□ -0.08
ARP6Q12509 NAB2YGL122C 1578 nt14.52□□□□□ -0.08
ARP6Q12509 BSC6YOL137W 1494 nt14.52□□□□□ -0.08
ARP6Q12509 NPL3YDR432W 1245 nt14.52□□□□□ -0.09
ARP6Q12509 BDH2YAL061W 1254 nt14.44□□□□□ -0.1
ARP6Q12509 INM2YDR287W 879 nt14.4□□□□□ -0.1
ARP6Q12509 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.39□□□□□ -0.11
ARP6Q12509 FPR4YLR449W 1179 nt14.38□□□□□ -0.11
ARP6Q12509 DAL1YIR027C 1383 nt14.37□□□□□ -0.11
ARP6Q12509 RKM5YLR137W 1104 nt14.37□□□□□ -0.11
ARP6Q12509 FIS1YIL065C 468 nt14.33□□□□□ -0.12
ARP6Q12509 YOL037CYOL037C 354 nt14.32□□□□□ -0.12
ARP6Q12509 YBL100CYBL100C 315 nt14.29□□□□□ -0.12
ARP6Q12509 LSM3YLR438C-A 270 nt14.28□□□□□ -0.12
ARP6Q12509 PHO4YFR034C 939 nt14.23□□□□□ -0.13
ARP6Q12509 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.15□□□□□ -0.14
ARP6Q12509 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.15□□□□□ -0.14
ARP6Q12509 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.15□□□□□ -0.14
ARP6Q12509 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.15□□□□□ -0.14
ARP6Q12509 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.15□□□□□ -0.14
ARP6Q12509 TRM9YML014W 840 nt14.15□□□□□ -0.14
ARP6Q12509 FUN26YAL022C 1554 nt14.14□□□□□ -0.15
ARP6Q12509 YLR281CYLR281C 468 nt14.04□□□□□ -0.16
ARP6Q12509 CCT6YDR188W 1641 nt13.98□□□□□ -0.17
ARP6Q12509 PUS2YGL063W 1113 nt13.98□□□□□ -0.17
ARP6Q12509 WHI5YOR083W 888 nt13.98□□□□□ -0.17
ARP6Q12509 YPS1YLR120C 1710 nt13.89□□□□□ -0.19
ARP6Q12509 ALF1YNL148C 765 nt13.88□□□□□ -0.19
ARP6Q12509 YDR095CYDR095C 411 nt13.82□□□□□ -0.2
ARP6Q12509 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.82□□□□□ -0.2
ARP6Q12509 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.82□□□□□ -0.2
ARP6Q12509 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.8□□□□□ -0.2
ARP6Q12509 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.73□□□□□ -0.21
ARP6Q12509 YPR011CYPR011C 981 nt13.73□□□□□ -0.21
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