RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR321CQ04898 105 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J SVF1Q05515 481 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J SPH1Q06160 661 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J ESF1Q06344 628 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J TUS1Q06412 1307 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data3.05□□□□□ -1.92not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC16P09798 840 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J HEM1P09950 548 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL8AP17076 256 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J MAK31P23059 88 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J PWP2P25635 923 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J GPT2P36148 743 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J MSC7P38694 644 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J CIC1P38779 376 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J CSM2P40465 213 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J KRI1P42846 591 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J SGM1P47166 707 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS7BP48164 190 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J UBP15P50101 1230 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J LIF1P53150 421 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J MDM1Q01846 1127 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J FMP30Q02883 468 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS13Q07878 3144 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data3.04□□□□□ -1.92not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J SRP54P20424 541 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC8P32855 1065 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J DUR3P33413 735 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J AAP1P37898 856 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J GRS1P38088 690 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J JHD1P40034 492 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J SAD1P43589 448 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J AZR1P50080 613 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J ASE1P50275 885 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J SMD2Q06217 110 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J TFC6Q06339 672 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J YLL058WQ12198 575 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG11Q12527 1178 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J HCA4P20448 770 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC48P25694 835 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J ORC6P38826 435 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR131CP38835 850 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J TVP23P38962 199 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J ALD5P40047 520 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J TPM2P40414 161 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J VID28P40547 921 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J MCM6P53091 1017 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J HUL5P53119 910 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL081WP53156 320 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J HXT17P53631 564 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J MSC2Q03455 724 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J EST2Q06163 884 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J GPI13Q07830 1017 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J DSE3Q08729 430 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J LDB19Q12502 818 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J ARP6Q12509 438 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR111WQ99210 232 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J SES1P07284 462 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J PEP3P27801 918 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J DID4P36108 232 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J BRN1P38170 754 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J AKR1P39010 764 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J FMP10P40098 244 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J RSC8P43609 557 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J ALG2P43636 503 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J PSP2P50109 593 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J FOL2P51601 243 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR273CP53329 174 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J GIS4Q04233 774 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J EMI2Q04409 500 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J GUD1Q07729 489 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J NCR1Q12200 1170 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J CIT1P00890 479 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J MET6P05694 767 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J SWI6P09959 803 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J UGA4P32837 571 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J DRE2P36152 348 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J TVP38P36164 337 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J DSF2P38213 736 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J SUL1P38359 859 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J GUA1P38625 525 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J PES4P39684 611 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J HXT13P39924 564 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J EPL1P43572 832 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J ACF4P47129 309 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J ENT3P47160 408 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J ARP5P53946 755 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
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