RNA–Protein interactions for RNA: YML080W

DUS1, Transcript of Dihydrouridine synthase, yeast

Gene DUS1, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DUS1	YML080W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	MDL2	P33311	773 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	PES4	P39684	611 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	PCI8	P40512	444 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	YPL260W	Q08977	551 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	YOR111W	Q99210	232 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	FLO1	P32768	1537 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	ALG1	P16661	449 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	DAK2	P43550	591 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	YGL138C	P53122	345 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	RTC4	P53850	401 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	CEP3	P40969	608 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	APL6	P46682	809 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	VPS75	P53853	264 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	MMR1	Q06324	491 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	TIP41	Q12199	356 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	PHO13	P19881	312 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	RIT1	P23796	513 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	PXL1	P36166	706 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	ERT1	P38140	529 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	PSY4	P38193	441 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	TCD1	P38756	429 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	CSM2	P40465	213 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	PTC5	Q12511	572 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DUS1	YML080W	ARG82	P07250	355 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	PET111	P08468	800 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	VID27	P40157	782 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	CSC1	Q06538	782 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	GRX6	Q12438	231 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	HIR1	P32479	840 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	YOR296W	Q08748	1289 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	HKR1	P41809	1802 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	UGA2	P38067	497 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	YBL086C	P38177	466 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	BCD1	P38772	366 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	YCG1	Q06680	1035 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	TMA16	Q08687	178 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	PMD1	P32634	1753 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	SAP190	P36123	1033 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.61	□□□□□ -0.55	not detected
DUS1	YML080W	RET3	P53600	189 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	MNR2	P35724	969 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	YKL222C	P35995	705 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	SET4	P42948	560 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	ALF1	P53904	254 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	DSE3	Q08729	430 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	VPS8	P39702	1274 aa		11.59	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	PUS6	P53294	404 aa		11.59	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	NSG2	P53898	299 aa		11.59	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	COG4	Q06096	861 aa		11.59	□□□□□ -0.55
DUS1	YML080W	FOB1	O13329	566 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	CIT1	P00890	479 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	LYS14	P40971	790 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	THI6	P41835	540 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	STR2	P47164	639 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	TFC8	Q12308	588 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	VPS60	Q03390	229 aa		11.57	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	SKG3	Q06315	1026 aa		11.57	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	STE11	P23561	717 aa		11.56	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	PRE8	P23639	250 aa		11.56	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	SEC20	P28791	383 aa		11.56	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	VTC2	P43585	828 aa		11.56	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	YGR153W	P48238	217 aa		11.56	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	AFT2	Q08957	416 aa		11.56	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	PCL8	Q08966	492 aa		11.56	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	SFI1	Q12369	946 aa		11.56	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	EFM2	P38347	419 aa		11.55	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	MDM1	Q01846	1127 aa		11.55	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56

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