Protein–RNA interactions for Protein: Q06538

CSC1, Calcium permeable stress-gated cation channel 1, yeastyeast

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Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSC1Q06538 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.29■■□□□ 1.32
CSC1Q06538 NSR1YGR159C 1245 nt23.02■■□□□ 1.28
CSC1Q06538 NOP1YDL014W 984 nt22.77■■□□□ 1.24
CSC1Q06538 YKL036CYKL036C 393 nt21.32■■□□□ 1
CSC1Q06538 MDJ1YFL016C 1536 nt20.5■□□□□ 0.87
CSC1Q06538 Q0297Q0297 156 nt20.02■□□□□ 0.8
CSC1Q06538 YJL027CYJL027C 417 nt19.98■□□□□ 0.79
CSC1Q06538 SRX1YKL086W 384 nt19.88■□□□□ 0.77
CSC1Q06538 SCS3YGL126W 1143 nt19.57■□□□□ 0.72
CSC1Q06538 YCR051WYCR051W 669 nt18.92■□□□□ 0.62
CSC1Q06538 YOL085CYOL085C 342 nt18.46■□□□□ 0.55
CSC1Q06538 PKP1YIL042C 1185 nt18.15■□□□□ 0.5
CSC1Q06538 DBP2YNL112W 1641 nt18.15■□□□□ 0.5
CSC1Q06538 RPP1BYDL130W 321 nt17.98■□□□□ 0.47
CSC1Q06538 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.78■□□□□ 0.44
CSC1Q06538 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.78■□□□□ 0.44
CSC1Q06538 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.78■□□□□ 0.44
CSC1Q06538 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.78■□□□□ 0.44
CSC1Q06538 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.78■□□□□ 0.44
CSC1Q06538 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.78■□□□□ 0.44
CSC1Q06538 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.78■□□□□ 0.44
CSC1Q06538 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.78■□□□□ 0.44
CSC1Q06538 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.78■□□□□ 0.44
CSC1Q06538 SCJ1YMR214W 1134 nt17.73■□□□□ 0.43
CSC1Q06538 CCC1YLR220W 969 nt17.64■□□□□ 0.41
CSC1Q06538 ATS1YAL020C 1002 nt17.6■□□□□ 0.41
CSC1Q06538 YBR190WYBR190W 312 nt17.52■□□□□ 0.4
CSC1Q06538 PET122YER153C 765 nt17.14■□□□□ 0.33
CSC1Q06538 RTC3YHR087W 336 nt17.08■□□□□ 0.32
CSC1Q06538 SCR1SCR1 522 nt17.06■□□□□ 0.32
CSC1Q06538 RVS167YDR388W 1449 nt16.96■□□□□ 0.31
CSC1Q06538 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.94■□□□□ 0.3
CSC1Q06538 RRN5YLR141W 1092 nt16.69■□□□□ 0.26
CSC1Q06538 RSB1YOR049C 1065 nt16.45■□□□□ 0.22
CSC1Q06538 SHR5YOL110W 714 nt16.39■□□□□ 0.21
CSC1Q06538 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.37■□□□□ 0.21
CSC1Q06538 YDJ1YNL064C 1230 nt16.37■□□□□ 0.21
CSC1Q06538 PST2YDR032C 597 nt16.23■□□□□ 0.19
CSC1Q06538 PUT4YOR348C 1884 nt15.99■□□□□ 0.15
CSC1Q06538 URN1YPR152C 1398 nt15.99■□□□□ 0.15
CSC1Q06538 GAR1YHR089C 618 nt15.98■□□□□ 0.15
CSC1Q06538 DEP1YAL013W 1218 nt15.94■□□□□ 0.14
CSC1Q06538 OPI9YLR338W 858 nt15.8■□□□□ 0.12
CSC1Q06538 YKL097CYKL097C 411 nt15.78■□□□□ 0.12
CSC1Q06538 RPN10YHR200W 807 nt15.71■□□□□ 0.11
CSC1Q06538 SAH1YER043C 1350 nt15.7■□□□□ 0.1
CSC1Q06538 YNL208WYNL208W 600 nt15.69■□□□□ 0.1
CSC1Q06538 ARE1YCR048W 1833 nt15.67■□□□□ 0.1
CSC1Q06538 Q0182Q0182 405 nt15.55■□□□□ 0.08
CSC1Q06538 SHU1YHL006C 453 nt15.5■□□□□ 0.07
CSC1Q06538 MOT3YMR070W 1473 nt15.46■□□□□ 0.06
CSC1Q06538 POA1YBR022W 534 nt15.45■□□□□ 0.06
CSC1Q06538 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.44■□□□□ 0.06
CSC1Q06538 TIR1YER011W 765 nt15.41■□□□□ 0.06
CSC1Q06538 YGR139WYGR139W 339 nt15.31■□□□□ 0.04
CSC1Q06538 PUN1YLR414C 792 nt15.31■□□□□ 0.04
CSC1Q06538 YJR018WYJR018W 363 nt15.25■□□□□ 0.03
CSC1Q06538 SSA1YAL005C 1929 nt15.18■□□□□ 0.02
CSC1Q06538 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.17■□□□□ 0.02
CSC1Q06538 BSC6YOL137W 1494 nt15.14■□□□□ 0.01
CSC1Q06538 PTC2YER089C 1395 nt15.13■□□□□ 0.01
CSC1Q06538 YOR139CYOR139C 393 nt15.08■□□□□ 0
CSC1Q06538 SSA3YBL075C 1950 nt15.07■□□□□ 0
CSC1Q06538 BUD23YCR047C 828 nt15.06■□□□□ 0
CSC1Q06538 YJR120WYJR120W 351 nt15.05■□□□□ -0
CSC1Q06538 SRB2YHR041C 633 nt14.97□□□□□ -0.01
CSC1Q06538 NAB2YGL122C 1578 nt14.95□□□□□ -0.02
CSC1Q06538 NPL3YDR432W 1245 nt14.9□□□□□ -0.02
CSC1Q06538 RPP2BYDR382W 333 nt14.88□□□□□ -0.03
CSC1Q06538 YGR021WYGR021W 873 nt14.81□□□□□ -0.04
CSC1Q06538 WWM1YFL010C 636 nt14.8□□□□□ -0.04
CSC1Q06538 HOM6YJR139C 1080 nt14.78□□□□□ -0.04
CSC1Q06538 MNP1YGL068W 585 nt14.77□□□□□ -0.05
CSC1Q06538 FIS1YIL065C 468 nt14.76□□□□□ -0.05
CSC1Q06538 DAL1YIR027C 1383 nt14.74□□□□□ -0.05
CSC1Q06538 INM2YDR287W 879 nt14.72□□□□□ -0.05
CSC1Q06538 FPR4YLR449W 1179 nt14.66□□□□□ -0.06
CSC1Q06538 YOL037CYOL037C 354 nt14.64□□□□□ -0.07
CSC1Q06538 BDH2YAL061W 1254 nt14.62□□□□□ -0.07
CSC1Q06538 PHO4YFR034C 939 nt14.61□□□□□ -0.07
CSC1Q06538 RKM5YLR137W 1104 nt14.57□□□□□ -0.08
CSC1Q06538 NME1NME1 340 nt14.56□□□□□ -0.08
CSC1Q06538 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.55□□□□□ -0.08
CSC1Q06538 YBL100CYBL100C 315 nt14.55□□□□□ -0.08
CSC1Q06538 SPT5YML010W 3192 nt14.55□□□□□ -0.08
CSC1Q06538 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.47□□□□□ -0.09
CSC1Q06538 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.47□□□□□ -0.09
CSC1Q06538 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.47□□□□□ -0.09
CSC1Q06538 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.47□□□□□ -0.09
CSC1Q06538 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.47□□□□□ -0.09
CSC1Q06538 LSM3YLR438C-A 270 nt14.42□□□□□ -0.1
CSC1Q06538 FUN26YAL022C 1554 nt14.39□□□□□ -0.11
CSC1Q06538 YPS1YLR120C 1710 nt14.37□□□□□ -0.11
CSC1Q06538 TRM9YML014W 840 nt14.33□□□□□ -0.12
CSC1Q06538 YLR281CYLR281C 468 nt14.28□□□□□ -0.12
CSC1Q06538 YDR095CYDR095C 411 nt14.27□□□□□ -0.13
CSC1Q06538 PUS2YGL063W 1113 nt14.27□□□□□ -0.13
CSC1Q06538 MEP2YNL142W 1500 nt14.24□□□□□ -0.13
CSC1Q06538 CCT6YDR188W 1641 nt14.22□□□□□ -0.13
CSC1Q06538 WHI5YOR083W 888 nt14.19□□□□□ -0.14
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