Protein–RNA interactions for Protein: P36166

PXL1, Paxillin-like protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PXL1P36166 NSR1YGR159C 1245 nt22.03■■□□□ 1.12
PXL1P36166 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.02■■□□□ 1.12
PXL1P36166 NOP1YDL014W 984 nt21.08■□□□□ 0.97
PXL1P36166 MDJ1YFL016C 1536 nt20.12■□□□□ 0.81
PXL1P36166 YKL036CYKL036C 393 nt19.22■□□□□ 0.67
PXL1P36166 SRX1YKL086W 384 nt18.46■□□□□ 0.55
PXL1P36166 YJL027CYJL027C 417 nt18.42■□□□□ 0.54
PXL1P36166 Q0297Q0297 156 nt18.35■□□□□ 0.53
PXL1P36166 YCR051WYCR051W 669 nt17.62■□□□□ 0.41
PXL1P36166 DBP2YNL112W 1641 nt17.6■□□□□ 0.41
PXL1P36166 SCS3YGL126W 1143 nt17.46■□□□□ 0.39
PXL1P36166 YBR190WYBR190W 312 nt17.06■□□□□ 0.32
PXL1P36166 CCC1YLR220W 969 nt16.95■□□□□ 0.3
PXL1P36166 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.92■□□□□ 0.3
PXL1P36166 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.92■□□□□ 0.3
PXL1P36166 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.92■□□□□ 0.3
PXL1P36166 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.92■□□□□ 0.3
PXL1P36166 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.92■□□□□ 0.3
PXL1P36166 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.92■□□□□ 0.3
PXL1P36166 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.92■□□□□ 0.3
PXL1P36166 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.92■□□□□ 0.3
PXL1P36166 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.92■□□□□ 0.3
PXL1P36166 RTC3YHR087W 336 nt16.82■□□□□ 0.28
PXL1P36166 YOL085CYOL085C 342 nt16.69■□□□□ 0.26
PXL1P36166 PKP1YIL042C 1185 nt16.65■□□□□ 0.26
PXL1P36166 RPP1BYDL130W 321 nt16.51■□□□□ 0.23
PXL1P36166 SCJ1YMR214W 1134 nt16.34■□□□□ 0.21
PXL1P36166 RVS167YDR388W 1449 nt16.32■□□□□ 0.2
PXL1P36166 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.94■□□□□ 0.14
PXL1P36166 PET122YER153C 765 nt15.92■□□□□ 0.14
PXL1P36166 PUT4YOR348C 1884 nt15.84■□□□□ 0.13
PXL1P36166 SHR5YOL110W 714 nt15.69■□□□□ 0.1
PXL1P36166 SSA3YBL075C 1950 nt15.64■□□□□ 0.09
PXL1P36166 ATS1YAL020C 1002 nt15.62■□□□□ 0.09
PXL1P36166 DEP1YAL013W 1218 nt15.61■□□□□ 0.09
PXL1P36166 URN1YPR152C 1398 nt15.58■□□□□ 0.08
PXL1P36166 SCR1SCR1 522 nt15.51■□□□□ 0.07
PXL1P36166 SAH1YER043C 1350 nt15.48■□□□□ 0.07
PXL1P36166 ARE1YCR048W 1833 nt15.47■□□□□ 0.07
PXL1P36166 RRN5YLR141W 1092 nt15.44■□□□□ 0.06
PXL1P36166 POA1YBR022W 534 nt15.42■□□□□ 0.06
PXL1P36166 OPI9YLR338W 858 nt15.35■□□□□ 0.05
PXL1P36166 YDJ1YNL064C 1230 nt15.31■□□□□ 0.04
PXL1P36166 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.3■□□□□ 0.04
PXL1P36166 GAR1YHR089C 618 nt15.22■□□□□ 0.03
PXL1P36166 BSC6YOL137W 1494 nt15.1■□□□□ 0.01
PXL1P36166 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.1■□□□□ 0.01
PXL1P36166 RPN10YHR200W 807 nt15.1■□□□□ 0.01
PXL1P36166 YNL208WYNL208W 600 nt15.1■□□□□ 0.01
PXL1P36166 RSB1YOR049C 1065 nt15□□□□□ -0.01
PXL1P36166 BUD23YCR047C 828 nt14.98□□□□□ -0.01
PXL1P36166 PTC2YER089C 1395 nt14.87□□□□□ -0.03
PXL1P36166 PUN1YLR414C 792 nt14.84□□□□□ -0.03
PXL1P36166 YJR018WYJR018W 363 nt14.81□□□□□ -0.04
PXL1P36166 TIR1YER011W 765 nt14.65□□□□□ -0.06
PXL1P36166 NAB2YGL122C 1578 nt14.62□□□□□ -0.07
PXL1P36166 SSA1YAL005C 1929 nt14.61□□□□□ -0.07
PXL1P36166 YJR120WYJR120W 351 nt14.58□□□□□ -0.08
PXL1P36166 SPT5YML010W 3192 nt14.56□□□□□ -0.08
PXL1P36166 FPR4YLR449W 1179 nt14.5□□□□□ -0.09
PXL1P36166 PST2YDR032C 597 nt14.45□□□□□ -0.1
PXL1P36166 SRB2YHR041C 633 nt14.44□□□□□ -0.1
PXL1P36166 FIS1YIL065C 468 nt14.42□□□□□ -0.1
PXL1P36166 DAL1YIR027C 1383 nt14.37□□□□□ -0.11
PXL1P36166 RPP2BYDR382W 333 nt14.33□□□□□ -0.12
PXL1P36166 PHO4YFR034C 939 nt14.28□□□□□ -0.12
PXL1P36166 SSA4YER103W 1929 nt14.25□□□□□ -0.13
PXL1P36166 INM2YDR287W 879 nt14.24□□□□□ -0.13
PXL1P36166 MEP2YNL142W 1500 nt14.15□□□□□ -0.14
PXL1P36166 YBL100CYBL100C 315 nt14.12□□□□□ -0.15
PXL1P36166 YPS1YLR120C 1710 nt14.1□□□□□ -0.15
PXL1P36166 DCW1YKL046C 1350 nt14.06□□□□□ -0.16
PXL1P36166 WWM1YFL010C 636 nt14.04□□□□□ -0.16
PXL1P36166 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.03□□□□□ -0.16
PXL1P36166 BDH2YAL061W 1254 nt14□□□□□ -0.17
PXL1P36166 FUN26YAL022C 1554 nt13.96□□□□□ -0.18
PXL1P36166 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.94□□□□□ -0.18
PXL1P36166 YDR095CYDR095C 411 nt13.93□□□□□ -0.18
PXL1P36166 YKL097CYKL097C 411 nt13.91□□□□□ -0.18
PXL1P36166 SHU1YHL006C 453 nt13.89□□□□□ -0.19
PXL1P36166 TRM9YML014W 840 nt13.84□□□□□ -0.19
PXL1P36166 ALF1YNL148C 765 nt13.81□□□□□ -0.2
PXL1P36166 CAC2YML102W 1407 nt13.78□□□□□ -0.2
PXL1P36166 EMI2YDR516C 1503 nt13.78□□□□□ -0.2
PXL1P36166 PTP1YDL230W 1008 nt13.75□□□□□ -0.21
PXL1P36166 BDF1YLR399C 2061 nt13.7□□□□□ -0.22
PXL1P36166 LSM3YLR438C-A 270 nt13.69□□□□□ -0.22
PXL1P36166 RPP2AYOL039W 321 nt13.69□□□□□ -0.22
PXL1P36166 MNP1YGL068W 585 nt13.68□□□□□ -0.22
PXL1P36166 HOM6YJR139C 1080 nt13.66□□□□□ -0.22
PXL1P36166 CCT6YDR188W 1641 nt13.65□□□□□ -0.22
PXL1P36166 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.63□□□□□ -0.23
PXL1P36166 YGR021WYGR021W 873 nt13.62□□□□□ -0.23
PXL1P36166 YBR220CYBR220C 1683 nt13.62□□□□□ -0.23
PXL1P36166 YDL221WYDL221W 552 nt13.61□□□□□ -0.23
PXL1P36166 YMR090WYMR090W 684 nt13.58□□□□□ -0.24
PXL1P36166 SIS1YNL007C 1059 nt13.58□□□□□ -0.24
PXL1P36166 ART5YGR068C 1761 nt13.53□□□□□ -0.24
PXL1P36166 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.52□□□□□ -0.25
PXL1P36166 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms