Protein–RNA interactions for Protein: Q12369

SFI1, Protein SFI1, yeastyeast

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SFI1Q12369 NSR1YGR159C 1245 nt21.42■■□□□ 1.02
SFI1Q12369 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.89■□□□□ 0.93
SFI1Q12369 NOP1YDL014W 984 nt20.19■□□□□ 0.82
SFI1Q12369 MDJ1YFL016C 1536 nt19.71■□□□□ 0.75
SFI1Q12369 YKL036CYKL036C 393 nt18.74■□□□□ 0.59
SFI1Q12369 YJL027CYJL027C 417 nt18.09■□□□□ 0.49
SFI1Q12369 Q0297Q0297 156 nt17.68■□□□□ 0.42
SFI1Q12369 SRX1YKL086W 384 nt17.6■□□□□ 0.41
SFI1Q12369 DBP2YNL112W 1641 nt17.18■□□□□ 0.34
SFI1Q12369 SCS3YGL126W 1143 nt17.08■□□□□ 0.32
SFI1Q12369 YBR190WYBR190W 312 nt17■□□□□ 0.31
SFI1Q12369 SSA3YBL075C 1950 nt16.77■□□□□ 0.28
SFI1Q12369 YCR051WYCR051W 669 nt16.71■□□□□ 0.27
SFI1Q12369 RTC3YHR087W 336 nt16.53■□□□□ 0.24
SFI1Q12369 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.28■□□□□ 0.2
SFI1Q12369 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.28■□□□□ 0.2
SFI1Q12369 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.28■□□□□ 0.2
SFI1Q12369 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.28■□□□□ 0.2
SFI1Q12369 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.28■□□□□ 0.2
SFI1Q12369 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.28■□□□□ 0.2
SFI1Q12369 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.28■□□□□ 0.2
SFI1Q12369 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.28■□□□□ 0.2
SFI1Q12369 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.28■□□□□ 0.2
SFI1Q12369 YOL085CYOL085C 342 nt16.2■□□□□ 0.18
SFI1Q12369 CCC1YLR220W 969 nt16.05■□□□□ 0.16
SFI1Q12369 PUT4YOR348C 1884 nt16.03■□□□□ 0.16
SFI1Q12369 RVS167YDR388W 1449 nt15.92■□□□□ 0.14
SFI1Q12369 PKP1YIL042C 1185 nt15.91■□□□□ 0.14
SFI1Q12369 RPP1BYDL130W 321 nt15.86■□□□□ 0.13
SFI1Q12369 SCJ1YMR214W 1134 nt15.74■□□□□ 0.11
SFI1Q12369 ARE1YCR048W 1833 nt15.51■□□□□ 0.07
SFI1Q12369 POA1YBR022W 534 nt15.42■□□□□ 0.06
SFI1Q12369 ATS1YAL020C 1002 nt15.33■□□□□ 0.04
SFI1Q12369 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.28■□□□□ 0.04
SFI1Q12369 SAH1YER043C 1350 nt15.26■□□□□ 0.03
SFI1Q12369 BSC6YOL137W 1494 nt15.25■□□□□ 0.03
SFI1Q12369 URN1YPR152C 1398 nt15.24■□□□□ 0.03
SFI1Q12369 SHR5YOL110W 714 nt15.22■□□□□ 0.03
SFI1Q12369 OPI9YLR338W 858 nt15.18■□□□□ 0.02
SFI1Q12369 SPT5YML010W 3192 nt15.16■□□□□ 0.02
SFI1Q12369 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.14■□□□□ 0.01
SFI1Q12369 PET122YER153C 765 nt15.11■□□□□ 0.01
SFI1Q12369 SCR1SCR1 522 nt15.06■□□□□ 0
SFI1Q12369 DEP1YAL013W 1218 nt15.01□□□□□ -0.01
SFI1Q12369 SSA4YER103W 1929 nt14.94□□□□□ -0.02
SFI1Q12369 BUD23YCR047C 828 nt14.84□□□□□ -0.03
SFI1Q12369 RPN10YHR200W 807 nt14.82□□□□□ -0.04
SFI1Q12369 PUN1YLR414C 792 nt14.72□□□□□ -0.05
SFI1Q12369 RRN5YLR141W 1092 nt14.71□□□□□ -0.05
SFI1Q12369 YNL208WYNL208W 600 nt14.71□□□□□ -0.05
SFI1Q12369 PTC2YER089C 1395 nt14.66□□□□□ -0.06
SFI1Q12369 YDJ1YNL064C 1230 nt14.66□□□□□ -0.06
SFI1Q12369 NAB2YGL122C 1578 nt14.58□□□□□ -0.08
SFI1Q12369 YJR018WYJR018W 363 nt14.49□□□□□ -0.09
SFI1Q12369 BDF1YLR399C 2061 nt14.46□□□□□ -0.09
SFI1Q12369 RSB1YOR049C 1065 nt14.46□□□□□ -0.09
SFI1Q12369 GAR1YHR089C 618 nt14.43□□□□□ -0.1
SFI1Q12369 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.41□□□□□ -0.1
SFI1Q12369 MEP2YNL142W 1500 nt14.41□□□□□ -0.1
SFI1Q12369 FIS1YIL065C 468 nt14.34□□□□□ -0.11
SFI1Q12369 TAT1YBR069C 1860 nt14.25□□□□□ -0.13
SFI1Q12369 DAL1YIR027C 1383 nt14.25□□□□□ -0.13
SFI1Q12369 PST2YDR032C 597 nt14.17□□□□□ -0.14
SFI1Q12369 YJR120WYJR120W 351 nt14.17□□□□□ -0.14
SFI1Q12369 FPR4YLR449W 1179 nt14.16□□□□□ -0.14
SFI1Q12369 DCW1YKL046C 1350 nt14.16□□□□□ -0.14
SFI1Q12369 YPS1YLR120C 1710 nt14.12□□□□□ -0.15
SFI1Q12369 PHO4YFR034C 939 nt14.12□□□□□ -0.15
SFI1Q12369 INM2YDR287W 879 nt14.06□□□□□ -0.16
SFI1Q12369 TIR1YER011W 765 nt13.99□□□□□ -0.17
SFI1Q12369 SSA1YAL005C 1929 nt13.99□□□□□ -0.17
SFI1Q12369 RPP2BYDR382W 333 nt13.98□□□□□ -0.17
SFI1Q12369 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.97□□□□□ -0.17
SFI1Q12369 YBR220CYBR220C 1683 nt13.95□□□□□ -0.18
SFI1Q12369 EMI2YDR516C 1503 nt13.95□□□□□ -0.18
SFI1Q12369 YDR095CYDR095C 411 nt13.92□□□□□ -0.18
SFI1Q12369 YMR090WYMR090W 684 nt13.87□□□□□ -0.19
SFI1Q12369 PAC11YDR488C 1602 nt13.82□□□□□ -0.2
SFI1Q12369 YBL100CYBL100C 315 nt13.81□□□□□ -0.2
SFI1Q12369 YDL221WYDL221W 552 nt13.78□□□□□ -0.2
SFI1Q12369 SDH1YKL148C 1923 nt13.76□□□□□ -0.21
SFI1Q12369 CAC2YML102W 1407 nt13.73□□□□□ -0.21
SFI1Q12369 YKL097CYKL097C 411 nt13.72□□□□□ -0.21
SFI1Q12369 PTP1YDL230W 1008 nt13.7□□□□□ -0.22
SFI1Q12369 SRB2YHR041C 633 nt13.64□□□□□ -0.23
SFI1Q12369 RPP2AYOL039W 321 nt13.64□□□□□ -0.23
SFI1Q12369 FUN26YAL022C 1554 nt13.63□□□□□ -0.23
SFI1Q12369 BDH2YAL061W 1254 nt13.61□□□□□ -0.23
SFI1Q12369 PCH2YBR186W 1695 nt13.59□□□□□ -0.23
SFI1Q12369 ALF1YNL148C 765 nt13.56□□□□□ -0.24
SFI1Q12369 SCC4YER147C 1875 nt13.56□□□□□ -0.24
SFI1Q12369 GUT2YIL155C 1950 nt13.56□□□□□ -0.24
SFI1Q12369 SHU1YHL006C 453 nt13.54□□□□□ -0.24
SFI1Q12369 SEC11YIR022W 504 nt13.53□□□□□ -0.24
SFI1Q12369 IRC15YPL017C 1500 nt13.52□□□□□ -0.25
SFI1Q12369 TRM9YML014W 840 nt13.44□□□□□ -0.26
SFI1Q12369 GIS3YLR094C 1509 nt13.43□□□□□ -0.26
SFI1Q12369 SIS1YNL007C 1059 nt13.42□□□□□ -0.26
SFI1Q12369 CCT6YDR188W 1641 nt13.39□□□□□ -0.27
SFI1Q12369 NVJ2YPR091C 2313 nt13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.7 ms