Protein–RNA interactions for Protein: Q04311

VMS1, Protein VMS1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VMS1Q04311 NSR1YGR159C 1245 nt22.76■■□□□ 1.23
VMS1Q04311 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.59■■□□□ 1.21
VMS1Q04311 NOP1YDL014W 984 nt21.81■■□□□ 1.08
VMS1Q04311 MDJ1YFL016C 1536 nt20.5■□□□□ 0.87
VMS1Q04311 YKL036CYKL036C 393 nt19.91■□□□□ 0.78
VMS1Q04311 SRX1YKL086W 384 nt19.14■□□□□ 0.65
VMS1Q04311 Q0297Q0297 156 nt19.12■□□□□ 0.65
VMS1Q04311 YJL027CYJL027C 417 nt18.82■□□□□ 0.6
VMS1Q04311 DBP2YNL112W 1641 nt18.15■□□□□ 0.5
VMS1Q04311 YCR051WYCR051W 669 nt18.05■□□□□ 0.48
VMS1Q04311 SCS3YGL126W 1143 nt18.03■□□□□ 0.48
VMS1Q04311 YBR190WYBR190W 312 nt17.55■□□□□ 0.4
VMS1Q04311 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.52■□□□□ 0.4
VMS1Q04311 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.52■□□□□ 0.4
VMS1Q04311 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.52■□□□□ 0.4
VMS1Q04311 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.52■□□□□ 0.4
VMS1Q04311 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.52■□□□□ 0.4
VMS1Q04311 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.52■□□□□ 0.4
VMS1Q04311 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.52■□□□□ 0.4
VMS1Q04311 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.52■□□□□ 0.4
VMS1Q04311 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.52■□□□□ 0.4
VMS1Q04311 YOL085CYOL085C 342 nt17.31■□□□□ 0.36
VMS1Q04311 CCC1YLR220W 969 nt17.22■□□□□ 0.35
VMS1Q04311 RPP1BYDL130W 321 nt17.12■□□□□ 0.33
VMS1Q04311 PKP1YIL042C 1185 nt17.04■□□□□ 0.32
VMS1Q04311 RTC3YHR087W 336 nt17.02■□□□□ 0.32
VMS1Q04311 SCJ1YMR214W 1134 nt16.8■□□□□ 0.28
VMS1Q04311 RVS167YDR388W 1449 nt16.75■□□□□ 0.27
VMS1Q04311 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.45■□□□□ 0.22
VMS1Q04311 PET122YER153C 765 nt16.41■□□□□ 0.22
VMS1Q04311 PUT4YOR348C 1884 nt16.25■□□□□ 0.19
VMS1Q04311 SHR5YOL110W 714 nt16.2■□□□□ 0.18
VMS1Q04311 ATS1YAL020C 1002 nt16.04■□□□□ 0.16
VMS1Q04311 SCR1SCR1 522 nt16.03■□□□□ 0.16
VMS1Q04311 YDJ1YNL064C 1230 nt15.93■□□□□ 0.14
VMS1Q04311 URN1YPR152C 1398 nt15.91■□□□□ 0.14
VMS1Q04311 RRN5YLR141W 1092 nt15.89■□□□□ 0.13
VMS1Q04311 SSA3YBL075C 1950 nt15.89■□□□□ 0.13
VMS1Q04311 ARE1YCR048W 1833 nt15.87■□□□□ 0.13
VMS1Q04311 DEP1YAL013W 1218 nt15.8■□□□□ 0.12
VMS1Q04311 OPI9YLR338W 858 nt15.79■□□□□ 0.12
VMS1Q04311 SAH1YER043C 1350 nt15.75■□□□□ 0.11
VMS1Q04311 POA1YBR022W 534 nt15.63■□□□□ 0.09
VMS1Q04311 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.61■□□□□ 0.09
VMS1Q04311 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.56■□□□□ 0.08
VMS1Q04311 GAR1YHR089C 618 nt15.55■□□□□ 0.08
VMS1Q04311 YNL208WYNL208W 600 nt15.53■□□□□ 0.08
VMS1Q04311 RPN10YHR200W 807 nt15.52■□□□□ 0.08
VMS1Q04311 RSB1YOR049C 1065 nt15.4■□□□□ 0.06
VMS1Q04311 BSC6YOL137W 1494 nt15.37■□□□□ 0.05
VMS1Q04311 PUN1YLR414C 792 nt15.26■□□□□ 0.03
VMS1Q04311 YJR018WYJR018W 363 nt15.15■□□□□ 0.02
VMS1Q04311 PTC2YER089C 1395 nt15.14■□□□□ 0.01
VMS1Q04311 SPT5YML010W 3192 nt15.12■□□□□ 0.01
VMS1Q04311 BUD23YCR047C 828 nt15.1■□□□□ 0.01
VMS1Q04311 TIR1YER011W 765 nt15.08■□□□□ 0
VMS1Q04311 YJR120WYJR120W 351 nt15.05■□□□□ -0
VMS1Q04311 SSA1YAL005C 1929 nt15.03■□□□□ -0
VMS1Q04311 NAB2YGL122C 1578 nt14.99□□□□□ -0.01
VMS1Q04311 PST2YDR032C 597 nt14.96□□□□□ -0.01
VMS1Q04311 FIS1YIL065C 468 nt14.85□□□□□ -0.03
VMS1Q04311 SRB2YHR041C 633 nt14.83□□□□□ -0.04
VMS1Q04311 Q0182Q0182 405 nt14.78□□□□□ -0.04
VMS1Q04311 DAL1YIR027C 1383 nt14.74□□□□□ -0.05
VMS1Q04311 RPP2BYDR382W 333 nt14.68□□□□□ -0.06
VMS1Q04311 INM2YDR287W 879 nt14.63□□□□□ -0.07
VMS1Q04311 PHO4YFR034C 939 nt14.62□□□□□ -0.07
VMS1Q04311 FPR4YLR449W 1179 nt14.59□□□□□ -0.07
VMS1Q04311 SSA4YER103W 1929 nt14.53□□□□□ -0.08
VMS1Q04311 YPS1YLR120C 1710 nt14.49□□□□□ -0.09
VMS1Q04311 MEP2YNL142W 1500 nt14.47□□□□□ -0.09
VMS1Q04311 YBL100CYBL100C 315 nt14.46□□□□□ -0.09
VMS1Q04311 BDH2YAL061W 1254 nt14.45□□□□□ -0.1
VMS1Q04311 SHU1YHL006C 453 nt14.4□□□□□ -0.1
VMS1Q04311 WWM1YFL010C 636 nt14.39□□□□□ -0.11
VMS1Q04311 YDR095CYDR095C 411 nt14.34□□□□□ -0.11
VMS1Q04311 FUN26YAL022C 1554 nt14.3□□□□□ -0.12
VMS1Q04311 DCW1YKL046C 1350 nt14.27□□□□□ -0.12
VMS1Q04311 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.23□□□□□ -0.13
VMS1Q04311 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.22□□□□□ -0.13
VMS1Q04311 LSM3YLR438C-A 270 nt14.21□□□□□ -0.13
VMS1Q04311 HOM6YJR139C 1080 nt14.18□□□□□ -0.14
VMS1Q04311 TRM9YML014W 840 nt14.16□□□□□ -0.14
VMS1Q04311 YGR021WYGR021W 873 nt14.15□□□□□ -0.14
VMS1Q04311 PTP1YDL230W 1008 nt14.14□□□□□ -0.15
VMS1Q04311 CCT6YDR188W 1641 nt14.13□□□□□ -0.15
VMS1Q04311 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.13□□□□□ -0.15
VMS1Q04311 BDF1YLR399C 2061 nt14.1□□□□□ -0.15
VMS1Q04311 YKL097CYKL097C 411 nt14.09□□□□□ -0.15
VMS1Q04311 MNP1YGL068W 585 nt14.05□□□□□ -0.16
VMS1Q04311 ALF1YNL148C 765 nt14.04□□□□□ -0.16
VMS1Q04311 CAC2YML102W 1407 nt14.04□□□□□ -0.16
VMS1Q04311 EMI2YDR516C 1503 nt14.04□□□□□ -0.16
VMS1Q04311 RPP2AYOL039W 321 nt14.03□□□□□ -0.16
VMS1Q04311 SIS1YNL007C 1059 nt14.01□□□□□ -0.17
VMS1Q04311 RKM5YLR137W 1104 nt13.95□□□□□ -0.18
VMS1Q04311 YDL221WYDL221W 552 nt13.93□□□□□ -0.18
VMS1Q04311 YBR220CYBR220C 1683 nt13.93□□□□□ -0.18
VMS1Q04311 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.91□□□□□ -0.18
VMS1Q04311 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms