RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K NOP2P40991 618 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K NET1P47035 1189 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K PCL8Q08966 492 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K NCB2Q92317 146 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K FIG2P25653 1609 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K PIF1P07271 859 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K KIN1P13185 1064 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC60P26637 1090 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K PBY1P38254 753 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K VAB2P40003 282 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR147WP40218 223 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K YGL242CP53066 181 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K PIB2P53191 635 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K ALO1P54783 526 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data3.16□□□□□ -1.9not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K MAM3Q12296 706 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K CYB2P00175 591 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K VMA2P16140 517 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K KTR2P33550 425 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K LDH1P38139 375 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K CST26P38226 397 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS62P53285 467 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K BRE5P53741 515 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K BUL2Q03758 920 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K UBX5Q06682 500 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL260WQ08977 551 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR131CQ12486 218 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR461C-AQ2V2P7 80 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K HKR1P41809 1802 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K NOT3P06102 836 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K HIP1P06775 603 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K ERG12P07277 443 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K PRE8P23639 250 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K GCD7P32502 381 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K SRP40P32583 406 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K NMD2P38798 1089 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K FPR3P38911 411 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K IRC8P47046 822 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K POL32P47110 350 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K CLA4P48562 842 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K SNU71P53207 620 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K YVH1Q02256 364 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K MRD1Q06106 887 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K SUB2Q07478 446 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K TY3A-GQ12173 290 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data3.14□□□□□ -1.91not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K TY3A-IQ99219 290 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K PDR18P53756 1333 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K CHO2P05374 869 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K SAM2P19358 384 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K SRM1P21827 482 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K CHS3P29465 1165 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K EUG1P32474 517 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K UIP5P36137 443 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K RFC1P38630 861 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K VID27P40157 782 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K YJR107WP47145 328 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K MLC1P53141 149 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K SLD5Q03406 294 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K YML037CQ03703 340 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K DUS4Q06063 367 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K ISW2Q08773 1120 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K SUT2Q12286 268 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K MPH3P0CE00 602 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K SAM1P10659 382 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K COQ1P18900 473 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data3.12□□□□□ -1.91not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K PKC1P24583 1151 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K DBP1P24784 617 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K PER1P25625 357 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K SPB4P25808 606 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K AVT3P36062 692 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM21P38167 1117 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K RRP8P38961 392 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS8P39702 1274 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K AFG3P39925 761 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K TIF4631P39935 952 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K MSH4P40965 878 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K ENP2P48234 707 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K HGH1P48362 394 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K MET7Q08645 548 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K MSC6Q08818 692 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K RKM4Q12504 494 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD18P10862 487 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K MIP1P15801 1254 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K UTR4P32626 227 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K SHP1P34223 423 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K RTS1P38903 757 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K UBP9P39967 754 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K FIR1P40020 876 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K EPS1P40557 701 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K IOC3P43596 787 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K SCS3P53012 380 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K YRB30P53107 440 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K YGL039WP53183 348 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPS35P53292 345 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL034WQ03083 165 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)KtW(CCA)K KAR5Q04746 504 aa3.11□□□□□ -1.91
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