Protein–RNA interactions for Protein: P24583

PKC1, Protein kinase C-like 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKC1P24583 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.32■■□□□ 1.32
PKC1P24583 NOP1YDL014W 984 nt22.88■■□□□ 1.25
PKC1P24583 NSR1YGR159C 1245 nt22.75■■□□□ 1.23
PKC1P24583 YKL036CYKL036C 393 nt21.53■■□□□ 1.04
PKC1P24583 YJL027CYJL027C 417 nt20.21■□□□□ 0.83
PKC1P24583 Q0297Q0297 156 nt20.13■□□□□ 0.81
PKC1P24583 SRX1YKL086W 384 nt19.95■□□□□ 0.78
PKC1P24583 SCS3YGL126W 1143 nt19.81■□□□□ 0.76
PKC1P24583 MDJ1YFL016C 1536 nt19.75■□□□□ 0.75
PKC1P24583 YCR051WYCR051W 669 nt19.01■□□□□ 0.63
PKC1P24583 YOL085CYOL085C 342 nt18.62■□□□□ 0.57
PKC1P24583 PKP1YIL042C 1185 nt18.3■□□□□ 0.52
PKC1P24583 SCJ1YMR214W 1134 nt18.13■□□□□ 0.49
PKC1P24583 RPP1BYDL130W 321 nt18.08■□□□□ 0.48
PKC1P24583 ATS1YAL020C 1002 nt17.86■□□□□ 0.45
PKC1P24583 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.75■□□□□ 0.43
PKC1P24583 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.75■□□□□ 0.43
PKC1P24583 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.75■□□□□ 0.43
PKC1P24583 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.75■□□□□ 0.43
PKC1P24583 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.75■□□□□ 0.43
PKC1P24583 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.75■□□□□ 0.43
PKC1P24583 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.75■□□□□ 0.43
PKC1P24583 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.75■□□□□ 0.43
PKC1P24583 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.75■□□□□ 0.43
PKC1P24583 CCC1YLR220W 969 nt17.64■□□□□ 0.41
PKC1P24583 DBP2YNL112W 1641 nt17.61■□□□□ 0.41
PKC1P24583 PET122YER153C 765 nt17.21■□□□□ 0.35
PKC1P24583 SCR1SCR1 522 nt17.21■□□□□ 0.35
PKC1P24583 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.97■□□□□ 0.31
PKC1P24583 Q0182Q0182 405 nt16.81■□□□□ 0.28
PKC1P24583 RRN5YLR141W 1092 nt16.78■□□□□ 0.28
PKC1P24583 RVS167YDR388W 1449 nt16.77■□□□□ 0.27
PKC1P24583 YBR190WYBR190W 312 nt16.71■□□□□ 0.27
PKC1P24583 MOT3YMR070W 1473 nt16.66■□□□□ 0.26
PKC1P24583 RSB1YOR049C 1065 nt16.6■□□□□ 0.25
PKC1P24583 RTC3YHR087W 336 nt16.53■□□□□ 0.24
PKC1P24583 PST2YDR032C 597 nt16.44■□□□□ 0.22
PKC1P24583 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.44■□□□□ 0.22
PKC1P24583 YDJ1YNL064C 1230 nt16.4■□□□□ 0.22
PKC1P24583 SHR5YOL110W 714 nt16.25■□□□□ 0.19
PKC1P24583 YKL097CYKL097C 411 nt16.08■□□□□ 0.16
PKC1P24583 GAR1YHR089C 618 nt16■□□□□ 0.15
PKC1P24583 SHU1YHL006C 453 nt15.67■□□□□ 0.1
PKC1P24583 DEP1YAL013W 1218 nt15.66■□□□□ 0.1
PKC1P24583 URN1YPR152C 1398 nt15.51■□□□□ 0.07
PKC1P24583 YNL208WYNL208W 600 nt15.46■□□□□ 0.07
PKC1P24583 RPN10YHR200W 807 nt15.43■□□□□ 0.06
PKC1P24583 TIR1YER011W 765 nt15.42■□□□□ 0.06
PKC1P24583 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.31■□□□□ 0.04
PKC1P24583 YOR139CYOR139C 393 nt15.29■□□□□ 0.04
PKC1P24583 OPI9YLR338W 858 nt15.17■□□□□ 0.02
PKC1P24583 NPL3YDR432W 1245 nt15.13■□□□□ 0.01
PKC1P24583 SSA1YAL005C 1929 nt15.11■□□□□ 0.01
PKC1P24583 SAH1YER043C 1350 nt14.97□□□□□ -0.01
PKC1P24583 SRB2YHR041C 633 nt14.92□□□□□ -0.02
PKC1P24583 YGR021WYGR021W 873 nt14.89□□□□□ -0.03
PKC1P24583 YJR018WYJR018W 363 nt14.84□□□□□ -0.03
PKC1P24583 MNP1YGL068W 585 nt14.83□□□□□ -0.04
PKC1P24583 HOM6YJR139C 1080 nt14.83□□□□□ -0.04
PKC1P24583 WWM1YFL010C 636 nt14.82□□□□□ -0.04
PKC1P24583 YOL037CYOL037C 354 nt14.79□□□□□ -0.04
PKC1P24583 PUT4YOR348C 1884 nt14.77□□□□□ -0.05
PKC1P24583 PUN1YLR414C 792 nt14.76□□□□□ -0.05
PKC1P24583 RPP2BYDR382W 333 nt14.7□□□□□ -0.06
PKC1P24583 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.68□□□□□ -0.06
PKC1P24583 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.68□□□□□ -0.06
PKC1P24583 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.68□□□□□ -0.06
PKC1P24583 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.68□□□□□ -0.06
PKC1P24583 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.68□□□□□ -0.06
PKC1P24583 ARE1YCR048W 1833 nt14.66□□□□□ -0.06
PKC1P24583 YJR120WYJR120W 351 nt14.64□□□□□ -0.07
PKC1P24583 RKM5YLR137W 1104 nt14.62□□□□□ -0.07
PKC1P24583 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.57□□□□□ -0.08
PKC1P24583 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.5□□□□□ -0.09
PKC1P24583 PTC2YER089C 1395 nt14.49□□□□□ -0.09
PKC1P24583 PUS2YGL063W 1113 nt14.45□□□□□ -0.1
PKC1P24583 BDH2YAL061W 1254 nt14.44□□□□□ -0.1
PKC1P24583 POA1YBR022W 534 nt14.4□□□□□ -0.1
PKC1P24583 YLR281CYLR281C 468 nt14.39□□□□□ -0.11
PKC1P24583 NME1NME1 340 nt14.39□□□□□ -0.11
PKC1P24583 SSA3YBL075C 1950 nt14.36□□□□□ -0.11
PKC1P24583 LSM3YLR438C-A 270 nt14.35□□□□□ -0.11
PKC1P24583 WHI5YOR083W 888 nt14.3□□□□□ -0.12
PKC1P24583 INM2YDR287W 879 nt14.26□□□□□ -0.13
PKC1P24583 BUD23YCR047C 828 nt14.25□□□□□ -0.13
PKC1P24583 NAB2YGL122C 1578 nt14.23□□□□□ -0.13
PKC1P24583 YBL100CYBL100C 315 nt14.19□□□□□ -0.14
PKC1P24583 FPR4YLR449W 1179 nt14.17□□□□□ -0.14
PKC1P24583 BSC6YOL137W 1494 nt14.14□□□□□ -0.15
PKC1P24583 DAL1YIR027C 1383 nt14.14□□□□□ -0.15
PKC1P24583 TRM9YML014W 840 nt14.13□□□□□ -0.15
PKC1P24583 FMP45YDL222C 930 nt14.08□□□□□ -0.16
PKC1P24583 DSK2YMR276W 1122 nt14.05□□□□□ -0.16
PKC1P24583 FIS1YIL065C 468 nt14.04□□□□□ -0.16
PKC1P24583 YGR139WYGR139W 339 nt14.03□□□□□ -0.16
PKC1P24583 FUN26YAL022C 1554 nt14.03□□□□□ -0.16
PKC1P24583 YPR011CYPR011C 981 nt14□□□□□ -0.17
PKC1P24583 PHO4YFR034C 939 nt13.99□□□□□ -0.17
PKC1P24583 IMP2'YIL154C 1041 nt13.99□□□□□ -0.17
PKC1P24583 YCH1YGR203W 447 nt13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms