Protein–RNA interactions for Protein: Q08818

MSC6, Meiotic sister-chromatid recombination protein 6, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSC6Q08818 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.01■■□□□ 1.27
MSC6Q08818 NOP1YDL014W 984 nt22.58■■□□□ 1.21
MSC6Q08818 NSR1YGR159C 1245 nt22.54■■□□□ 1.2
MSC6Q08818 YKL036CYKL036C 393 nt21.22■□□□□ 0.99
MSC6Q08818 Q0297Q0297 156 nt19.9■□□□□ 0.78
MSC6Q08818 YJL027CYJL027C 417 nt19.87■□□□□ 0.77
MSC6Q08818 SRX1YKL086W 384 nt19.73■□□□□ 0.75
MSC6Q08818 MDJ1YFL016C 1536 nt19.55■□□□□ 0.72
MSC6Q08818 SCS3YGL126W 1143 nt19.51■□□□□ 0.71
MSC6Q08818 YCR051WYCR051W 669 nt18.73■□□□□ 0.59
MSC6Q08818 YOL085CYOL085C 342 nt18.37■□□□□ 0.53
MSC6Q08818 PKP1YIL042C 1185 nt18.01■□□□□ 0.47
MSC6Q08818 SCJ1YMR214W 1134 nt17.87■□□□□ 0.45
MSC6Q08818 RPP1BYDL130W 321 nt17.85■□□□□ 0.45
MSC6Q08818 ATS1YAL020C 1002 nt17.59■□□□□ 0.41
MSC6Q08818 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.56■□□□□ 0.4
MSC6Q08818 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.56■□□□□ 0.4
MSC6Q08818 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.56■□□□□ 0.4
MSC6Q08818 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.56■□□□□ 0.4
MSC6Q08818 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.56■□□□□ 0.4
MSC6Q08818 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.56■□□□□ 0.4
MSC6Q08818 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.56■□□□□ 0.4
MSC6Q08818 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.56■□□□□ 0.4
MSC6Q08818 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.56■□□□□ 0.4
MSC6Q08818 DBP2YNL112W 1641 nt17.49■□□□□ 0.39
MSC6Q08818 CCC1YLR220W 969 nt17.39■□□□□ 0.37
MSC6Q08818 PET122YER153C 765 nt16.98■□□□□ 0.31
MSC6Q08818 SCR1SCR1 522 nt16.94■□□□□ 0.3
MSC6Q08818 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.77■□□□□ 0.28
MSC6Q08818 YBR190WYBR190W 312 nt16.6■□□□□ 0.25
MSC6Q08818 RRN5YLR141W 1092 nt16.56■□□□□ 0.24
MSC6Q08818 RVS167YDR388W 1449 nt16.55■□□□□ 0.24
MSC6Q08818 RSB1YOR049C 1065 nt16.33■□□□□ 0.2
MSC6Q08818 RTC3YHR087W 336 nt16.24■□□□□ 0.19
MSC6Q08818 PST2YDR032C 597 nt16.23■□□□□ 0.19
MSC6Q08818 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.23■□□□□ 0.19
MSC6Q08818 YDJ1YNL064C 1230 nt16.23■□□□□ 0.19
MSC6Q08818 SHR5YOL110W 714 nt16.08■□□□□ 0.16
MSC6Q08818 Q0182Q0182 405 nt15.97■□□□□ 0.15
MSC6Q08818 YKL097CYKL097C 411 nt15.8■□□□□ 0.12
MSC6Q08818 GAR1YHR089C 618 nt15.77■□□□□ 0.12
MSC6Q08818 MOT3YMR070W 1473 nt15.59■□□□□ 0.09
MSC6Q08818 DEP1YAL013W 1218 nt15.46■□□□□ 0.07
MSC6Q08818 SHU1YHL006C 453 nt15.44■□□□□ 0.06
MSC6Q08818 URN1YPR152C 1398 nt15.36■□□□□ 0.05
MSC6Q08818 YNL208WYNL208W 600 nt15.29■□□□□ 0.04
MSC6Q08818 RPN10YHR200W 807 nt15.25■□□□□ 0.03
MSC6Q08818 TIR1YER011W 765 nt15.24■□□□□ 0.03
MSC6Q08818 YOR139CYOR139C 393 nt15.08■□□□□ 0
MSC6Q08818 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.07■□□□□ 0
MSC6Q08818 OPI9YLR338W 858 nt15.07■□□□□ 0
MSC6Q08818 SSA1YAL005C 1929 nt14.96□□□□□ -0.02
MSC6Q08818 NPL3YDR432W 1245 nt14.86□□□□□ -0.03
MSC6Q08818 SAH1YER043C 1350 nt14.84□□□□□ -0.03
MSC6Q08818 SRB2YHR041C 633 nt14.76□□□□□ -0.05
MSC6Q08818 PUT4YOR348C 1884 nt14.72□□□□□ -0.05
MSC6Q08818 YGR021WYGR021W 873 nt14.69□□□□□ -0.06
MSC6Q08818 YJR018WYJR018W 363 nt14.69□□□□□ -0.06
MSC6Q08818 HOM6YJR139C 1080 nt14.65□□□□□ -0.06
MSC6Q08818 PUN1YLR414C 792 nt14.64□□□□□ -0.07
MSC6Q08818 WWM1YFL010C 636 nt14.63□□□□□ -0.07
MSC6Q08818 MNP1YGL068W 585 nt14.61□□□□□ -0.07
MSC6Q08818 ARE1YCR048W 1833 nt14.59□□□□□ -0.07
MSC6Q08818 YOL037CYOL037C 354 nt14.58□□□□□ -0.08
MSC6Q08818 YJR120WYJR120W 351 nt14.54□□□□□ -0.08
MSC6Q08818 RPP2BYDR382W 333 nt14.51□□□□□ -0.09
MSC6Q08818 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.48□□□□□ -0.09
MSC6Q08818 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.48□□□□□ -0.09
MSC6Q08818 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.48□□□□□ -0.09
MSC6Q08818 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.48□□□□□ -0.09
MSC6Q08818 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.48□□□□□ -0.09
MSC6Q08818 RKM5YLR137W 1104 nt14.44□□□□□ -0.1
MSC6Q08818 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.4□□□□□ -0.1
MSC6Q08818 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.38□□□□□ -0.11
MSC6Q08818 PTC2YER089C 1395 nt14.36□□□□□ -0.11
MSC6Q08818 POA1YBR022W 534 nt14.31□□□□□ -0.12
MSC6Q08818 BDH2YAL061W 1254 nt14.3□□□□□ -0.12
MSC6Q08818 SSA3YBL075C 1950 nt14.3□□□□□ -0.12
MSC6Q08818 YLR281CYLR281C 468 nt14.22□□□□□ -0.13
MSC6Q08818 LSM3YLR438C-A 270 nt14.22□□□□□ -0.13
MSC6Q08818 PUS2YGL063W 1113 nt14.21□□□□□ -0.13
MSC6Q08818 INM2YDR287W 879 nt14.14□□□□□ -0.15
MSC6Q08818 NAB2YGL122C 1578 nt14.13□□□□□ -0.15
MSC6Q08818 BUD23YCR047C 828 nt14.1□□□□□ -0.15
MSC6Q08818 WHI5YOR083W 888 nt14.1□□□□□ -0.15
MSC6Q08818 YBL100CYBL100C 315 nt14.04□□□□□ -0.16
MSC6Q08818 DAL1YIR027C 1383 nt14.02□□□□□ -0.17
MSC6Q08818 FPR4YLR449W 1179 nt13.98□□□□□ -0.17
MSC6Q08818 TRM9YML014W 840 nt13.97□□□□□ -0.17
MSC6Q08818 FIS1YIL065C 468 nt13.93□□□□□ -0.18
MSC6Q08818 FUN26YAL022C 1554 nt13.89□□□□□ -0.19
MSC6Q08818 BSC6YOL137W 1494 nt13.89□□□□□ -0.19
MSC6Q08818 PHO4YFR034C 939 nt13.87□□□□□ -0.19
MSC6Q08818 FMP45YDL222C 930 nt13.84□□□□□ -0.19
MSC6Q08818 DSK2YMR276W 1122 nt13.84□□□□□ -0.19
MSC6Q08818 YPR011CYPR011C 981 nt13.84□□□□□ -0.19
MSC6Q08818 IMP2'YIL154C 1041 nt13.82□□□□□ -0.2
MSC6Q08818 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.79□□□□□ -0.2
MSC6Q08818 CCT6YDR188W 1641 nt13.79□□□□□ -0.2
MSC6Q08818 YLR236CYLR236C 324 nt13.75□□□□□ -0.21
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