RNA–Protein interactions for RNA: YLL035W

GRC3, Transcript of Polynucleotide kinase present on rDNA, yeast

Gene GRC3, Length 1,899 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GRC3	YLL035W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	GAL11	P19659	1081 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	SOL3	P38858	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	YIL092W	P40497	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	TAF1	P46677	1066 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	CWH41	P53008	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	KRE28	Q04431	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	APC11	Q12157	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	DAL5	P15365	543 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	TPD3	P31383	635 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	KAR9	P32526	644 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	HEL1	P36113	551 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	RGD1	P38339	666 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	SAP30	P38429	201 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	SHC1	P39000	512 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	YEL023C	P39992	682 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	VHR2	P40041	505 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	ASI1	P54074	624 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	COG4	Q06096	861 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	YIR042C	P40586	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	RTF1	P53064	558 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	BTN2	P53286	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	YML119W	Q03208	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	JIP4	Q03361	876 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	YML083C	Q04526	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	SEC20	P28791	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	YGL081W	P53156	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	ORM1	P53224	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	ATG9	Q12142	997 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	SAC3	P46674	1301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	DRS2	P39524	1355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	STE11	P23561	717 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	MET4	P32389	672 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	PPG1	P32838	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	YEL1	P34225	687 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	DID4	P36108	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	PTC4	P38089	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	VID28	P40547	921 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	SSL2	Q00578	843 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	VPS20	Q04272	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	OMS1	Q06668	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	ULS1	Q08562	1619 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	PDR18	P53756	1333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	PSK1	P31374	1356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	RAV1	P47104	1357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	SNF2	P22082	1703 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	BIK1	P11709	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	FAR1	P21268	830 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	SEC66	P33754	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	KDX1	P36005	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	LHS1	P36016	881 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	SRL3	P36167	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	ATG14	P38270	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	YGR273C	P53329	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	FMP30	Q02883	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	APC2	Q12440	853 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	BUD14	P27637	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	DLD1	P32891	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	CSE1	P33307	960 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	SPT8	P38915	602 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	CSN12	P47130	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRC3	YLL035W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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