Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.61■■□□□ 1.37
CLF1Q12309 NSR1YGR159C 1245 nt23.3■■□□□ 1.32
CLF1Q12309 NOP1YDL014W 984 nt23.05■■□□□ 1.28
CLF1Q12309 YKL036CYKL036C 393 nt21.36■■□□□ 1.01
CLF1Q12309 MDJ1YFL016C 1536 nt20.53■□□□□ 0.88
CLF1Q12309 Q0297Q0297 156 nt20.13■□□□□ 0.81
CLF1Q12309 SRX1YKL086W 384 nt20.07■□□□□ 0.8
CLF1Q12309 YJL027CYJL027C 417 nt20■□□□□ 0.79
CLF1Q12309 SCS3YGL126W 1143 nt19.46■□□□□ 0.71
CLF1Q12309 YCR051WYCR051W 669 nt19.13■□□□□ 0.65
CLF1Q12309 YOL085CYOL085C 342 nt18.45■□□□□ 0.54
CLF1Q12309 PKP1YIL042C 1185 nt18.19■□□□□ 0.5
CLF1Q12309 DBP2YNL112W 1641 nt18.12■□□□□ 0.49
CLF1Q12309 RPP1BYDL130W 321 nt18.09■□□□□ 0.49
CLF1Q12309 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.02■□□□□ 0.48
CLF1Q12309 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.02■□□□□ 0.48
CLF1Q12309 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.02■□□□□ 0.48
CLF1Q12309 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.02■□□□□ 0.48
CLF1Q12309 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.02■□□□□ 0.48
CLF1Q12309 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.02■□□□□ 0.48
CLF1Q12309 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.02■□□□□ 0.48
CLF1Q12309 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.02■□□□□ 0.48
CLF1Q12309 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.02■□□□□ 0.48
CLF1Q12309 CCC1YLR220W 969 nt17.95■□□□□ 0.46
CLF1Q12309 YBR190WYBR190W 312 nt17.48■□□□□ 0.39
CLF1Q12309 ATS1YAL020C 1002 nt17.45■□□□□ 0.38
CLF1Q12309 SCJ1YMR214W 1134 nt17.43■□□□□ 0.38
CLF1Q12309 RVS167YDR388W 1449 nt17.27■□□□□ 0.35
CLF1Q12309 PET122YER153C 765 nt17.25■□□□□ 0.35
CLF1Q12309 RTC3YHR087W 336 nt17.2■□□□□ 0.34
CLF1Q12309 SCR1SCR1 522 nt17.2■□□□□ 0.34
CLF1Q12309 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.13■□□□□ 0.33
CLF1Q12309 RRN5YLR141W 1092 nt16.78■□□□□ 0.28
CLF1Q12309 SHR5YOL110W 714 nt16.63■□□□□ 0.25
CLF1Q12309 YDJ1YNL064C 1230 nt16.57■□□□□ 0.24
CLF1Q12309 RSB1YOR049C 1065 nt16.54■□□□□ 0.24
CLF1Q12309 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.43■□□□□ 0.22
CLF1Q12309 GAR1YHR089C 618 nt16.22■□□□□ 0.19
CLF1Q12309 DEP1YAL013W 1218 nt16.14■□□□□ 0.17
CLF1Q12309 PST2YDR032C 597 nt16.11■□□□□ 0.17
CLF1Q12309 URN1YPR152C 1398 nt16.09■□□□□ 0.17
CLF1Q12309 RPN10YHR200W 807 nt15.96■□□□□ 0.15
CLF1Q12309 YNL208WYNL208W 600 nt15.9■□□□□ 0.14
CLF1Q12309 OPI9YLR338W 858 nt15.79■□□□□ 0.12
CLF1Q12309 PUT4YOR348C 1884 nt15.67■□□□□ 0.1
CLF1Q12309 SAH1YER043C 1350 nt15.66■□□□□ 0.1
CLF1Q12309 TIR1YER011W 765 nt15.65■□□□□ 0.1
CLF1Q12309 YKL097CYKL097C 411 nt15.63■□□□□ 0.09
CLF1Q12309 ARE1YCR048W 1833 nt15.44■□□□□ 0.06
CLF1Q12309 SHU1YHL006C 453 nt15.43■□□□□ 0.06
CLF1Q12309 PUN1YLR414C 792 nt15.38■□□□□ 0.05
CLF1Q12309 YJR018WYJR018W 363 nt15.37■□□□□ 0.05
CLF1Q12309 SSA1YAL005C 1929 nt15.37■□□□□ 0.05
CLF1Q12309 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.32■□□□□ 0.04
CLF1Q12309 POA1YBR022W 534 nt15.28■□□□□ 0.04
CLF1Q12309 SSA3YBL075C 1950 nt15.18■□□□□ 0.02
CLF1Q12309 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.18■□□□□ 0.02
CLF1Q12309 RPP2BYDR382W 333 nt15.17■□□□□ 0.02
CLF1Q12309 PTC2YER089C 1395 nt15.15■□□□□ 0.02
CLF1Q12309 SRB2YHR041C 633 nt15.06■□□□□ 0
CLF1Q12309 BUD23YCR047C 828 nt15.05■□□□□ -0
CLF1Q12309 YJR120WYJR120W 351 nt15.01□□□□□ -0.01
CLF1Q12309 YGR021WYGR021W 873 nt14.97□□□□□ -0.01
CLF1Q12309 WWM1YFL010C 636 nt14.96□□□□□ -0.01
CLF1Q12309 NAB2YGL122C 1578 nt14.92□□□□□ -0.02
CLF1Q12309 BSC6YOL137W 1494 nt14.89□□□□□ -0.03
CLF1Q12309 YOR139CYOR139C 393 nt14.88□□□□□ -0.03
CLF1Q12309 NPL3YDR432W 1245 nt14.86□□□□□ -0.03
CLF1Q12309 HOM6YJR139C 1080 nt14.85□□□□□ -0.03
CLF1Q12309 INM2YDR287W 879 nt14.82□□□□□ -0.04
CLF1Q12309 MNP1YGL068W 585 nt14.82□□□□□ -0.04
CLF1Q12309 FPR4YLR449W 1179 nt14.82□□□□□ -0.04
CLF1Q12309 BDH2YAL061W 1254 nt14.81□□□□□ -0.04
CLF1Q12309 DAL1YIR027C 1383 nt14.76□□□□□ -0.05
CLF1Q12309 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.75□□□□□ -0.05
CLF1Q12309 YBL100CYBL100C 315 nt14.69□□□□□ -0.06
CLF1Q12309 YOL037CYOL037C 354 nt14.67□□□□□ -0.06
CLF1Q12309 FIS1YIL065C 468 nt14.66□□□□□ -0.06
CLF1Q12309 RKM5YLR137W 1104 nt14.66□□□□□ -0.06
CLF1Q12309 LSM3YLR438C-A 270 nt14.65□□□□□ -0.06
CLF1Q12309 PHO4YFR034C 939 nt14.6□□□□□ -0.07
CLF1Q12309 TRM9YML014W 840 nt14.55□□□□□ -0.08
CLF1Q12309 FUN26YAL022C 1554 nt14.5□□□□□ -0.09
CLF1Q12309 ALF1YNL148C 765 nt14.35□□□□□ -0.11
CLF1Q12309 CCT6YDR188W 1641 nt14.31□□□□□ -0.12
CLF1Q12309 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.31□□□□□ -0.12
CLF1Q12309 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.31□□□□□ -0.12
CLF1Q12309 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.31□□□□□ -0.12
CLF1Q12309 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.31□□□□□ -0.12
CLF1Q12309 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.31□□□□□ -0.12
CLF1Q12309 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.28□□□□□ -0.12
CLF1Q12309 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.28□□□□□ -0.12
CLF1Q12309 YLR281CYLR281C 468 nt14.27□□□□□ -0.13
CLF1Q12309 PUS2YGL063W 1113 nt14.24□□□□□ -0.13
CLF1Q12309 WHI5YOR083W 888 nt14.24□□□□□ -0.13
CLF1Q12309 YPS1YLR120C 1710 nt14.23□□□□□ -0.13
CLF1Q12309 YDR095CYDR095C 411 nt14.17□□□□□ -0.14
CLF1Q12309 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.16□□□□□ -0.14
CLF1Q12309 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.11□□□□□ -0.15
CLF1Q12309 YJL152WYJL152W 360 nt14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12 ms