Protein–RNA interactions for Protein: Q08225

YOL057W, Probable dipeptidyl peptidase 3, yeastyeast

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOL057WQ08225 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.66■■□□□ 1.7
YOL057WQ08225 NSR1YGR159C 1245 nt25.28■■□□□ 1.64
YOL057WQ08225 NOP1YDL014W 984 nt24.95■■□□□ 1.58
YOL057WQ08225 YKL036CYKL036C 393 nt23.21■■□□□ 1.31
YOL057WQ08225 MDJ1YFL016C 1536 nt22.36■■□□□ 1.17
YOL057WQ08225 Q0297Q0297 156 nt21.9■■□□□ 1.1
YOL057WQ08225 SRX1YKL086W 384 nt21.81■■□□□ 1.08
YOL057WQ08225 YJL027CYJL027C 417 nt21.74■■□□□ 1.07
YOL057WQ08225 SCS3YGL126W 1143 nt21.24■□□□□ 0.99
YOL057WQ08225 YCR051WYCR051W 669 nt20.78■□□□□ 0.92
YOL057WQ08225 YOL085CYOL085C 342 nt20.13■□□□□ 0.81
YOL057WQ08225 PKP1YIL042C 1185 nt19.87■□□□□ 0.77
YOL057WQ08225 DBP2YNL112W 1641 nt19.82■□□□□ 0.76
YOL057WQ08225 RPP1BYDL130W 321 nt19.67■□□□□ 0.74
YOL057WQ08225 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.61■□□□□ 0.73
YOL057WQ08225 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.61■□□□□ 0.73
YOL057WQ08225 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.61■□□□□ 0.73
YOL057WQ08225 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.61■□□□□ 0.73
YOL057WQ08225 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.61■□□□□ 0.73
YOL057WQ08225 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.61■□□□□ 0.73
YOL057WQ08225 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.61■□□□□ 0.73
YOL057WQ08225 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.61■□□□□ 0.73
YOL057WQ08225 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.61■□□□□ 0.73
YOL057WQ08225 CCC1YLR220W 969 nt19.52■□□□□ 0.72
YOL057WQ08225 ATS1YAL020C 1002 nt19.04■□□□□ 0.64
YOL057WQ08225 SCJ1YMR214W 1134 nt18.94■□□□□ 0.62
YOL057WQ08225 YBR190WYBR190W 312 nt18.94■□□□□ 0.62
YOL057WQ08225 PET122YER153C 765 nt18.81■□□□□ 0.6
YOL057WQ08225 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.65■□□□□ 0.58
YOL057WQ08225 RVS167YDR388W 1449 nt18.64■□□□□ 0.57
YOL057WQ08225 RTC3YHR087W 336 nt18.61■□□□□ 0.57
YOL057WQ08225 SCR1SCR1 522 nt18.61■□□□□ 0.57
YOL057WQ08225 RRN5YLR141W 1092 nt18.3■□□□□ 0.52
YOL057WQ08225 SHR5YOL110W 714 nt18.04■□□□□ 0.48
YOL057WQ08225 YDJ1YNL064C 1230 nt17.99■□□□□ 0.47
YOL057WQ08225 RSB1YOR049C 1065 nt17.98■□□□□ 0.47
YOL057WQ08225 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.93■□□□□ 0.46
YOL057WQ08225 GAR1YHR089C 618 nt17.65■□□□□ 0.42
YOL057WQ08225 PST2YDR032C 597 nt17.6■□□□□ 0.41
YOL057WQ08225 DEP1YAL013W 1218 nt17.58■□□□□ 0.4
YOL057WQ08225 URN1YPR152C 1398 nt17.47■□□□□ 0.39
YOL057WQ08225 YNL208WYNL208W 600 nt17.22■□□□□ 0.35
YOL057WQ08225 RPN10YHR200W 807 nt17.19■□□□□ 0.34
YOL057WQ08225 OPI9YLR338W 858 nt17.14■□□□□ 0.33
YOL057WQ08225 PUT4YOR348C 1884 nt17.07■□□□□ 0.32
YOL057WQ08225 SAH1YER043C 1350 nt17.04■□□□□ 0.32
YOL057WQ08225 TIR1YER011W 765 nt17.01■□□□□ 0.31
YOL057WQ08225 YKL097CYKL097C 411 nt17■□□□□ 0.31
YOL057WQ08225 SHU1YHL006C 453 nt16.88■□□□□ 0.29
YOL057WQ08225 ARE1YCR048W 1833 nt16.84■□□□□ 0.29
YOL057WQ08225 SSA1YAL005C 1929 nt16.79■□□□□ 0.28
YOL057WQ08225 YJR018WYJR018W 363 nt16.66■□□□□ 0.26
YOL057WQ08225 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.64■□□□□ 0.25
YOL057WQ08225 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.63■□□□□ 0.25
YOL057WQ08225 PUN1YLR414C 792 nt16.62■□□□□ 0.25
YOL057WQ08225 POA1YBR022W 534 nt16.62■□□□□ 0.25
YOL057WQ08225 SRB2YHR041C 633 nt16.59■□□□□ 0.25
YOL057WQ08225 YJR120WYJR120W 351 nt16.46■□□□□ 0.23
YOL057WQ08225 PTC2YER089C 1395 nt16.45■□□□□ 0.22
YOL057WQ08225 RPP2BYDR382W 333 nt16.35■□□□□ 0.21
YOL057WQ08225 WWM1YFL010C 636 nt16.33■□□□□ 0.2
YOL057WQ08225 BUD23YCR047C 828 nt16.31■□□□□ 0.2
YOL057WQ08225 YOR139CYOR139C 393 nt16.31■□□□□ 0.2
YOL057WQ08225 MNP1YGL068W 585 nt16.2■□□□□ 0.18
YOL057WQ08225 YGR021WYGR021W 873 nt16.2■□□□□ 0.18
YOL057WQ08225 BSC6YOL137W 1494 nt16.19■□□□□ 0.18
YOL057WQ08225 HOM6YJR139C 1080 nt16.19■□□□□ 0.18
YOL057WQ08225 NAB2YGL122C 1578 nt16.16■□□□□ 0.18
YOL057WQ08225 NPL3YDR432W 1245 nt16.11■□□□□ 0.17
YOL057WQ08225 BDH2YAL061W 1254 nt16.05■□□□□ 0.16
YOL057WQ08225 FPR4YLR449W 1179 nt16.05■□□□□ 0.16
YOL057WQ08225 INM2YDR287W 879 nt16.01■□□□□ 0.15
YOL057WQ08225 SSA3YBL075C 1950 nt16■□□□□ 0.15
YOL057WQ08225 DAL1YIR027C 1383 nt16■□□□□ 0.15
YOL057WQ08225 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.99■□□□□ 0.15
YOL057WQ08225 FIS1YIL065C 468 nt15.96■□□□□ 0.15
YOL057WQ08225 RKM5YLR137W 1104 nt15.96■□□□□ 0.15
YOL057WQ08225 YBL100CYBL100C 315 nt15.92■□□□□ 0.14
YOL057WQ08225 YOL037CYOL037C 354 nt15.9■□□□□ 0.14
YOL057WQ08225 LSM3YLR438C-A 270 nt15.86■□□□□ 0.13
YOL057WQ08225 PHO4YFR034C 939 nt15.85■□□□□ 0.13
YOL057WQ08225 FUN26YAL022C 1554 nt15.75■□□□□ 0.11
YOL057WQ08225 TRM9YML014W 840 nt15.74■□□□□ 0.11
YOL057WQ08225 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.66■□□□□ 0.1
YOL057WQ08225 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.66■□□□□ 0.1
YOL057WQ08225 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.66■□□□□ 0.1
YOL057WQ08225 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.66■□□□□ 0.1
YOL057WQ08225 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.66■□□□□ 0.1
YOL057WQ08225 YLR281CYLR281C 468 nt15.56■□□□□ 0.08
YOL057WQ08225 CCT6YDR188W 1641 nt15.54■□□□□ 0.08
YOL057WQ08225 PUS2YGL063W 1113 nt15.52■□□□□ 0.08
YOL057WQ08225 WHI5YOR083W 888 nt15.52■□□□□ 0.08
YOL057WQ08225 ALF1YNL148C 765 nt15.48■□□□□ 0.07
YOL057WQ08225 YPS1YLR120C 1710 nt15.46■□□□□ 0.07
YOL057WQ08225 YDR095CYDR095C 411 nt15.39■□□□□ 0.05
YOL057WQ08225 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.38■□□□□ 0.05
YOL057WQ08225 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.38■□□□□ 0.05
YOL057WQ08225 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.34■□□□□ 0.05
YOL057WQ08225 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.32■□□□□ 0.04
YOL057WQ08225 YPR011CYPR011C 981 nt15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms