Protein–RNA interactions for Protein: Q08641

ABP140, tRNA(Thr) (cytosine(32)-N(3))-methyltransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ABP140Q08641 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.93■■□□□ 1.1
ABP140Q08641 NSR1YGR159C 1245 nt21.75■■□□□ 1.07
ABP140Q08641 NOP1YDL014W 984 nt21.33■■□□□ 1.01
ABP140Q08641 YKL036CYKL036C 393 nt19.74■□□□□ 0.75
ABP140Q08641 MDJ1YFL016C 1536 nt19.28■□□□□ 0.68
ABP140Q08641 Q0297Q0297 156 nt18.71■□□□□ 0.59
ABP140Q08641 SRX1YKL086W 384 nt18.65■□□□□ 0.58
ABP140Q08641 YJL027CYJL027C 417 nt18.43■□□□□ 0.54
ABP140Q08641 SCS3YGL126W 1143 nt18■□□□□ 0.47
ABP140Q08641 YCR051WYCR051W 669 nt17.69■□□□□ 0.42
ABP140Q08641 YOL085CYOL085C 342 nt17.11■□□□□ 0.33
ABP140Q08641 DBP2YNL112W 1641 nt17.1■□□□□ 0.33
ABP140Q08641 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.84■□□□□ 0.29
ABP140Q08641 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.84■□□□□ 0.29
ABP140Q08641 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.84■□□□□ 0.29
ABP140Q08641 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.84■□□□□ 0.29
ABP140Q08641 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.84■□□□□ 0.29
ABP140Q08641 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.84■□□□□ 0.29
ABP140Q08641 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.84■□□□□ 0.29
ABP140Q08641 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.84■□□□□ 0.29
ABP140Q08641 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.84■□□□□ 0.29
ABP140Q08641 PKP1YIL042C 1185 nt16.84■□□□□ 0.29
ABP140Q08641 RPP1BYDL130W 321 nt16.79■□□□□ 0.28
ABP140Q08641 CCC1YLR220W 969 nt16.66■□□□□ 0.26
ABP140Q08641 YBR190WYBR190W 312 nt16.42■□□□□ 0.22
ABP140Q08641 ATS1YAL020C 1002 nt16.12■□□□□ 0.17
ABP140Q08641 RTC3YHR087W 336 nt16.05■□□□□ 0.16
ABP140Q08641 RVS167YDR388W 1449 nt16.04■□□□□ 0.16
ABP140Q08641 PET122YER153C 765 nt16.04■□□□□ 0.16
ABP140Q08641 SCJ1YMR214W 1134 nt16.01■□□□□ 0.15
ABP140Q08641 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.95■□□□□ 0.14
ABP140Q08641 SCR1SCR1 522 nt15.85■□□□□ 0.13
ABP140Q08641 SSA3YBL075C 1950 nt15.78■□□□□ 0.12
ABP140Q08641 RRN5YLR141W 1092 nt15.58■□□□□ 0.08
ABP140Q08641 SHR5YOL110W 714 nt15.51■□□□□ 0.07
ABP140Q08641 YDJ1YNL064C 1230 nt15.43■□□□□ 0.06
ABP140Q08641 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.28■□□□□ 0.04
ABP140Q08641 RSB1YOR049C 1065 nt15.26■□□□□ 0.03
ABP140Q08641 GAR1YHR089C 618 nt15.07■□□□□ 0
ABP140Q08641 DEP1YAL013W 1218 nt15.06■□□□□ 0
ABP140Q08641 URN1YPR152C 1398 nt15.05■□□□□ -0
ABP140Q08641 PST2YDR032C 597 nt14.92□□□□□ -0.02
ABP140Q08641 PUT4YOR348C 1884 nt14.89□□□□□ -0.03
ABP140Q08641 OPI9YLR338W 858 nt14.83□□□□□ -0.04
ABP140Q08641 YNL208WYNL208W 600 nt14.83□□□□□ -0.04
ABP140Q08641 RPN10YHR200W 807 nt14.82□□□□□ -0.04
ABP140Q08641 SAH1YER043C 1350 nt14.72□□□□□ -0.05
ABP140Q08641 ARE1YCR048W 1833 nt14.64□□□□□ -0.07
ABP140Q08641 TIR1YER011W 765 nt14.57□□□□□ -0.08
ABP140Q08641 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.43□□□□□ -0.1
ABP140Q08641 POA1YBR022W 534 nt14.41□□□□□ -0.1
ABP140Q08641 SSA1YAL005C 1929 nt14.4□□□□□ -0.1
ABP140Q08641 PUN1YLR414C 792 nt14.38□□□□□ -0.11
ABP140Q08641 YJR018WYJR018W 363 nt14.35□□□□□ -0.11
ABP140Q08641 YKL097CYKL097C 411 nt14.34□□□□□ -0.11
ABP140Q08641 SHU1YHL006C 453 nt14.31□□□□□ -0.12
ABP140Q08641 PTC2YER089C 1395 nt14.21□□□□□ -0.14
ABP140Q08641 SRB2YHR041C 633 nt14.19□□□□□ -0.14
ABP140Q08641 YJR120WYJR120W 351 nt14.19□□□□□ -0.14
ABP140Q08641 BUD23YCR047C 828 nt14.09□□□□□ -0.15
ABP140Q08641 BSC6YOL137W 1494 nt14.09□□□□□ -0.15
ABP140Q08641 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.07□□□□□ -0.16
ABP140Q08641 RPP2BYDR382W 333 nt14.06□□□□□ -0.16
ABP140Q08641 NAB2YGL122C 1578 nt14.01□□□□□ -0.17
ABP140Q08641 WWM1YFL010C 636 nt13.94□□□□□ -0.18
ABP140Q08641 YGR021WYGR021W 873 nt13.85□□□□□ -0.19
ABP140Q08641 DAL1YIR027C 1383 nt13.84□□□□□ -0.19
ABP140Q08641 FIS1YIL065C 468 nt13.84□□□□□ -0.19
ABP140Q08641 INM2YDR287W 879 nt13.83□□□□□ -0.2
ABP140Q08641 HOM6YJR139C 1080 nt13.83□□□□□ -0.2
ABP140Q08641 SSA4YER103W 1929 nt13.82□□□□□ -0.2
ABP140Q08641 BDH2YAL061W 1254 nt13.81□□□□□ -0.2
ABP140Q08641 FPR4YLR449W 1179 nt13.8□□□□□ -0.2
ABP140Q08641 YOR139CYOR139C 393 nt13.79□□□□□ -0.2
ABP140Q08641 MNP1YGL068W 585 nt13.77□□□□□ -0.21
ABP140Q08641 SPT5YML010W 3192 nt13.74□□□□□ -0.21
ABP140Q08641 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.71□□□□□ -0.21
ABP140Q08641 PHO4YFR034C 939 nt13.71□□□□□ -0.21
ABP140Q08641 YBL100CYBL100C 315 nt13.71□□□□□ -0.21
ABP140Q08641 LSM3YLR438C-A 270 nt13.65□□□□□ -0.22
ABP140Q08641 RKM5YLR137W 1104 nt13.63□□□□□ -0.23
ABP140Q08641 NPL3YDR432W 1245 nt13.62□□□□□ -0.23
ABP140Q08641 FUN26YAL022C 1554 nt13.56□□□□□ -0.24
ABP140Q08641 YOL037CYOL037C 354 nt13.55□□□□□ -0.24
ABP140Q08641 TRM9YML014W 840 nt13.54□□□□□ -0.24
ABP140Q08641 YPS1YLR120C 1710 nt13.43□□□□□ -0.26
ABP140Q08641 CCT6YDR188W 1641 nt13.41□□□□□ -0.26
ABP140Q08641 YDR095CYDR095C 411 nt13.36□□□□□ -0.27
ABP140Q08641 BDF1YLR399C 2061 nt13.33□□□□□ -0.27
ABP140Q08641 ALF1YNL148C 765 nt13.33□□□□□ -0.28
ABP140Q08641 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.27□□□□□ -0.29
ABP140Q08641 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.27□□□□□ -0.29
ABP140Q08641 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.26□□□□□ -0.29
ABP140Q08641 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.25□□□□□ -0.29
ABP140Q08641 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.25□□□□□ -0.29
ABP140Q08641 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.25□□□□□ -0.29
ABP140Q08641 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.25□□□□□ -0.29
ABP140Q08641 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.25□□□□□ -0.29
ABP140Q08641 YLR281CYLR281C 468 nt13.25□□□□□ -0.29
ABP140Q08641 MEP2YNL142W 1500 nt13.22□□□□□ -0.29
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