Protein–RNA interactions for Protein: Q12142

ATG9, Autophagy-related protein 9, yeastyeast

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Length 997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG9Q12142 NSR1YGR159C 1245 nt22.05■■□□□ 1.12
ATG9Q12142 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.85■■□□□ 1.09
ATG9Q12142 NOP1YDL014W 984 nt21.08■□□□□ 0.97
ATG9Q12142 MDJ1YFL016C 1536 nt19.92■□□□□ 0.78
ATG9Q12142 YKL036CYKL036C 393 nt19.15■□□□□ 0.66
ATG9Q12142 SRX1YKL086W 384 nt18.45■□□□□ 0.54
ATG9Q12142 Q0297Q0297 156 nt18.38■□□□□ 0.53
ATG9Q12142 YJL027CYJL027C 417 nt18.32■□□□□ 0.52
ATG9Q12142 DBP2YNL112W 1641 nt17.51■□□□□ 0.39
ATG9Q12142 YCR051WYCR051W 669 nt17.47■□□□□ 0.39
ATG9Q12142 SCS3YGL126W 1143 nt17.26■□□□□ 0.35
ATG9Q12142 YBR190WYBR190W 312 nt17.06■□□□□ 0.32
ATG9Q12142 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.9■□□□□ 0.3
ATG9Q12142 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.9■□□□□ 0.3
ATG9Q12142 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.9■□□□□ 0.3
ATG9Q12142 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.9■□□□□ 0.3
ATG9Q12142 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.9■□□□□ 0.3
ATG9Q12142 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.9■□□□□ 0.3
ATG9Q12142 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.9■□□□□ 0.3
ATG9Q12142 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.9■□□□□ 0.3
ATG9Q12142 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.9■□□□□ 0.3
ATG9Q12142 CCC1YLR220W 969 nt16.73■□□□□ 0.27
ATG9Q12142 RTC3YHR087W 336 nt16.64■□□□□ 0.25
ATG9Q12142 YOL085CYOL085C 342 nt16.64■□□□□ 0.25
ATG9Q12142 RPP1BYDL130W 321 nt16.49■□□□□ 0.23
ATG9Q12142 PKP1YIL042C 1185 nt16.43■□□□□ 0.22
ATG9Q12142 RVS167YDR388W 1449 nt16.28■□□□□ 0.2
ATG9Q12142 SCJ1YMR214W 1134 nt16.2■□□□□ 0.18
ATG9Q12142 SSA3YBL075C 1950 nt16.04■□□□□ 0.16
ATG9Q12142 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.88■□□□□ 0.13
ATG9Q12142 PET122YER153C 765 nt15.81■□□□□ 0.12
ATG9Q12142 PUT4YOR348C 1884 nt15.79■□□□□ 0.12
ATG9Q12142 SHR5YOL110W 714 nt15.67■□□□□ 0.1
ATG9Q12142 SCR1SCR1 522 nt15.48■□□□□ 0.07
ATG9Q12142 URN1YPR152C 1398 nt15.47■□□□□ 0.07
ATG9Q12142 ARE1YCR048W 1833 nt15.4■□□□□ 0.06
ATG9Q12142 DEP1YAL013W 1218 nt15.38■□□□□ 0.05
ATG9Q12142 YDJ1YNL064C 1230 nt15.36■□□□□ 0.05
ATG9Q12142 ATS1YAL020C 1002 nt15.35■□□□□ 0.05
ATG9Q12142 RRN5YLR141W 1092 nt15.33■□□□□ 0.04
ATG9Q12142 SAH1YER043C 1350 nt15.33■□□□□ 0.04
ATG9Q12142 OPI9YLR338W 858 nt15.32■□□□□ 0.04
ATG9Q12142 POA1YBR022W 534 nt15.26■□□□□ 0.03
ATG9Q12142 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.17■□□□□ 0.02
ATG9Q12142 RPN10YHR200W 807 nt15.1■□□□□ 0.01
ATG9Q12142 GAR1YHR089C 618 nt15.07■□□□□ 0
ATG9Q12142 YNL208WYNL208W 600 nt15.06■□□□□ 0
ATG9Q12142 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.02■□□□□ -0
ATG9Q12142 BSC6YOL137W 1494 nt14.99□□□□□ -0.01
ATG9Q12142 RSB1YOR049C 1065 nt14.87□□□□□ -0.03
ATG9Q12142 PUN1YLR414C 792 nt14.85□□□□□ -0.03
ATG9Q12142 BUD23YCR047C 828 nt14.79□□□□□ -0.04
ATG9Q12142 PTC2YER089C 1395 nt14.75□□□□□ -0.05
ATG9Q12142 YJR018WYJR018W 363 nt14.74□□□□□ -0.05
ATG9Q12142 SPT5YML010W 3192 nt14.61□□□□□ -0.07
ATG9Q12142 NAB2YGL122C 1578 nt14.59□□□□□ -0.07
ATG9Q12142 TIR1YER011W 765 nt14.58□□□□□ -0.08
ATG9Q12142 SSA1YAL005C 1929 nt14.51□□□□□ -0.09
ATG9Q12142 YJR120WYJR120W 351 nt14.5□□□□□ -0.09
ATG9Q12142 FIS1YIL065C 468 nt14.36□□□□□ -0.11
ATG9Q12142 DAL1YIR027C 1383 nt14.33□□□□□ -0.12
ATG9Q12142 PST2YDR032C 597 nt14.3□□□□□ -0.12
ATG9Q12142 RPP2BYDR382W 333 nt14.29□□□□□ -0.12
ATG9Q12142 SSA4YER103W 1929 nt14.29□□□□□ -0.12
ATG9Q12142 FPR4YLR449W 1179 nt14.28□□□□□ -0.12
ATG9Q12142 INM2YDR287W 879 nt14.25□□□□□ -0.13
ATG9Q12142 SRB2YHR041C 633 nt14.25□□□□□ -0.13
ATG9Q12142 PHO4YFR034C 939 nt14.2□□□□□ -0.14
ATG9Q12142 MEP2YNL142W 1500 nt14.1□□□□□ -0.15
ATG9Q12142 YPS1YLR120C 1710 nt14.07□□□□□ -0.16
ATG9Q12142 YBL100CYBL100C 315 nt14.04□□□□□ -0.16
ATG9Q12142 BDH2YAL061W 1254 nt13.99□□□□□ -0.17
ATG9Q12142 YDR095CYDR095C 411 nt13.92□□□□□ -0.18
ATG9Q12142 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.91□□□□□ -0.18
ATG9Q12142 DCW1YKL046C 1350 nt13.91□□□□□ -0.18
ATG9Q12142 WWM1YFL010C 636 nt13.9□□□□□ -0.18
ATG9Q12142 FUN26YAL022C 1554 nt13.88□□□□□ -0.19
ATG9Q12142 SHU1YHL006C 453 nt13.8□□□□□ -0.2
ATG9Q12142 TRM9YML014W 840 nt13.79□□□□□ -0.2
ATG9Q12142 BDF1YLR399C 2061 nt13.79□□□□□ -0.2
ATG9Q12142 LSM3YLR438C-A 270 nt13.75□□□□□ -0.21
ATG9Q12142 ALF1YNL148C 765 nt13.72□□□□□ -0.21
ATG9Q12142 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.71□□□□□ -0.21
ATG9Q12142 EMI2YDR516C 1503 nt13.69□□□□□ -0.22
ATG9Q12142 PTP1YDL230W 1008 nt13.69□□□□□ -0.22
ATG9Q12142 CCT6YDR188W 1641 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG9Q12142 RPP2AYOL039W 321 nt13.66□□□□□ -0.22
ATG9Q12142 CAC2YML102W 1407 nt13.65□□□□□ -0.22
ATG9Q12142 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.64□□□□□ -0.23
ATG9Q12142 YGR021WYGR021W 873 nt13.64□□□□□ -0.23
ATG9Q12142 HOM6YJR139C 1080 nt13.64□□□□□ -0.23
ATG9Q12142 TAT1YBR069C 1860 nt13.59□□□□□ -0.23
ATG9Q12142 SIS1YNL007C 1059 nt13.58□□□□□ -0.24
ATG9Q12142 YBR220CYBR220C 1683 nt13.57□□□□□ -0.24
ATG9Q12142 YMR090WYMR090W 684 nt13.57□□□□□ -0.24
ATG9Q12142 YDL221WYDL221W 552 nt13.55□□□□□ -0.24
ATG9Q12142 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.54□□□□□ -0.24
ATG9Q12142 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.54□□□□□ -0.24
ATG9Q12142 MNP1YGL068W 585 nt13.51□□□□□ -0.25
ATG9Q12142 YKL097CYKL097C 411 nt13.49□□□□□ -0.25
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