RNA–Protein interactions for RNA: YHR139C

SPS100, Transcript of Protein required for spore wall maturation, yeast

Gene SPS100, Length 981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS100	YHR139C	PEA2	P40091	420 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	PCL8	Q08966	492 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	ADP1	P25371	1049 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.18	□□□□□ -0.78	not detected
SPS100	YHR139C	NIT1	P40447	199 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	YHL050C	P38721	697 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	RAD53	P22216	821 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	10.16	□□□□□ -0.78	not detected
SPS100	YHR139C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	UFD2	P54860	961 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	IMP2'	P32351	346 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	YBL028C	P38202	106 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	VID27	P40157	782 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	RAD61	Q99359	647 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	GAL2	P13181	574 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	KIN1	P13185	1064 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	SPO22	P40511	975 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	YIR014W	P40570	242 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	CSR2	Q12734	1121 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	PRE8	P23639	250 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	PEP3	P27801	918 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	RER2	P35196	286 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	YIL089W	P40500	205 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	MPH3	P0CE00	602 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	ANP1	P32629	500 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	MYO3	P36006	1272 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	SRM1	P21827	482 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	PNT1	P38969	423 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	RLF2	Q12495	606 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	RIT1	P23796	513 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	CST26	P38226	397 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	VPS8	P39702	1274 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	HDA1	P53973	706 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	EST2	Q06163	884 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.09	□□□□□ -0.79	not detected
SPS100	YHR139C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	SPT21	P35209	758 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	VID28	P40547	921 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	SKG3	Q06315	1026 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPS100	YHR139C	SIS2	P36024	562 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	ARP5	P53946	755 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	LAP2	Q10740	671 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	ACA1	P39970	489 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	TFC6	Q06339	672 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	GIN4	Q12263	1142 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	ACE2	P21192	770 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	MAK31	P23059	88 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	CHS3	P29465	1165 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	FBP26	P32604	452 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	ECM23	Q02710	187 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	SRS2	P12954	1174 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	PEX29	Q03370	554 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.04	□□□□□ -0.8	not detected
SPS100	YHR139C	CSM2	P40465	213 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	ALG2	P43636	503 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	YKE2	P52553	114 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	FOL1	P53848	824 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	ERG12	P07277	443 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	PES4	P39684	611 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	VPS30	Q02948	557 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	TUS1	Q06412	1307 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPS100	YHR139C	PCT1	P13259	424 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPS100	YHR139C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SPS100	YHR139C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SPS100	YHR139C	OCT1	P35999	772 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPS100	YHR139C	AKR1	P39010	764 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPS100	YHR139C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SPS100	YHR139C	TOM1	Q03280	3268 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPS100	YHR139C	NUC1	P08466	329 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPS100	YHR139C	HVG1	P0CE11	249 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPS100	YHR139C	MAL31	P38156	614 aa		10.01	□□□□□ -0.81

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