Protein–RNA interactions for Protein: Q08960

TYW1, S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TYW1Q08960 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.02■■□□□ 1.44
TYW1Q08960 NOP1YDL014W 984 nt23.62■■□□□ 1.37
TYW1Q08960 NSR1YGR159C 1245 nt23.11■■□□□ 1.29
TYW1Q08960 YKL036CYKL036C 393 nt22.45■■□□□ 1.18
TYW1Q08960 YJL027CYJL027C 417 nt21.16■□□□□ 0.98
TYW1Q08960 Q0297Q0297 156 nt20.81■□□□□ 0.92
TYW1Q08960 SCS3YGL126W 1143 nt20.78■□□□□ 0.92
TYW1Q08960 SRX1YKL086W 384 nt20.57■□□□□ 0.88
TYW1Q08960 MDJ1YFL016C 1536 nt19.87■□□□□ 0.77
TYW1Q08960 YCR051WYCR051W 669 nt19.71■□□□□ 0.75
TYW1Q08960 YOL085CYOL085C 342 nt19.39■□□□□ 0.69
TYW1Q08960 SCJ1YMR214W 1134 nt19.28■□□□□ 0.68
TYW1Q08960 PKP1YIL042C 1185 nt19.11■□□□□ 0.65
TYW1Q08960 ATS1YAL020C 1002 nt18.8■□□□□ 0.6
TYW1Q08960 RPP1BYDL130W 321 nt18.72■□□□□ 0.59
TYW1Q08960 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.13■□□□□ 0.49
TYW1Q08960 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.13■□□□□ 0.49
TYW1Q08960 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.13■□□□□ 0.49
TYW1Q08960 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.13■□□□□ 0.49
TYW1Q08960 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.13■□□□□ 0.49
TYW1Q08960 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.13■□□□□ 0.49
TYW1Q08960 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.13■□□□□ 0.49
TYW1Q08960 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.13■□□□□ 0.49
TYW1Q08960 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.13■□□□□ 0.49
TYW1Q08960 CCC1YLR220W 969 nt18.13■□□□□ 0.49
TYW1Q08960 SCR1SCR1 522 nt17.91■□□□□ 0.46
TYW1Q08960 PET122YER153C 765 nt17.81■□□□□ 0.44
TYW1Q08960 DBP2YNL112W 1641 nt17.76■□□□□ 0.43
TYW1Q08960 RTC3YHR087W 336 nt17.65■□□□□ 0.42
TYW1Q08960 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.44■□□□□ 0.38
TYW1Q08960 RRN5YLR141W 1092 nt17.39■□□□□ 0.37
TYW1Q08960 RSB1YOR049C 1065 nt17.32■□□□□ 0.36
TYW1Q08960 PST2YDR032C 597 nt17.24■□□□□ 0.35
TYW1Q08960 RVS167YDR388W 1449 nt17.05■□□□□ 0.32
TYW1Q08960 YKL097CYKL097C 411 nt17.05■□□□□ 0.32
TYW1Q08960 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.03■□□□□ 0.32
TYW1Q08960 YDJ1YNL064C 1230 nt16.83■□□□□ 0.28
TYW1Q08960 YBR190WYBR190W 312 nt16.7■□□□□ 0.26
TYW1Q08960 SHR5YOL110W 714 nt16.55■□□□□ 0.24
TYW1Q08960 GAR1YHR089C 618 nt16.45■□□□□ 0.22
TYW1Q08960 SHU1YHL006C 453 nt16.4■□□□□ 0.22
TYW1Q08960 Q0182Q0182 405 nt16.16■□□□□ 0.18
TYW1Q08960 YOR139CYOR139C 393 nt16.13■□□□□ 0.17
TYW1Q08960 MOT3YMR070W 1473 nt16.08■□□□□ 0.16
TYW1Q08960 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16■□□□□ 0.15
TYW1Q08960 NPL3YDR432W 1245 nt15.98■□□□□ 0.15
TYW1Q08960 DEP1YAL013W 1218 nt15.93■□□□□ 0.14
TYW1Q08960 TIR1YER011W 765 nt15.82■□□□□ 0.12
TYW1Q08960 YNL208WYNL208W 600 nt15.69■□□□□ 0.1
TYW1Q08960 URN1YPR152C 1398 nt15.66■□□□□ 0.1
TYW1Q08960 RPN10YHR200W 807 nt15.65■□□□□ 0.1
TYW1Q08960 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.46■□□□□ 0.07
TYW1Q08960 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.46■□□□□ 0.07
TYW1Q08960 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.46■□□□□ 0.07
TYW1Q08960 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.46■□□□□ 0.07
TYW1Q08960 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.46■□□□□ 0.07
TYW1Q08960 YOL037CYOL037C 354 nt15.42■□□□□ 0.06
TYW1Q08960 SSA1YAL005C 1929 nt15.42■□□□□ 0.06
TYW1Q08960 MNP1YGL068W 585 nt15.41■□□□□ 0.06
TYW1Q08960 YGR021WYGR021W 873 nt15.39■□□□□ 0.05
TYW1Q08960 BSC6YOL137W 1494 nt15.33■□□□□ 0.04
TYW1Q08960 HOM6YJR139C 1080 nt15.31■□□□□ 0.04
TYW1Q08960 WWM1YFL010C 636 nt15.25■□□□□ 0.03
TYW1Q08960 SRB2YHR041C 633 nt15.25■□□□□ 0.03
TYW1Q08960 OPI9YLR338W 858 nt15.22■□□□□ 0.03
TYW1Q08960 PUS2YGL063W 1113 nt15.17■□□□□ 0.02
TYW1Q08960 RKM5YLR137W 1104 nt15.12■□□□□ 0.01
TYW1Q08960 YJR018WYJR018W 363 nt14.99□□□□□ -0.01
TYW1Q08960 YLR281CYLR281C 468 nt14.98□□□□□ -0.01
TYW1Q08960 SAH1YER043C 1350 nt14.98□□□□□ -0.01
TYW1Q08960 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.96□□□□□ -0.01
TYW1Q08960 RPP2BYDR382W 333 nt14.95□□□□□ -0.02
TYW1Q08960 WHI5YOR083W 888 nt14.86□□□□□ -0.03
TYW1Q08960 PUN1YLR414C 792 nt14.83□□□□□ -0.04
TYW1Q08960 FMP45YDL222C 930 nt14.8□□□□□ -0.04
TYW1Q08960 MRPL8YJL063C 717 nt14.8□□□□□ -0.04
TYW1Q08960 YJR120WYJR120W 351 nt14.76□□□□□ -0.05
TYW1Q08960 BDH2YAL061W 1254 nt14.69□□□□□ -0.06
TYW1Q08960 YCH1YGR203W 447 nt14.65□□□□□ -0.06
TYW1Q08960 DSK2YMR276W 1122 nt14.64□□□□□ -0.07
TYW1Q08960 ADO1YJR105W 1023 nt14.62□□□□□ -0.07
TYW1Q08960 LSM3YLR438C-A 270 nt14.62□□□□□ -0.07
TYW1Q08960 UBX6YJL048C 1191 nt14.61□□□□□ -0.07
TYW1Q08960 YPR011CYPR011C 981 nt14.57□□□□□ -0.08
TYW1Q08960 PTC2YER089C 1395 nt14.54□□□□□ -0.08
TYW1Q08960 IMP2'YIL154C 1041 nt14.53□□□□□ -0.08
TYW1Q08960 SSA3YBL075C 1950 nt14.53□□□□□ -0.08
TYW1Q08960 PUT4YOR348C 1884 nt14.52□□□□□ -0.09
TYW1Q08960 ARE1YCR048W 1833 nt14.51□□□□□ -0.09
TYW1Q08960 YLR236CYLR236C 324 nt14.51□□□□□ -0.09
TYW1Q08960 YGR139WYGR139W 339 nt14.48□□□□□ -0.09
TYW1Q08960 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.44□□□□□ -0.1
TYW1Q08960 YEL076CYEL076C 651 nt14.44□□□□□ -0.1
TYW1Q08960 YLR464WYLR464W 651 nt14.44□□□□□ -0.1
TYW1Q08960 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.41□□□□□ -0.1
TYW1Q08960 NME1NME1 340 nt14.38□□□□□ -0.11
TYW1Q08960 YBL100CYBL100C 315 nt14.36□□□□□ -0.11
TYW1Q08960 INM2YDR287W 879 nt14.35□□□□□ -0.11
TYW1Q08960 TRM9YML014W 840 nt14.35□□□□□ -0.11
TYW1Q08960 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.34□□□□□ -0.11
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