Protein–RNA interactions for Protein: Q02710

ECM23, Protein ECM23, yeastyeast

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM23Q02710 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.66■■□□□ 1.38
ECM23Q02710 NSR1YGR159C 1245 nt23.42■■□□□ 1.34
ECM23Q02710 NOP1YDL014W 984 nt22.79■■□□□ 1.24
ECM23Q02710 MDJ1YFL016C 1536 nt21.09■□□□□ 0.97
ECM23Q02710 YKL036CYKL036C 393 nt21.04■□□□□ 0.96
ECM23Q02710 SRX1YKL086W 384 nt19.97■□□□□ 0.79
ECM23Q02710 Q0297Q0297 156 nt19.95■□□□□ 0.78
ECM23Q02710 YJL027CYJL027C 417 nt19.68■□□□□ 0.74
ECM23Q02710 SCS3YGL126W 1143 nt19.17■□□□□ 0.66
ECM23Q02710 YCR051WYCR051W 669 nt19.05■□□□□ 0.64
ECM23Q02710 DBP2YNL112W 1641 nt18.56■□□□□ 0.56
ECM23Q02710 YOL085CYOL085C 342 nt18.28■□□□□ 0.52
ECM23Q02710 PKP1YIL042C 1185 nt18.17■□□□□ 0.5
ECM23Q02710 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.12■□□□□ 0.49
ECM23Q02710 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.12■□□□□ 0.49
ECM23Q02710 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.12■□□□□ 0.49
ECM23Q02710 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.12■□□□□ 0.49
ECM23Q02710 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.12■□□□□ 0.49
ECM23Q02710 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.12■□□□□ 0.49
ECM23Q02710 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.12■□□□□ 0.49
ECM23Q02710 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.12■□□□□ 0.49
ECM23Q02710 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.12■□□□□ 0.49
ECM23Q02710 CCC1YLR220W 969 nt18.1■□□□□ 0.49
ECM23Q02710 RPP1BYDL130W 321 nt17.94■□□□□ 0.46
ECM23Q02710 YBR190WYBR190W 312 nt17.81■□□□□ 0.44
ECM23Q02710 RTC3YHR087W 336 nt17.54■□□□□ 0.4
ECM23Q02710 SCJ1YMR214W 1134 nt17.38■□□□□ 0.37
ECM23Q02710 RVS167YDR388W 1449 nt17.3■□□□□ 0.36
ECM23Q02710 PET122YER153C 765 nt17.25■□□□□ 0.35
ECM23Q02710 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.17■□□□□ 0.34
ECM23Q02710 ATS1YAL020C 1002 nt17.1■□□□□ 0.33
ECM23Q02710 SCR1SCR1 522 nt16.91■□□□□ 0.3
ECM23Q02710 RRN5YLR141W 1092 nt16.75■□□□□ 0.27
ECM23Q02710 SHR5YOL110W 714 nt16.71■□□□□ 0.27
ECM23Q02710 YDJ1YNL064C 1230 nt16.5■□□□□ 0.23
ECM23Q02710 DEP1YAL013W 1218 nt16.47■□□□□ 0.23
ECM23Q02710 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.4■□□□□ 0.22
ECM23Q02710 URN1YPR152C 1398 nt16.38■□□□□ 0.21
ECM23Q02710 RSB1YOR049C 1065 nt16.37■□□□□ 0.21
ECM23Q02710 GAR1YHR089C 618 nt16.31■□□□□ 0.2
ECM23Q02710 PUT4YOR348C 1884 nt16.3■□□□□ 0.2
ECM23Q02710 SAH1YER043C 1350 nt16.12■□□□□ 0.17
ECM23Q02710 OPI9YLR338W 858 nt16.07■□□□□ 0.16
ECM23Q02710 YNL208WYNL208W 600 nt16.01■□□□□ 0.15
ECM23Q02710 ARE1YCR048W 1833 nt16.01■□□□□ 0.15
ECM23Q02710 RPN10YHR200W 807 nt15.96■□□□□ 0.15
ECM23Q02710 POA1YBR022W 534 nt15.88■□□□□ 0.13
ECM23Q02710 PST2YDR032C 597 nt15.84■□□□□ 0.13
ECM23Q02710 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.84■□□□□ 0.13
ECM23Q02710 Q0182Q0182 405 nt15.78■□□□□ 0.12
ECM23Q02710 TIR1YER011W 765 nt15.7■□□□□ 0.1
ECM23Q02710 SSA1YAL005C 1929 nt15.58■□□□□ 0.09
ECM23Q02710 YJR018WYJR018W 363 nt15.58■□□□□ 0.08
ECM23Q02710 PUN1YLR414C 792 nt15.56■□□□□ 0.08
ECM23Q02710 MOT3YMR070W 1473 nt15.53■□□□□ 0.08
ECM23Q02710 BUD23YCR047C 828 nt15.51■□□□□ 0.07
ECM23Q02710 BSC6YOL137W 1494 nt15.51■□□□□ 0.07
ECM23Q02710 PTC2YER089C 1395 nt15.5■□□□□ 0.07
ECM23Q02710 SRB2YHR041C 633 nt15.45■□□□□ 0.06
ECM23Q02710 YJR120WYJR120W 351 nt15.42■□□□□ 0.06
ECM23Q02710 SSA3YBL075C 1950 nt15.32■□□□□ 0.04
ECM23Q02710 SHU1YHL006C 453 nt15.29■□□□□ 0.04
ECM23Q02710 NAB2YGL122C 1578 nt15.22■□□□□ 0.03
ECM23Q02710 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.2■□□□□ 0.02
ECM23Q02710 RPP2BYDR382W 333 nt15.18■□□□□ 0.02
ECM23Q02710 YKL097CYKL097C 411 nt15.17■□□□□ 0.02
ECM23Q02710 FPR4YLR449W 1179 nt15.14■□□□□ 0.01
ECM23Q02710 WWM1YFL010C 636 nt15.08■□□□□ 0
ECM23Q02710 FIS1YIL065C 468 nt15.07■□□□□ 0
ECM23Q02710 DAL1YIR027C 1383 nt15.03■□□□□ -0
ECM23Q02710 INM2YDR287W 879 nt14.95□□□□□ -0.02
ECM23Q02710 PHO4YFR034C 939 nt14.93□□□□□ -0.02
ECM23Q02710 YBL100CYBL100C 315 nt14.89□□□□□ -0.03
ECM23Q02710 BDH2YAL061W 1254 nt14.88□□□□□ -0.03
ECM23Q02710 MNP1YGL068W 585 nt14.87□□□□□ -0.03
ECM23Q02710 HOM6YJR139C 1080 nt14.82□□□□□ -0.04
ECM23Q02710 YGR021WYGR021W 873 nt14.77□□□□□ -0.05
ECM23Q02710 FUN26YAL022C 1554 nt14.72□□□□□ -0.05
ECM23Q02710 SPT5YML010W 3192 nt14.71□□□□□ -0.06
ECM23Q02710 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.68□□□□□ -0.06
ECM23Q02710 YOR139CYOR139C 393 nt14.66□□□□□ -0.06
ECM23Q02710 TRM9YML014W 840 nt14.63□□□□□ -0.07
ECM23Q02710 YPS1YLR120C 1710 nt14.63□□□□□ -0.07
ECM23Q02710 RKM5YLR137W 1104 nt14.61□□□□□ -0.07
ECM23Q02710 LSM3YLR438C-A 270 nt14.61□□□□□ -0.07
ECM23Q02710 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.53□□□□□ -0.08
ECM23Q02710 YDR095CYDR095C 411 nt14.52□□□□□ -0.09
ECM23Q02710 ALF1YNL148C 765 nt14.5□□□□□ -0.09
ECM23Q02710 MEP2YNL142W 1500 nt14.5□□□□□ -0.09
ECM23Q02710 NPL3YDR432W 1245 nt14.47□□□□□ -0.09
ECM23Q02710 CCT6YDR188W 1641 nt14.44□□□□□ -0.1
ECM23Q02710 DCW1YKL046C 1350 nt14.4□□□□□ -0.1
ECM23Q02710 YOL037CYOL037C 354 nt14.37□□□□□ -0.11
ECM23Q02710 PTP1YDL230W 1008 nt14.28□□□□□ -0.12
ECM23Q02710 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.28□□□□□ -0.12
ECM23Q02710 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.28□□□□□ -0.12
ECM23Q02710 RPP2AYOL039W 321 nt14.26□□□□□ -0.13
ECM23Q02710 SIS1YNL007C 1059 nt14.25□□□□□ -0.13
ECM23Q02710 SSA4YER103W 1929 nt14.25□□□□□ -0.13
ECM23Q02710 CAC2YML102W 1407 nt14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.6 ms