RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q02710
ECM23, Protein ECM23, yeast
Predictions only
Length
187 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ECM23
Q02710
YML009W-B
YML009W-B
477 nt
23.66
■■□□□ 1.38
ECM23
Q02710
NSR1
YGR159C
1245 nt
23.42
■■□□□ 1.34
ECM23
Q02710
NOP1
YDL014W
984 nt
22.79
■■□□□ 1.24
ECM23
Q02710
MDJ1
YFL016C
1536 nt
21.09
■□□□□ 0.97
ECM23
Q02710
YKL036C
YKL036C
393 nt
21.04
■□□□□ 0.96
ECM23
Q02710
SRX1
YKL086W
384 nt
19.97
■□□□□ 0.79
ECM23
Q02710
Q0297
Q0297
156 nt
19.95
■□□□□ 0.78
ECM23
Q02710
YJL027C
YJL027C
417 nt
19.68
■□□□□ 0.74
ECM23
Q02710
SCS3
YGL126W
1143 nt
19.17
■□□□□ 0.66
ECM23
Q02710
YCR051W
YCR051W
669 nt
19.05
■□□□□ 0.64
ECM23
Q02710
DBP2
YNL112W
1641 nt
18.56
■□□□□ 0.56
ECM23
Q02710
YOL085C
YOL085C
342 nt
18.28
■□□□□ 0.52
ECM23
Q02710
PKP1
YIL042C
1185 nt
18.17
■□□□□ 0.5
ECM23
Q02710
TRN1
tP(UGG)A
72 nt
18.12
■□□□□ 0.49
ECM23
Q02710
SUF9
tP(UGG)F
72 nt
18.12
■□□□□ 0.49
ECM23
Q02710
SUF8
tP(UGG)H
72 nt
18.12
■□□□□ 0.49
ECM23
Q02710
tP(UGG)L
tP(UGG)L
72 nt
18.12
■□□□□ 0.49
ECM23
Q02710
SUF7
tP(UGG)M
72 nt
18.12
■□□□□ 0.49
ECM23
Q02710
tP(UGG)N1
tP(UGG)N1
72 nt
18.12
■□□□□ 0.49
ECM23
Q02710
tP(UGG)N2
tP(UGG)N2
72 nt
18.12
■□□□□ 0.49
ECM23
Q02710
tP(UGG)O1
tP(UGG)O1
72 nt
18.12
■□□□□ 0.49
ECM23
Q02710
SUF11
tP(UGG)O2
72 nt
18.12
■□□□□ 0.49
ECM23
Q02710
CCC1
YLR220W
969 nt
18.1
■□□□□ 0.49
ECM23
Q02710
RPP1B
YDL130W
321 nt
17.94
■□□□□ 0.46
ECM23
Q02710
YBR190W
YBR190W
312 nt
17.81
■□□□□ 0.44
ECM23
Q02710
RTC3
YHR087W
336 nt
17.54
■□□□□ 0.4
ECM23
Q02710
SCJ1
YMR214W
1134 nt
17.38
■□□□□ 0.37
ECM23
Q02710
RVS167
YDR388W
1449 nt
17.3
■□□□□ 0.36
ECM23
Q02710
PET122
YER153C
765 nt
17.25
■□□□□ 0.35
ECM23
Q02710
tP(UGG)O3
tP(UGG)O3
72 nt
17.17
■□□□□ 0.34
ECM23
Q02710
ATS1
YAL020C
1002 nt
17.1
■□□□□ 0.33
ECM23
Q02710
SCR1
SCR1
522 nt
16.91
■□□□□ 0.3
ECM23
Q02710
RRN5
YLR141W
1092 nt
16.75
■□□□□ 0.27
ECM23
Q02710
SHR5
YOL110W
714 nt
16.71
■□□□□ 0.27
ECM23
Q02710
YDJ1
YNL064C
1230 nt
16.5
■□□□□ 0.23
ECM23
Q02710
DEP1
YAL013W
1218 nt
16.47
■□□□□ 0.23
ECM23
Q02710
YER088W-B
YER088W-B
147 nt
16.4
■□□□□ 0.22
ECM23
Q02710
URN1
YPR152C
1398 nt
16.38
■□□□□ 0.21
ECM23
Q02710
RSB1
YOR049C
1065 nt
16.37
■□□□□ 0.21
ECM23
Q02710
GAR1
YHR089C
618 nt
16.31
■□□□□ 0.2
ECM23
Q02710
PUT4
YOR348C
1884 nt
16.3
■□□□□ 0.2
ECM23
Q02710
SAH1
YER043C
1350 nt
16.12
■□□□□ 0.17
ECM23
Q02710
OPI9
YLR338W
858 nt
16.07
■□□□□ 0.16
ECM23
Q02710
YNL208W
YNL208W
600 nt
16.01
■□□□□ 0.15
ECM23
Q02710
ARE1
YCR048W
1833 nt
16.01
■□□□□ 0.15
ECM23
Q02710
RPN10
YHR200W
807 nt
15.96
■□□□□ 0.15
ECM23
Q02710
POA1
YBR022W
534 nt
15.88
■□□□□ 0.13
ECM23
Q02710
PST2
YDR032C
597 nt
15.84
■□□□□ 0.13
ECM23
Q02710
YHR049C-A
YHR049C-A
297 nt
15.84
■□□□□ 0.13
ECM23
Q02710
Q0182
Q0182
405 nt
15.78
■□□□□ 0.12
ECM23
Q02710
TIR1
YER011W
765 nt
15.7
■□□□□ 0.1
ECM23
Q02710
SSA1
YAL005C
1929 nt
15.58
■□□□□ 0.09
ECM23
Q02710
YJR018W
YJR018W
363 nt
15.58
■□□□□ 0.08
ECM23
Q02710
PUN1
YLR414C
792 nt
15.56
■□□□□ 0.08
ECM23
Q02710
MOT3
YMR070W
1473 nt
15.53
■□□□□ 0.08
ECM23
Q02710
BUD23
YCR047C
828 nt
15.51
■□□□□ 0.07
ECM23
Q02710
BSC6
YOL137W
1494 nt
15.51
■□□□□ 0.07
ECM23
Q02710
PTC2
YER089C
1395 nt
15.5
■□□□□ 0.07
ECM23
Q02710
SRB2
YHR041C
633 nt
15.45
■□□□□ 0.06
ECM23
Q02710
YJR120W
YJR120W
351 nt
15.42
■□□□□ 0.06
ECM23
Q02710
SSA3
YBL075C
1950 nt
15.32
■□□□□ 0.04
ECM23
Q02710
SHU1
YHL006C
453 nt
15.29
■□□□□ 0.04
ECM23
Q02710
NAB2
YGL122C
1578 nt
15.22
■□□□□ 0.03
ECM23
Q02710
YAL037C-B
YAL037C-B
975 nt
15.2
■□□□□ 0.02
ECM23
Q02710
RPP2B
YDR382W
333 nt
15.18
■□□□□ 0.02
ECM23
Q02710
YKL097C
YKL097C
411 nt
15.17
■□□□□ 0.02
ECM23
Q02710
FPR4
YLR449W
1179 nt
15.14
■□□□□ 0.01
ECM23
Q02710
WWM1
YFL010C
636 nt
15.08
■□□□□ 0
ECM23
Q02710
FIS1
YIL065C
468 nt
15.07
■□□□□ 0
ECM23
Q02710
DAL1
YIR027C
1383 nt
15.03
■□□□□ -0
ECM23
Q02710
INM2
YDR287W
879 nt
14.95
□□□□□ -0.02
ECM23
Q02710
PHO4
YFR034C
939 nt
14.93
□□□□□ -0.02
ECM23
Q02710
YBL100C
YBL100C
315 nt
14.89
□□□□□ -0.03
ECM23
Q02710
BDH2
YAL061W
1254 nt
14.88
□□□□□ -0.03
ECM23
Q02710
MNP1
YGL068W
585 nt
14.87
□□□□□ -0.03
ECM23
Q02710
HOM6
YJR139C
1080 nt
14.82
□□□□□ -0.04
ECM23
Q02710
YGR021W
YGR021W
873 nt
14.77
□□□□□ -0.05
ECM23
Q02710
FUN26
YAL022C
1554 nt
14.72
□□□□□ -0.05
ECM23
Q02710
SPT5
YML010W
3192 nt
14.71
□□□□□ -0.06
ECM23
Q02710
YFL021C-A
YFL021C-A
855 nt
14.68
□□□□□ -0.06
ECM23
Q02710
YOR139C
YOR139C
393 nt
14.66
□□□□□ -0.06
ECM23
Q02710
TRM9
YML014W
840 nt
14.63
□□□□□ -0.07
ECM23
Q02710
YPS1
YLR120C
1710 nt
14.63
□□□□□ -0.07
ECM23
Q02710
RKM5
YLR137W
1104 nt
14.61
□□□□□ -0.07
ECM23
Q02710
LSM3
YLR438C-A
270 nt
14.61
□□□□□ -0.07
ECM23
Q02710
YHR165W-A
YHR165W-A
312 nt
14.53
□□□□□ -0.08
ECM23
Q02710
YDR095C
YDR095C
411 nt
14.52
□□□□□ -0.09
ECM23
Q02710
ALF1
YNL148C
765 nt
14.5
□□□□□ -0.09
ECM23
Q02710
MEP2
YNL142W
1500 nt
14.5
□□□□□ -0.09
ECM23
Q02710
NPL3
YDR432W
1245 nt
14.47
□□□□□ -0.09
ECM23
Q02710
CCT6
YDR188W
1641 nt
14.44
□□□□□ -0.1
ECM23
Q02710
DCW1
YKL046C
1350 nt
14.4
□□□□□ -0.1
ECM23
Q02710
YOL037C
YOL037C
354 nt
14.37
□□□□□ -0.11
ECM23
Q02710
PTP1
YDL230W
1008 nt
14.28
□□□□□ -0.12
ECM23
Q02710
SUF2
tP(AGG)C
72 nt
14.28
□□□□□ -0.12
ECM23
Q02710
SUF10
tP(AGG)N
72 nt
14.28
□□□□□ -0.12
ECM23
Q02710
RPP2A
YOL039W
321 nt
14.26
□□□□□ -0.13
ECM23
Q02710
SIS1
YNL007C
1059 nt
14.25
□□□□□ -0.13
ECM23
Q02710
SSA4
YER103W
1929 nt
14.25
□□□□□ -0.13
ECM23
Q02710
CAC2
YML102W
1407 nt
14.23
□□□□□ -0.13
First
Previous
1
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.7 ms