Protein–RNA interactions for Protein: Q12263

GIN4, Serine/threonine-protein kinase GIN4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIN4Q12263 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.81■■□□□ 1.4
GIN4Q12263 NOP1YDL014W 984 nt23.38■■□□□ 1.33
GIN4Q12263 NSR1YGR159C 1245 nt23.2■■□□□ 1.3
GIN4Q12263 YKL036CYKL036C 393 nt22.07■■□□□ 1.12
GIN4Q12263 YJL027CYJL027C 417 nt20.7■□□□□ 0.9
GIN4Q12263 Q0297Q0297 156 nt20.63■□□□□ 0.89
GIN4Q12263 SRX1YKL086W 384 nt20.42■□□□□ 0.86
GIN4Q12263 SCS3YGL126W 1143 nt20.35■□□□□ 0.85
GIN4Q12263 MDJ1YFL016C 1536 nt20.07■□□□□ 0.8
GIN4Q12263 YCR051WYCR051W 669 nt19.41■□□□□ 0.7
GIN4Q12263 YOL085CYOL085C 342 nt19.08■□□□□ 0.64
GIN4Q12263 SCJ1YMR214W 1134 nt18.73■□□□□ 0.59
GIN4Q12263 PKP1YIL042C 1185 nt18.72■□□□□ 0.59
GIN4Q12263 RPP1BYDL130W 321 nt18.51■□□□□ 0.55
GIN4Q12263 ATS1YAL020C 1002 nt18.35■□□□□ 0.53
GIN4Q12263 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.15■□□□□ 0.5
GIN4Q12263 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.15■□□□□ 0.5
GIN4Q12263 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.15■□□□□ 0.5
GIN4Q12263 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.15■□□□□ 0.5
GIN4Q12263 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.15■□□□□ 0.5
GIN4Q12263 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.15■□□□□ 0.5
GIN4Q12263 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.15■□□□□ 0.5
GIN4Q12263 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.15■□□□□ 0.5
GIN4Q12263 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.15■□□□□ 0.5
GIN4Q12263 DBP2YNL112W 1641 nt17.97■□□□□ 0.47
GIN4Q12263 CCC1YLR220W 969 nt17.96■□□□□ 0.47
GIN4Q12263 PET122YER153C 765 nt17.61■□□□□ 0.41
GIN4Q12263 SCR1SCR1 522 nt17.6■□□□□ 0.41
GIN4Q12263 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.34■□□□□ 0.37
GIN4Q12263 RRN5YLR141W 1092 nt17.16■□□□□ 0.34
GIN4Q12263 RVS167YDR388W 1449 nt17.06■□□□□ 0.32
GIN4Q12263 RTC3YHR087W 336 nt17.01■□□□□ 0.31
GIN4Q12263 YBR190WYBR190W 312 nt16.99■□□□□ 0.31
GIN4Q12263 RSB1YOR049C 1065 nt16.98■□□□□ 0.31
GIN4Q12263 PST2YDR032C 597 nt16.9■□□□□ 0.3
GIN4Q12263 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.83■□□□□ 0.28
GIN4Q12263 YDJ1YNL064C 1230 nt16.77■□□□□ 0.28
GIN4Q12263 SHR5YOL110W 714 nt16.58■□□□□ 0.24
GIN4Q12263 YKL097CYKL097C 411 nt16.53■□□□□ 0.24
GIN4Q12263 SSA3YBL075C 1950 nt16.33■□□□□ 0.21
GIN4Q12263 GAR1YHR089C 618 nt16.31■□□□□ 0.2
GIN4Q12263 SHU1YHL006C 453 nt16.08■□□□□ 0.16
GIN4Q12263 DEP1YAL013W 1218 nt15.91■□□□□ 0.14
GIN4Q12263 URN1YPR152C 1398 nt15.77■□□□□ 0.12
GIN4Q12263 YOR139CYOR139C 393 nt15.75■□□□□ 0.11
GIN4Q12263 TIR1YER011W 765 nt15.74■□□□□ 0.11
GIN4Q12263 YNL208WYNL208W 600 nt15.74■□□□□ 0.11
GIN4Q12263 RPN10YHR200W 807 nt15.7■□□□□ 0.1
GIN4Q12263 PUT4YOR348C 1884 nt15.67■□□□□ 0.1
GIN4Q12263 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.66■□□□□ 0.1
GIN4Q12263 NPL3YDR432W 1245 nt15.53■□□□□ 0.08
GIN4Q12263 OPI9YLR338W 858 nt15.43■□□□□ 0.06
GIN4Q12263 SSA1YAL005C 1929 nt15.43■□□□□ 0.06
GIN4Q12263 Q0182Q0182 405 nt15.38■□□□□ 0.05
GIN4Q12263 SRB2YHR041C 633 nt15.25■□□□□ 0.03
GIN4Q12263 YGR021WYGR021W 873 nt15.24■□□□□ 0.03
GIN4Q12263 HOM6YJR139C 1080 nt15.2■□□□□ 0.02
GIN4Q12263 MNP1YGL068W 585 nt15.19■□□□□ 0.02
GIN4Q12263 SAH1YER043C 1350 nt15.19■□□□□ 0.02
GIN4Q12263 YOL037CYOL037C 354 nt15.18■□□□□ 0.02
GIN4Q12263 ARE1YCR048W 1833 nt15.16■□□□□ 0.02
GIN4Q12263 WWM1YFL010C 636 nt15.13■□□□□ 0.01
GIN4Q12263 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.1■□□□□ 0.01
GIN4Q12263 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.1■□□□□ 0.01
GIN4Q12263 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.1■□□□□ 0.01
GIN4Q12263 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.1■□□□□ 0.01
GIN4Q12263 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.1■□□□□ 0.01
GIN4Q12263 POA1YBR022W 534 nt15.1■□□□□ 0.01
GIN4Q12263 YJR018WYJR018W 363 nt15.09■□□□□ 0.01
GIN4Q12263 PUN1YLR414C 792 nt15.01□□□□□ -0.01
GIN4Q12263 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.97□□□□□ -0.01
GIN4Q12263 RKM5YLR137W 1104 nt14.97□□□□□ -0.01
GIN4Q12263 RPP2BYDR382W 333 nt14.95□□□□□ -0.02
GIN4Q12263 YJR120WYJR120W 351 nt14.95□□□□□ -0.02
GIN4Q12263 BSC6YOL137W 1494 nt14.91□□□□□ -0.02
GIN4Q12263 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.9□□□□□ -0.02
GIN4Q12263 PUS2YGL063W 1113 nt14.8□□□□□ -0.04
GIN4Q12263 YLR281CYLR281C 468 nt14.76□□□□□ -0.05
GIN4Q12263 SPT5YML010W 3192 nt14.76□□□□□ -0.05
GIN4Q12263 MOT3YMR070W 1473 nt14.74□□□□□ -0.05
GIN4Q12263 BDH2YAL061W 1254 nt14.73□□□□□ -0.05
GIN4Q12263 PTC2YER089C 1395 nt14.71□□□□□ -0.06
GIN4Q12263 LSM3YLR438C-A 270 nt14.64□□□□□ -0.07
GIN4Q12263 WHI5YOR083W 888 nt14.64□□□□□ -0.07
GIN4Q12263 SSA4YER103W 1929 nt14.57□□□□□ -0.08
GIN4Q12263 BUD23YCR047C 828 nt14.56□□□□□ -0.08
GIN4Q12263 INM2YDR287W 879 nt14.49□□□□□ -0.09
GIN4Q12263 NAB2YGL122C 1578 nt14.45□□□□□ -0.1
GIN4Q12263 FMP45YDL222C 930 nt14.44□□□□□ -0.1
GIN4Q12263 YBL100CYBL100C 315 nt14.44□□□□□ -0.1
GIN4Q12263 DSK2YMR276W 1122 nt14.4□□□□□ -0.1
GIN4Q12263 DAL1YIR027C 1383 nt14.37□□□□□ -0.11
GIN4Q12263 MRPL8YJL063C 717 nt14.37□□□□□ -0.11
GIN4Q12263 TRM9YML014W 840 nt14.36□□□□□ -0.11
GIN4Q12263 YPR011CYPR011C 981 nt14.36□□□□□ -0.11
GIN4Q12263 IMP2'YIL154C 1041 nt14.35□□□□□ -0.11
GIN4Q12263 FPR4YLR449W 1179 nt14.34□□□□□ -0.11
GIN4Q12263 YCH1YGR203W 447 nt14.33□□□□□ -0.12
GIN4Q12263 YLR236CYLR236C 324 nt14.32□□□□□ -0.12
GIN4Q12263 FIS1YIL065C 468 nt14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms