RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W ARG82P07250 355 aa10.44□□□□□ -0.74
DDI1YER143W GEF1P37020 779 aa10.44□□□□□ -0.74
DDI1YER143W IRC8P47046 822 aa10.44□□□□□ -0.74
DDI1YER143W PPM2Q08282 695 aa10.44□□□□□ -0.74
DDI1YER143W RAM2P29703 316 aa10.43□□□□□ -0.74
DDI1YER143W SHC1P39000 512 aa10.43□□□□□ -0.74
DDI1YER143W IOC3P43596 787 aa10.43□□□□□ -0.74
DDI1YER143W JJJ2P46997 583 aa10.43□□□□□ -0.74
DDI1YER143W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
DDI1YER143W RNR2P09938 399 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
DDI1YER143W SRS2P12954 1174 aa10.42□□□□□ -0.74
DDI1YER143W BOI1P38041 980 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
DDI1YER143W GSM1P42950 618 aa10.42□□□□□ -0.74
DDI1YER143W GSC2P40989 1895 aa10.41□□□□□ -0.74
DDI1YER143W COQ1P18900 473 aa10.41□□□□□ -0.74
DDI1YER143W RTG1P32607 177 aa10.41□□□□□ -0.74
DDI1YER143W MET1P36150 593 aa10.41□□□□□ -0.74
DDI1YER143W NSG2P53898 299 aa10.41□□□□□ -0.74
DDI1YER143W PGA3Q12746 312 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
DDI1YER143W TOP1P04786 769 aa10.4□□□□□ -0.74
DDI1YER143W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
DDI1YER143W MAK11P20484 414 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
DDI1YER143W SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data10.4□□□□□ -0.74not detected
DDI1YER143W CIC1P38779 376 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
DDI1YER143W SPO22P40511 975 aa10.4□□□□□ -0.74
DDI1YER143W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
DDI1YER143W ECM23Q02710 187 aa10.4□□□□□ -0.74
DDI1YER143W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
DDI1YER143W CHO2P05374 869 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
DDI1YER143W TPM1P17536 199 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
DDI1YER143W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
DDI1YER143W ENP2P48234 707 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
DDI1YER143W SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
DDI1YER143W BMT6Q12291 365 aa10.39□□□□□ -0.75
DDI1YER143W PEP3P27801 918 aa10.38□□□□□ -0.75
DDI1YER143W MDL2P33311 773 aa10.38□□□□□ -0.75
DDI1YER143W NPA3P47122 385 aa10.38□□□□□ -0.75
DDI1YER143W AFG2P32794 780 aa10.37□□□□□ -0.75
DDI1YER143W YHL050CP38721 697 aa10.37□□□□□ -0.75
DDI1YER143W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data10.37□□□□□ -0.75not detected
DDI1YER143W APL6P46682 809 aa10.37□□□□□ -0.75
DDI1YER143W VPS20Q04272 221 aa10.37□□□□□ -0.75
DDI1YER143W ATG20Q07528 640 aa10.37□□□□□ -0.75
DDI1YER143W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
DDI1YER143W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
DDI1YER143W SEC61P32915 480 aa10.36□□□□□ -0.75
DDI1YER143W KRI1P42846 591 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
DDI1YER143W PUS6P53294 404 aa10.35□□□□□ -0.75
DDI1YER143W FPK1P53739 893 aa10.35□□□□□ -0.75
DDI1YER143W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
DDI1YER143W NCR1Q12200 1170 aa10.35□□□□□ -0.75
DDI1YER143W IMP2'P32351 346 aa10.34□□□□□ -0.75
DDI1YER143W STV1P37296 890 aa10.34□□□□□ -0.75
DDI1YER143W RTS1P38903 757 aa10.34□□□□□ -0.75
DDI1YER143W UTP7P40055 554 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
DDI1YER143W VID28P40547 921 aa10.34□□□□□ -0.75
DDI1YER143W PIP2P52960 996 aa10.34□□□□□ -0.75
DDI1YER143W SQS1P53866 767 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
DDI1YER143W RPS15Q01855 142 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
DDI1YER143W SSA1P10591 642 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
DDI1YER143W FBP26P32604 452 aa10.33□□□□□ -0.76
DDI1YER143W RER2P35196 286 aa10.33□□□□□ -0.76
DDI1YER143W MYO3P36006 1272 aa10.33□□□□□ -0.76
DDI1YER143W MTC3P53077 123 aa10.33□□□□□ -0.76
DDI1YER143W HDA1P53973 706 aa10.33□□□□□ -0.76
DDI1YER143W UFD2P54860 961 aa10.33□□□□□ -0.76
DDI1YER143W MATALPHA2P0CY08 210 aa10.32□□□□□ -0.76
DDI1YER143W HMLALPHA2P0CY09 210 aa10.32□□□□□ -0.76
DDI1YER143W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
DDI1YER143W VPS24P36095 224 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
DDI1YER143W JIP4Q03361 876 aa10.32□□□□□ -0.76
DDI1YER143W HTA1P04911 132 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
DDI1YER143W HTA2P04912 132 aa10.31□□□□□ -0.76
DDI1YER143W MSM1P22438 575 aa10.31□□□□□ -0.76
DDI1YER143W RRP8P38961 392 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
DDI1YER143W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
DDI1YER143W PTK2P47116 818 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
DDI1YER143W CRF1Q04930 467 aa10.31□□□□□ -0.76
DDI1YER143W YPL260WQ08977 551 aa10.31□□□□□ -0.76
DDI1YER143W DCW1P36091 449 aa10.3□□□□□ -0.76
DDI1YER143W CTF18P49956 741 aa10.3□□□□□ -0.76
DDI1YER143W VPS4P52917 437 aa10.3□□□□□ -0.76
DDI1YER143W YLR407WQ06070 228 aa10.3□□□□□ -0.76
DDI1YER143W RAD61Q99359 647 aa10.3□□□□□ -0.76
DDI1YER143W YLR278CQ05854 1341 aa10.3□□□□□ -0.76
DDI1YER143W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
DDI1YER143W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
DDI1YER143W ANP1P32629 500 aa10.29□□□□□ -0.76
DDI1YER143W DJP1P40564 432 aa10.29□□□□□ -0.76
DDI1YER143W DAN4P47179 1161 aa10.29□□□□□ -0.76
DDI1YER143W TRM44Q02648 567 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
DDI1YER143W HRQ1Q05549 1077 aa10.29□□□□□ -0.76
DDI1YER143W EST2Q06163 884 aa10.29□□□□□ -0.76
DDI1YER143W ESF1Q06344 628 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
DDI1YER143W PRO3P32263 286 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
DDI1YER143W GLC3P32775 704 aa10.28□□□□□ -0.76
DDI1YER143W VID27P40157 782 aa10.28□□□□□ -0.76
DDI1YER143W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
DDI1YER143W TFC6Q06339 672 aa10.28□□□□□ -0.76
DDI1YER143W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.5 ms