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Protein–RNA interactions for Protein: P53739
FPK1, Flippase kinase 1, yeast
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893 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
FPK1
P53739
YML009W-B
YML009W-B
477 nt
24.77
■■□□□ 1.56
FPK1
P53739
NOP1
YDL014W
984 nt
24.42
■■□□□ 1.5
FPK1
P53739
NSR1
YGR159C
1245 nt
23.89
■■□□□ 1.41
FPK1
P53739
YKL036C
YKL036C
393 nt
23.23
■■□□□ 1.31
FPK1
P53739
YJL027C
YJL027C
417 nt
21.87
■■□□□ 1.09
FPK1
P53739
Q0297
Q0297
156 nt
21.56
■■□□□ 1.04
FPK1
P53739
SCS3
YGL126W
1143 nt
21.52
■■□□□ 1.04
FPK1
P53739
SRX1
YKL086W
384 nt
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■■□□□ 1
FPK1
P53739
MDJ1
YFL016C
1536 nt
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FPK1
P53739
YCR051W
YCR051W
669 nt
20.32
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FPK1
P53739
YOL085C
YOL085C
342 nt
20.07
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FPK1
P53739
SCJ1
YMR214W
1134 nt
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FPK1
P53739
PKP1
YIL042C
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FPK1
P53739
ATS1
YAL020C
1002 nt
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FPK1
P53739
RPP1B
YDL130W
321 nt
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FPK1
P53739
TRN1
tP(UGG)A
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FPK1
P53739
SUF9
tP(UGG)F
72 nt
18.76
■□□□□ 0.59
FPK1
P53739
SUF8
tP(UGG)H
72 nt
18.76
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FPK1
P53739
tP(UGG)L
tP(UGG)L
72 nt
18.76
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FPK1
P53739
SUF7
tP(UGG)M
72 nt
18.76
■□□□□ 0.59
FPK1
P53739
tP(UGG)N1
tP(UGG)N1
72 nt
18.76
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FPK1
P53739
tP(UGG)N2
tP(UGG)N2
72 nt
18.76
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FPK1
P53739
tP(UGG)O1
tP(UGG)O1
72 nt
18.76
■□□□□ 0.59
FPK1
P53739
SUF11
tP(UGG)O2
72 nt
18.76
■□□□□ 0.59
FPK1
P53739
CCC1
YLR220W
969 nt
18.67
■□□□□ 0.58
FPK1
P53739
SCR1
SCR1
522 nt
18.49
■□□□□ 0.55
FPK1
P53739
PET122
YER153C
765 nt
18.41
■□□□□ 0.54
FPK1
P53739
DBP2
YNL112W
1641 nt
18.37
■□□□□ 0.53
FPK1
P53739
RTC3
YHR087W
336 nt
18.25
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FPK1
P53739
tP(UGG)O3
tP(UGG)O3
72 nt
18.03
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FPK1
P53739
RRN5
YLR141W
1092 nt
17.97
■□□□□ 0.47
FPK1
P53739
RSB1
YOR049C
1065 nt
17.88
■□□□□ 0.45
FPK1
P53739
PST2
YDR032C
597 nt
17.87
■□□□□ 0.45
FPK1
P53739
YKL097C
YKL097C
411 nt
17.64
■□□□□ 0.41
FPK1
P53739
YER088W-B
YER088W-B
147 nt
17.61
■□□□□ 0.41
FPK1
P53739
RVS167
YDR388W
1449 nt
17.58
■□□□□ 0.41
FPK1
P53739
YDJ1
YNL064C
1230 nt
17.42
■□□□□ 0.38
FPK1
P53739
YBR190W
YBR190W
312 nt
17.24
■□□□□ 0.35
FPK1
P53739
SHR5
YOL110W
714 nt
17.1
■□□□□ 0.33
FPK1
P53739
SHU1
YHL006C
453 nt
16.97
■□□□□ 0.31
FPK1
P53739
GAR1
YHR089C
618 nt
16.95
■□□□□ 0.3
FPK1
P53739
YOR139C
YOR139C
393 nt
16.71
■□□□□ 0.27
FPK1
P53739
NPL3
YDR432W
1245 nt
16.5
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FPK1
P53739
YAL037C-B
YAL037C-B
975 nt
16.49
■□□□□ 0.23
FPK1
P53739
DEP1
YAL013W
1218 nt
16.39
■□□□□ 0.21
FPK1
P53739
TIR1
YER011W
765 nt
16.33
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FPK1
P53739
YNL208W
YNL208W
600 nt
16.21
■□□□□ 0.19
FPK1
P53739
URN1
YPR152C
1398 nt
16.15
■□□□□ 0.18
FPK1
P53739
RPN10
YHR200W
807 nt
16.13
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FPK1
P53739
tM(CAU)C
tM(CAU)C
72 nt
16.02
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FPK1
P53739
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tM(CAU)E
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16.02
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FPK1
P53739
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FPK1
P53739
IMT1
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16.02
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FPK1
P53739
IMT2
tM(CAU)P
72 nt
16.02
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FPK1
P53739
YOL037C
YOL037C
354 nt
15.97
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FPK1
P53739
SSA1
YAL005C
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FPK1
P53739
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FPK1
P53739
YGR021W
YGR021W
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15.91
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FPK1
P53739
Q0182
Q0182
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FPK1
P53739
HOM6
YJR139C
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15.86
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FPK1
P53739
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YOL137W
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FPK1
P53739
SRB2
YHR041C
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FPK1
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YMR070W
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FPK1
P53739
WWM1
YFL010C
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FPK1
P53739
OPI9
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858 nt
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FPK1
P53739
PUS2
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FPK1
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FPK1
P53739
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YLR281C
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FPK1
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YFL021C-A
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FPK1
P53739
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YJR018W
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FPK1
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FPK1
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P53739
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WHI5
YOR083W
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FPK1
P53739
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P53739
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FPK1
P53739
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YJR120W
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15.28
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FPK1
P53739
BDH2
YAL061W
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FPK1
P53739
YCH1
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FPK1
P53739
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FPK1
P53739
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YJL048C
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FPK1
P53739
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YMR276W
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FPK1
P53739
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FPK1
P53739
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FPK1
P53739
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YPR011C
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FPK1
P53739
IMP2'
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FPK1
P53739
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YLR236C
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■□□□□ -0
FPK1
P53739
PUT4
YOR348C
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15
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FPK1
P53739
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YEL076C-A
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FPK1
P53739
YEL076C
YEL076C
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□□□□□ -0.01
FPK1
P53739
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YLR464W
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FPK1
P53739
ARE1
YCR048W
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FPK1
P53739
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FPK1
P53739
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YHR049C-A
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FPK1
P53739
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YLR154C-G
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FPK1
P53739
INM2
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879 nt
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FPK1
P53739
YBL100C
YBL100C
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14.8
□□□□□ -0.04
FPK1
P53739
TRM9
YML014W
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14.79
□□□□□ -0.04
FPK1
P53739
SIS1
YNL007C
1059 nt
14.78
□□□□□ -0.04
FPK1
P53739
RTG1
YOL067C
534 nt
14.76
□□□□□ -0.05
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