Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 NSR1YGR159C 1245 nt23.25■■□□□ 1.31
HRQ1Q05549 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.14■■□□□ 1.29
HRQ1Q05549 NOP1YDL014W 984 nt22.24■■□□□ 1.15
HRQ1Q05549 MDJ1YFL016C 1536 nt21.13■□□□□ 0.97
HRQ1Q05549 YKL036CYKL036C 393 nt20.22■□□□□ 0.83
HRQ1Q05549 SRX1YKL086W 384 nt19.47■□□□□ 0.71
HRQ1Q05549 Q0297Q0297 156 nt19.38■□□□□ 0.69
HRQ1Q05549 YJL027CYJL027C 417 nt19.38■□□□□ 0.69
HRQ1Q05549 DBP2YNL112W 1641 nt18.53■□□□□ 0.56
HRQ1Q05549 YCR051WYCR051W 669 nt18.5■□□□□ 0.55
HRQ1Q05549 SCS3YGL126W 1143 nt18.26■□□□□ 0.51
HRQ1Q05549 YBR190WYBR190W 312 nt18.01■□□□□ 0.47
HRQ1Q05549 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.85■□□□□ 0.45
HRQ1Q05549 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.85■□□□□ 0.45
HRQ1Q05549 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.85■□□□□ 0.45
HRQ1Q05549 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.85■□□□□ 0.45
HRQ1Q05549 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.85■□□□□ 0.45
HRQ1Q05549 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.85■□□□□ 0.45
HRQ1Q05549 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.85■□□□□ 0.45
HRQ1Q05549 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.85■□□□□ 0.45
HRQ1Q05549 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.85■□□□□ 0.45
HRQ1Q05549 CCC1YLR220W 969 nt17.74■□□□□ 0.43
HRQ1Q05549 RTC3YHR087W 336 nt17.64■□□□□ 0.41
HRQ1Q05549 YOL085CYOL085C 342 nt17.57■□□□□ 0.4
HRQ1Q05549 PKP1YIL042C 1185 nt17.42■□□□□ 0.38
HRQ1Q05549 RPP1BYDL130W 321 nt17.41■□□□□ 0.38
HRQ1Q05549 RVS167YDR388W 1449 nt17.2■□□□□ 0.34
HRQ1Q05549 SCJ1YMR214W 1134 nt17.19■□□□□ 0.34
HRQ1Q05549 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.77■□□□□ 0.28
HRQ1Q05549 PET122YER153C 765 nt16.74■□□□□ 0.27
HRQ1Q05549 PUT4YOR348C 1884 nt16.71■□□□□ 0.27
HRQ1Q05549 SHR5YOL110W 714 nt16.56■□□□□ 0.24
HRQ1Q05549 SSA3YBL075C 1950 nt16.5■□□□□ 0.23
HRQ1Q05549 URN1YPR152C 1398 nt16.38■□□□□ 0.21
HRQ1Q05549 SCR1SCR1 522 nt16.34■□□□□ 0.21
HRQ1Q05549 DEP1YAL013W 1218 nt16.33■□□□□ 0.2
HRQ1Q05549 ARE1YCR048W 1833 nt16.31■□□□□ 0.2
HRQ1Q05549 SAH1YER043C 1350 nt16.25■□□□□ 0.19
HRQ1Q05549 ATS1YAL020C 1002 nt16.21■□□□□ 0.19
HRQ1Q05549 RRN5YLR141W 1092 nt16.21■□□□□ 0.19
HRQ1Q05549 OPI9YLR338W 858 nt16.19■□□□□ 0.18
HRQ1Q05549 YDJ1YNL064C 1230 nt16.18■□□□□ 0.18
HRQ1Q05549 POA1YBR022W 534 nt16.18■□□□□ 0.18
HRQ1Q05549 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.09■□□□□ 0.17
HRQ1Q05549 GAR1YHR089C 618 nt15.96■□□□□ 0.15
HRQ1Q05549 RPN10YHR200W 807 nt15.94■□□□□ 0.14
HRQ1Q05549 YNL208WYNL208W 600 nt15.91■□□□□ 0.14
HRQ1Q05549 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.88■□□□□ 0.13
HRQ1Q05549 BSC6YOL137W 1494 nt15.88■□□□□ 0.13
HRQ1Q05549 RSB1YOR049C 1065 nt15.74■□□□□ 0.11
HRQ1Q05549 BUD23YCR047C 828 nt15.7■□□□□ 0.1
HRQ1Q05549 PUN1YLR414C 792 nt15.67■□□□□ 0.1
HRQ1Q05549 PTC2YER089C 1395 nt15.62■□□□□ 0.09
HRQ1Q05549 YJR018WYJR018W 363 nt15.58■□□□□ 0.08
HRQ1Q05549 SPT5YML010W 3192 nt15.43■□□□□ 0.06
HRQ1Q05549 TIR1YER011W 765 nt15.42■□□□□ 0.06
HRQ1Q05549 NAB2YGL122C 1578 nt15.41■□□□□ 0.06
HRQ1Q05549 SSA1YAL005C 1929 nt15.36■□□□□ 0.05
HRQ1Q05549 YJR120WYJR120W 351 nt15.35■□□□□ 0.05
HRQ1Q05549 FIS1YIL065C 468 nt15.22■□□□□ 0.03
HRQ1Q05549 FPR4YLR449W 1179 nt15.16■□□□□ 0.02
HRQ1Q05549 DAL1YIR027C 1383 nt15.15■□□□□ 0.02
HRQ1Q05549 SRB2YHR041C 633 nt15.13■□□□□ 0.01
HRQ1Q05549 PST2YDR032C 597 nt15.09■□□□□ 0.01
HRQ1Q05549 RPP2BYDR382W 333 nt15.09■□□□□ 0.01
HRQ1Q05549 PHO4YFR034C 939 nt15.04■□□□□ -0
HRQ1Q05549 SSA4YER103W 1929 nt15.04■□□□□ -0
HRQ1Q05549 INM2YDR287W 879 nt15.02■□□□□ -0
HRQ1Q05549 MEP2YNL142W 1500 nt14.92□□□□□ -0.02
HRQ1Q05549 YPS1YLR120C 1710 nt14.88□□□□□ -0.03
HRQ1Q05549 YBL100CYBL100C 315 nt14.86□□□□□ -0.03
HRQ1Q05549 DCW1YKL046C 1350 nt14.77□□□□□ -0.04
HRQ1Q05549 BDH2YAL061W 1254 nt14.77□□□□□ -0.05
HRQ1Q05549 WWM1YFL010C 636 nt14.73□□□□□ -0.05
HRQ1Q05549 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.73□□□□□ -0.05
HRQ1Q05549 YDR095CYDR095C 411 nt14.71□□□□□ -0.05
HRQ1Q05549 FUN26YAL022C 1554 nt14.69□□□□□ -0.06
HRQ1Q05549 SHU1YHL006C 453 nt14.6□□□□□ -0.07
HRQ1Q05549 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.56□□□□□ -0.08
HRQ1Q05549 TRM9YML014W 840 nt14.55□□□□□ -0.08
HRQ1Q05549 ALF1YNL148C 765 nt14.51□□□□□ -0.09
HRQ1Q05549 EMI2YDR516C 1503 nt14.5□□□□□ -0.09
HRQ1Q05549 BDF1YLR399C 2061 nt14.5□□□□□ -0.09
HRQ1Q05549 PTP1YDL230W 1008 nt14.49□□□□□ -0.09
HRQ1Q05549 LSM3YLR438C-A 270 nt14.47□□□□□ -0.09
HRQ1Q05549 CAC2YML102W 1407 nt14.47□□□□□ -0.09
HRQ1Q05549 RPP2AYOL039W 321 nt14.43□□□□□ -0.1
HRQ1Q05549 CCT6YDR188W 1641 nt14.43□□□□□ -0.1
HRQ1Q05549 HOM6YJR139C 1080 nt14.4□□□□□ -0.1
HRQ1Q05549 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.39□□□□□ -0.11
HRQ1Q05549 YGR021WYGR021W 873 nt14.39□□□□□ -0.11
HRQ1Q05549 YBR220CYBR220C 1683 nt14.36□□□□□ -0.11
HRQ1Q05549 YDL221WYDL221W 552 nt14.35□□□□□ -0.11
HRQ1Q05549 MNP1YGL068W 585 nt14.35□□□□□ -0.11
HRQ1Q05549 SIS1YNL007C 1059 nt14.33□□□□□ -0.12
HRQ1Q05549 YMR090WYMR090W 684 nt14.32□□□□□ -0.12
HRQ1Q05549 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.27□□□□□ -0.13
HRQ1Q05549 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.27□□□□□ -0.13
HRQ1Q05549 TAT1YBR069C 1860 nt14.27□□□□□ -0.13
HRQ1Q05549 YKL097CYKL097C 411 nt14.25□□□□□ -0.13
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