RNA–Protein interactions for RNA: YKL209C

STE6, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene STE6, Length 3,873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE6	YKL209C	RTG3	P38165	486 aa		4.04	□□□□□ -1.76
STE6	YKL209C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
STE6	YKL209C	YKU70	P32807	602 aa		4.03	□□□□□ -1.76
STE6	YKL209C	MSM1	P22438	575 aa		4.03	□□□□□ -1.76
STE6	YKL209C	VHR2	P40041	505 aa		4.03	□□□□□ -1.76
STE6	YKL209C	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
STE6	YKL209C	NSE3	Q05541	303 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	MDG1	P53885	366 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	RSF2	P46974	1380 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	BDF2	Q07442	638 aa		4.02	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	RAD4	P14736	754 aa		4	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	IML1	P47170	1584 aa		4	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	GSM1	P42950	618 aa		4	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	BCK1	Q01389	1478 aa		4	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	ALE1	Q08548	619 aa		3.99	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	SSP2	Q08646	371 aa		3.98	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	YKR075C	P36155	307 aa		3.98	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	NST1	P53935	1240 aa		3.98	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	KCC4	P25389	1037 aa		3.97	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	HIM1	Q06674	414 aa		3.97	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	NYV1	Q12255	253 aa		3.97	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	GRX6	Q12438	231 aa		3.97	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	DSD1	P53095	428 aa		3.97	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	PRY3	P47033	881 aa		3.97	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	CTH1	P47976	325 aa		3.97	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	FPK1	P53739	893 aa		3.97	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	AVT3	P36062	692 aa		3.96	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	CRF1	Q04930	467 aa		3.96	□□□□□ -1.77
STE6	YKL209C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	AAD16	Q02895	342 aa		3.96	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	JIP4	Q03361	876 aa		3.96	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	SRC1	Q03707	834 aa		3.96	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	CTF4	Q01454	927 aa		3.95	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	PFF1	P38244	976 aa		3.95	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	FKH1	P40466	484 aa		3.95	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	TAP42	Q04372	366 aa		3.95	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	YLL067C	Q07888	1374 aa		3.95	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	RSC30	P38781	883 aa		3.95	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	RMD1	Q03441	430 aa		3.95	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	EDE1	P34216	1381 aa		3.94	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	NUP133	P36161	1157 aa		3.94	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	JJJ2	P46997	583 aa		3.94	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	IOC4	Q04213	475 aa		3.94	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	RRI2	Q12348	645 aa		3.94	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	UGA3	P26370	528 aa		3.94	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	AFG2	P32794	780 aa		3.94	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	TIM50	Q02776	476 aa		3.93	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	SVF1	Q05515	481 aa		3.93	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	ATG1	P53104	897 aa		3.93	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	HAT1	Q12341	374 aa		3.93	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	VPS4	P52917	437 aa		3.92	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	SGD1	Q06132	899 aa		3.92	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	ATG20	Q07528	640 aa		3.92	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	SIS2	P36024	562 aa		3.92	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	BSD2	P38356	321 aa		3.92	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	SHC1	P39000	512 aa		3.92	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	FET4	P40988	552 aa		3.92	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	SDH2	P21801	266 aa		3.92	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	SPT21	P35209	758 aa		3.92	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	CBP1	P07252	654 aa		3.91	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	PHM7	Q12252	991 aa		3.91	□□□□□ -1.78
STE6	YKL209C	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	ERT1	P38140	529 aa		3.9	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79

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