Protein–RNA interactions for Protein: P53095

DSD1, D-serine dehydratase, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSD1P53095 YML009W-BYML009W-B 477 nt26.46■■□□□ 1.83
DSD1P53095 NSR1YGR159C 1245 nt25.99■■□□□ 1.75
DSD1P53095 NOP1YDL014W 984 nt25.76■■□□□ 1.71
DSD1P53095 YKL036CYKL036C 393 nt24.07■■□□□ 1.44
DSD1P53095 MDJ1YFL016C 1536 nt22.9■■□□□ 1.26
DSD1P53095 Q0297Q0297 156 nt22.65■■□□□ 1.22
DSD1P53095 YJL027CYJL027C 417 nt22.55■■□□□ 1.2
DSD1P53095 SRX1YKL086W 384 nt22.53■■□□□ 1.2
DSD1P53095 SCS3YGL126W 1143 nt22.08■■□□□ 1.13
DSD1P53095 YCR051WYCR051W 669 nt21.46■■□□□ 1.03
DSD1P53095 YOL085CYOL085C 342 nt20.87■□□□□ 0.93
DSD1P53095 PKP1YIL042C 1185 nt20.59■□□□□ 0.89
DSD1P53095 DBP2YNL112W 1641 nt20.35■□□□□ 0.85
DSD1P53095 RPP1BYDL130W 321 nt20.35■□□□□ 0.85
DSD1P53095 TRN1tP(UGG)A 72 nt20.21■□□□□ 0.83
DSD1P53095 SUF9tP(UGG)F 72 nt20.21■□□□□ 0.83
DSD1P53095 SUF8tP(UGG)H 72 nt20.21■□□□□ 0.83
DSD1P53095 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt20.21■□□□□ 0.83
DSD1P53095 SUF7tP(UGG)M 72 nt20.21■□□□□ 0.83
DSD1P53095 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt20.21■□□□□ 0.83
DSD1P53095 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt20.21■□□□□ 0.83
DSD1P53095 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt20.21■□□□□ 0.83
DSD1P53095 SUF11tP(UGG)O2 72 nt20.21■□□□□ 0.83
DSD1P53095 CCC1YLR220W 969 nt20.1■□□□□ 0.81
DSD1P53095 ATS1YAL020C 1002 nt19.82■□□□□ 0.76
DSD1P53095 SCJ1YMR214W 1134 nt19.81■□□□□ 0.76
DSD1P53095 PET122YER153C 765 nt19.45■□□□□ 0.7
DSD1P53095 YBR190WYBR190W 312 nt19.37■□□□□ 0.69
DSD1P53095 SCR1SCR1 522 nt19.26■□□□□ 0.67
DSD1P53095 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt19.24■□□□□ 0.67
DSD1P53095 RVS167YDR388W 1449 nt19.14■□□□□ 0.65
DSD1P53095 RTC3YHR087W 336 nt19.02■□□□□ 0.64
DSD1P53095 RRN5YLR141W 1092 nt18.93■□□□□ 0.62
DSD1P53095 RSB1YOR049C 1065 nt18.62■□□□□ 0.57
DSD1P53095 YDJ1YNL064C 1230 nt18.56■□□□□ 0.56
DSD1P53095 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.55■□□□□ 0.56
DSD1P53095 SHR5YOL110W 714 nt18.55■□□□□ 0.56
DSD1P53095 PST2YDR032C 597 nt18.31■□□□□ 0.52
DSD1P53095 GAR1YHR089C 618 nt18.19■□□□□ 0.5
DSD1P53095 DEP1YAL013W 1218 nt18.04■□□□□ 0.48
DSD1P53095 URN1YPR152C 1398 nt17.91■□□□□ 0.46
DSD1P53095 YKL097CYKL097C 411 nt17.72■□□□□ 0.43
DSD1P53095 YNL208WYNL208W 600 nt17.69■□□□□ 0.42
DSD1P53095 RPN10YHR200W 807 nt17.63■□□□□ 0.41
DSD1P53095 OPI9YLR338W 858 nt17.55■□□□□ 0.4
DSD1P53095 TIR1YER011W 765 nt17.53■□□□□ 0.4
DSD1P53095 SHU1YHL006C 453 nt17.53■□□□□ 0.4
DSD1P53095 PUT4YOR348C 1884 nt17.46■□□□□ 0.39
DSD1P53095 SAH1YER043C 1350 nt17.42■□□□□ 0.38
DSD1P53095 SSA1YAL005C 1929 nt17.29■□□□□ 0.36
DSD1P53095 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt17.24■□□□□ 0.35
DSD1P53095 ARE1YCR048W 1833 nt17.21■□□□□ 0.35
DSD1P53095 SRB2YHR041C 633 nt17.12■□□□□ 0.33
DSD1P53095 YJR018WYJR018W 363 nt17.08■□□□□ 0.32
DSD1P53095 PUN1YLR414C 792 nt17.02■□□□□ 0.32
DSD1P53095 YOR139CYOR139C 393 nt17■□□□□ 0.31
DSD1P53095 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.99■□□□□ 0.31
DSD1P53095 POA1YBR022W 534 nt16.95■□□□□ 0.3
DSD1P53095 YJR120WYJR120W 351 nt16.91■□□□□ 0.3
DSD1P53095 WWM1YFL010C 636 nt16.85■□□□□ 0.29
DSD1P53095 PTC2YER089C 1395 nt16.82■□□□□ 0.28
DSD1P53095 RPP2BYDR382W 333 nt16.77■□□□□ 0.28
DSD1P53095 NPL3YDR432W 1245 nt16.76■□□□□ 0.27
DSD1P53095 MNP1YGL068W 585 nt16.76■□□□□ 0.27
DSD1P53095 HOM6YJR139C 1080 nt16.75■□□□□ 0.27
DSD1P53095 YGR021WYGR021W 873 nt16.74■□□□□ 0.27
DSD1P53095 BUD23YCR047C 828 nt16.64■□□□□ 0.25
DSD1P53095 BSC6YOL137W 1494 nt16.54■□□□□ 0.24
DSD1P53095 NAB2YGL122C 1578 nt16.51■□□□□ 0.23
DSD1P53095 SSA3YBL075C 1950 nt16.5■□□□□ 0.23
DSD1P53095 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.5■□□□□ 0.23
DSD1P53095 BDH2YAL061W 1254 nt16.5■□□□□ 0.23
DSD1P53095 RKM5YLR137W 1104 nt16.5■□□□□ 0.23
DSD1P53095 YOL037CYOL037C 354 nt16.49■□□□□ 0.23
DSD1P53095 FPR4YLR449W 1179 nt16.41■□□□□ 0.22
DSD1P53095 INM2YDR287W 879 nt16.4■□□□□ 0.22
DSD1P53095 DAL1YIR027C 1383 nt16.36■□□□□ 0.21
DSD1P53095 FIS1YIL065C 468 nt16.33■□□□□ 0.2
DSD1P53095 LSM3YLR438C-A 270 nt16.32■□□□□ 0.2
DSD1P53095 YBL100CYBL100C 315 nt16.32■□□□□ 0.2
DSD1P53095 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.31■□□□□ 0.2
DSD1P53095 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.31■□□□□ 0.2
DSD1P53095 IMT3tM(CAU)J3 72 nt16.31■□□□□ 0.2
DSD1P53095 IMT1tM(CAU)O1 72 nt16.31■□□□□ 0.2
DSD1P53095 IMT2tM(CAU)P 72 nt16.31■□□□□ 0.2
DSD1P53095 PHO4YFR034C 939 nt16.22■□□□□ 0.19
DSD1P53095 TRM9YML014W 840 nt16.16■□□□□ 0.18
DSD1P53095 FUN26YAL022C 1554 nt16.15■□□□□ 0.18
DSD1P53095 YLR281CYLR281C 468 nt16.14■□□□□ 0.17
DSD1P53095 PUS2YGL063W 1113 nt16.12■□□□□ 0.17
DSD1P53095 WHI5YOR083W 888 nt16.07■□□□□ 0.16
DSD1P53095 CCT6YDR188W 1641 nt15.95■□□□□ 0.14
DSD1P53095 ALF1YNL148C 765 nt15.84■□□□□ 0.13
DSD1P53095 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.82■□□□□ 0.12
DSD1P53095 YPR011CYPR011C 981 nt15.81■□□□□ 0.12
DSD1P53095 YPS1YLR120C 1710 nt15.79■□□□□ 0.12
DSD1P53095 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.77■□□□□ 0.12
DSD1P53095 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.77■□□□□ 0.12
DSD1P53095 MOT3YMR070W 1473 nt15.77■□□□□ 0.11
DSD1P53095 YDR095CYDR095C 411 nt15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.9 ms