Protein–RNA interactions for Protein: P32614

FRD1, Fumarate reductase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FRD1P32614 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.03■■□□□ 1.6
FRD1P32614 NOP1YDL014W 984 nt24.5■■□□□ 1.51
FRD1P32614 NSR1YGR159C 1245 nt24.47■■□□□ 1.51
FRD1P32614 YKL036CYKL036C 393 nt23.09■■□□□ 1.29
FRD1P32614 Q0297Q0297 156 nt21.65■■□□□ 1.06
FRD1P32614 YJL027CYJL027C 417 nt21.64■■□□□ 1.05
FRD1P32614 SRX1YKL086W 384 nt21.45■■□□□ 1.02
FRD1P32614 SCS3YGL126W 1143 nt21.27■■□□□ 1
FRD1P32614 MDJ1YFL016C 1536 nt21.26■□□□□ 0.99
FRD1P32614 YCR051WYCR051W 669 nt20.38■□□□□ 0.85
FRD1P32614 YOL085CYOL085C 342 nt20.02■□□□□ 0.8
FRD1P32614 PKP1YIL042C 1185 nt19.66■□□□□ 0.74
FRD1P32614 SCJ1YMR214W 1134 nt19.45■□□□□ 0.7
FRD1P32614 RPP1BYDL130W 321 nt19.42■□□□□ 0.7
FRD1P32614 ATS1YAL020C 1002 nt19.18■□□□□ 0.66
FRD1P32614 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.1■□□□□ 0.65
FRD1P32614 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.1■□□□□ 0.65
FRD1P32614 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.1■□□□□ 0.65
FRD1P32614 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.1■□□□□ 0.65
FRD1P32614 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.1■□□□□ 0.65
FRD1P32614 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.1■□□□□ 0.65
FRD1P32614 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.1■□□□□ 0.65
FRD1P32614 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.1■□□□□ 0.65
FRD1P32614 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.1■□□□□ 0.65
FRD1P32614 DBP2YNL112W 1641 nt19.05■□□□□ 0.64
FRD1P32614 CCC1YLR220W 969 nt18.93■□□□□ 0.62
FRD1P32614 PET122YER153C 765 nt18.51■□□□□ 0.55
FRD1P32614 SCR1SCR1 522 nt18.4■□□□□ 0.54
FRD1P32614 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.25■□□□□ 0.51
FRD1P32614 RRN5YLR141W 1092 nt18.05■□□□□ 0.48
FRD1P32614 YBR190WYBR190W 312 nt17.99■□□□□ 0.47
FRD1P32614 RVS167YDR388W 1449 nt17.93■□□□□ 0.46
FRD1P32614 RSB1YOR049C 1065 nt17.78■□□□□ 0.44
FRD1P32614 PST2YDR032C 597 nt17.71■□□□□ 0.43
FRD1P32614 RTC3YHR087W 336 nt17.71■□□□□ 0.43
FRD1P32614 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.69■□□□□ 0.42
FRD1P32614 YDJ1YNL064C 1230 nt17.63■□□□□ 0.41
FRD1P32614 SHR5YOL110W 714 nt17.46■□□□□ 0.39
FRD1P32614 YKL097CYKL097C 411 nt17.22■□□□□ 0.35
FRD1P32614 GAR1YHR089C 618 nt17.18■□□□□ 0.34
FRD1P32614 SHU1YHL006C 453 nt16.86■□□□□ 0.29
FRD1P32614 DEP1YAL013W 1218 nt16.83■□□□□ 0.28
FRD1P32614 URN1YPR152C 1398 nt16.68■□□□□ 0.26
FRD1P32614 YNL208WYNL208W 600 nt16.59■□□□□ 0.25
FRD1P32614 TIR1YER011W 765 nt16.57■□□□□ 0.24
FRD1P32614 RPN10YHR200W 807 nt16.49■□□□□ 0.23
FRD1P32614 YOR139CYOR139C 393 nt16.48■□□□□ 0.23
FRD1P32614 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.47■□□□□ 0.23
FRD1P32614 OPI9YLR338W 858 nt16.34■□□□□ 0.21
FRD1P32614 SSA1YAL005C 1929 nt16.29■□□□□ 0.2
FRD1P32614 NPL3YDR432W 1245 nt16.17■□□□□ 0.18
FRD1P32614 SRB2YHR041C 633 nt16.16■□□□□ 0.18
FRD1P32614 SAH1YER043C 1350 nt16.13■□□□□ 0.17
FRD1P32614 PUT4YOR348C 1884 nt15.98■□□□□ 0.15
FRD1P32614 HOM6YJR139C 1080 nt15.97■□□□□ 0.15
FRD1P32614 WWM1YFL010C 636 nt15.95■□□□□ 0.14
FRD1P32614 MNP1YGL068W 585 nt15.95■□□□□ 0.14
FRD1P32614 YGR021WYGR021W 873 nt15.95■□□□□ 0.14
FRD1P32614 YJR018WYJR018W 363 nt15.94■□□□□ 0.14
FRD1P32614 ARE1YCR048W 1833 nt15.85■□□□□ 0.13
FRD1P32614 YJR120WYJR120W 351 nt15.85■□□□□ 0.13
FRD1P32614 PUN1YLR414C 792 nt15.85■□□□□ 0.13
FRD1P32614 YOL037CYOL037C 354 nt15.84■□□□□ 0.13
FRD1P32614 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.81■□□□□ 0.12
FRD1P32614 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.81■□□□□ 0.12
FRD1P32614 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.81■□□□□ 0.12
FRD1P32614 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.81■□□□□ 0.12
FRD1P32614 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.81■□□□□ 0.12
FRD1P32614 RPP2BYDR382W 333 nt15.72■□□□□ 0.11
FRD1P32614 RKM5YLR137W 1104 nt15.72■□□□□ 0.11
FRD1P32614 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.64■□□□□ 0.09
FRD1P32614 SSA3YBL075C 1950 nt15.62■□□□□ 0.09
FRD1P32614 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.61■□□□□ 0.09
FRD1P32614 PTC2YER089C 1395 nt15.6■□□□□ 0.09
FRD1P32614 POA1YBR022W 534 nt15.54■□□□□ 0.08
FRD1P32614 BDH2YAL061W 1254 nt15.52■□□□□ 0.08
FRD1P32614 PUS2YGL063W 1113 nt15.5■□□□□ 0.07
FRD1P32614 YLR281CYLR281C 468 nt15.49■□□□□ 0.07
FRD1P32614 LSM3YLR438C-A 270 nt15.41■□□□□ 0.06
FRD1P32614 WHI5YOR083W 888 nt15.37■□□□□ 0.05
FRD1P32614 MOT3YMR070W 1473 nt15.36■□□□□ 0.05
FRD1P32614 INM2YDR287W 879 nt15.31■□□□□ 0.04
FRD1P32614 NAB2YGL122C 1578 nt15.31■□□□□ 0.04
FRD1P32614 BUD23YCR047C 828 nt15.29■□□□□ 0.04
FRD1P32614 YBL100CYBL100C 315 nt15.24■□□□□ 0.03
FRD1P32614 DAL1YIR027C 1383 nt15.2■□□□□ 0.02
FRD1P32614 FPR4YLR449W 1179 nt15.18■□□□□ 0.02
FRD1P32614 YPR011CYPR011C 981 nt15.16■□□□□ 0.02
FRD1P32614 TRM9YML014W 840 nt15.15■□□□□ 0.02
FRD1P32614 FIS1YIL065C 468 nt15.14■□□□□ 0.01
FRD1P32614 FMP45YDL222C 930 nt15.09■□□□□ 0.01
FRD1P32614 FUN26YAL022C 1554 nt15.08■□□□□ 0
FRD1P32614 BSC6YOL137W 1494 nt15.08■□□□□ 0
FRD1P32614 DSK2YMR276W 1122 nt15.07■□□□□ 0
FRD1P32614 PHO4YFR034C 939 nt15.06■□□□□ 0
FRD1P32614 YLR236CYLR236C 324 nt15.04■□□□□ -0
FRD1P32614 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.99□□□□□ -0.01
FRD1P32614 IMP2'YIL154C 1041 nt14.98□□□□□ -0.01
FRD1P32614 YCH1YGR203W 447 nt14.97□□□□□ -0.01
FRD1P32614 CCT6YDR188W 1641 nt14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.6 ms