Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.94■■□□□ 1.74
NSE3Q05541 NSR1YGR159C 1245 nt25.56■■□□□ 1.68
NSE3Q05541 NOP1YDL014W 984 nt25.33■■□□□ 1.65
NSE3Q05541 YKL036CYKL036C 393 nt23.57■■□□□ 1.36
NSE3Q05541 MDJ1YFL016C 1536 nt22.47■■□□□ 1.19
NSE3Q05541 Q0297Q0297 156 nt22.2■■□□□ 1.14
NSE3Q05541 SRX1YKL086W 384 nt22.1■■□□□ 1.13
NSE3Q05541 YJL027CYJL027C 417 nt22.06■■□□□ 1.12
NSE3Q05541 SCS3YGL126W 1143 nt21.54■■□□□ 1.04
NSE3Q05541 YCR051WYCR051W 669 nt21.02■□□□□ 0.96
NSE3Q05541 YOL085CYOL085C 342 nt20.4■□□□□ 0.86
NSE3Q05541 PKP1YIL042C 1185 nt20.08■□□□□ 0.81
NSE3Q05541 DBP2YNL112W 1641 nt19.94■□□□□ 0.78
NSE3Q05541 RPP1BYDL130W 321 nt19.94■□□□□ 0.78
NSE3Q05541 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.83■□□□□ 0.77
NSE3Q05541 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.83■□□□□ 0.77
NSE3Q05541 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.83■□□□□ 0.77
NSE3Q05541 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.83■□□□□ 0.77
NSE3Q05541 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.83■□□□□ 0.77
NSE3Q05541 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.83■□□□□ 0.77
NSE3Q05541 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.83■□□□□ 0.77
NSE3Q05541 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.83■□□□□ 0.77
NSE3Q05541 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.83■□□□□ 0.77
NSE3Q05541 CCC1YLR220W 969 nt19.69■□□□□ 0.74
NSE3Q05541 SCJ1YMR214W 1134 nt19.38■□□□□ 0.69
NSE3Q05541 ATS1YAL020C 1002 nt19.34■□□□□ 0.69
NSE3Q05541 YBR190WYBR190W 312 nt19.1■□□□□ 0.65
NSE3Q05541 PET122YER153C 765 nt19.02■□□□□ 0.64
NSE3Q05541 SCR1SCR1 522 nt18.92■□□□□ 0.62
NSE3Q05541 RVS167YDR388W 1449 nt18.87■□□□□ 0.61
NSE3Q05541 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.86■□□□□ 0.61
NSE3Q05541 RTC3YHR087W 336 nt18.74■□□□□ 0.59
NSE3Q05541 RRN5YLR141W 1092 nt18.51■□□□□ 0.55
NSE3Q05541 SHR5YOL110W 714 nt18.24■□□□□ 0.51
NSE3Q05541 YDJ1YNL064C 1230 nt18.23■□□□□ 0.51
NSE3Q05541 RSB1YOR049C 1065 nt18.21■□□□□ 0.51
NSE3Q05541 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.14■□□□□ 0.49
NSE3Q05541 PST2YDR032C 597 nt17.86■□□□□ 0.45
NSE3Q05541 GAR1YHR089C 618 nt17.82■□□□□ 0.44
NSE3Q05541 DEP1YAL013W 1218 nt17.67■□□□□ 0.42
NSE3Q05541 URN1YPR152C 1398 nt17.6■□□□□ 0.41
NSE3Q05541 RPN10YHR200W 807 nt17.42■□□□□ 0.38
NSE3Q05541 YNL208WYNL208W 600 nt17.42■□□□□ 0.38
NSE3Q05541 YKL097CYKL097C 411 nt17.31■□□□□ 0.36
NSE3Q05541 OPI9YLR338W 858 nt17.28■□□□□ 0.36
NSE3Q05541 TIR1YER011W 765 nt17.2■□□□□ 0.34
NSE3Q05541 PUT4YOR348C 1884 nt17.13■□□□□ 0.33
NSE3Q05541 SAH1YER043C 1350 nt17.12■□□□□ 0.33
NSE3Q05541 SHU1YHL006C 453 nt17.08■□□□□ 0.32
NSE3Q05541 SSA1YAL005C 1929 nt16.92■□□□□ 0.3
NSE3Q05541 ARE1YCR048W 1833 nt16.9■□□□□ 0.3
NSE3Q05541 YJR018WYJR018W 363 nt16.81■□□□□ 0.28
NSE3Q05541 PUN1YLR414C 792 nt16.8■□□□□ 0.28
NSE3Q05541 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.77■□□□□ 0.28
NSE3Q05541 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.71■□□□□ 0.27
NSE3Q05541 POA1YBR022W 534 nt16.66■□□□□ 0.26
NSE3Q05541 SRB2YHR041C 633 nt16.65■□□□□ 0.26
NSE3Q05541 RPP2BYDR382W 333 nt16.56■□□□□ 0.24
NSE3Q05541 PTC2YER089C 1395 nt16.55■□□□□ 0.24
NSE3Q05541 YJR120WYJR120W 351 nt16.54■□□□□ 0.24
NSE3Q05541 YOR139CYOR139C 393 nt16.53■□□□□ 0.24
NSE3Q05541 WWM1YFL010C 636 nt16.47■□□□□ 0.23
NSE3Q05541 YGR021WYGR021W 873 nt16.46■□□□□ 0.23
NSE3Q05541 NPL3YDR432W 1245 nt16.4■□□□□ 0.22
NSE3Q05541 HOM6YJR139C 1080 nt16.39■□□□□ 0.21
NSE3Q05541 BUD23YCR047C 828 nt16.38■□□□□ 0.21
NSE3Q05541 MNP1YGL068W 585 nt16.35■□□□□ 0.21
NSE3Q05541 NAB2YGL122C 1578 nt16.3■□□□□ 0.2
NSE3Q05541 BSC6YOL137W 1494 nt16.23■□□□□ 0.19
NSE3Q05541 BDH2YAL061W 1254 nt16.23■□□□□ 0.19
NSE3Q05541 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.21■□□□□ 0.19
NSE3Q05541 INM2YDR287W 879 nt16.19■□□□□ 0.18
NSE3Q05541 YOL037CYOL037C 354 nt16.18■□□□□ 0.18
NSE3Q05541 RKM5YLR137W 1104 nt16.16■□□□□ 0.18
NSE3Q05541 FPR4YLR449W 1179 nt16.14■□□□□ 0.17
NSE3Q05541 DAL1YIR027C 1383 nt16.13■□□□□ 0.17
NSE3Q05541 SSA3YBL075C 1950 nt16.1■□□□□ 0.17
NSE3Q05541 LSM3YLR438C-A 270 nt16.07■□□□□ 0.16
NSE3Q05541 YBL100CYBL100C 315 nt16.06■□□□□ 0.16
NSE3Q05541 FIS1YIL065C 468 nt16.05■□□□□ 0.16
NSE3Q05541 PHO4YFR034C 939 nt15.97■□□□□ 0.15
NSE3Q05541 TRM9YML014W 840 nt15.92■□□□□ 0.14
NSE3Q05541 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.89■□□□□ 0.13
NSE3Q05541 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.89■□□□□ 0.13
NSE3Q05541 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.89■□□□□ 0.13
NSE3Q05541 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.89■□□□□ 0.13
NSE3Q05541 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.89■□□□□ 0.13
NSE3Q05541 FUN26YAL022C 1554 nt15.88■□□□□ 0.13
NSE3Q05541 YLR281CYLR281C 468 nt15.78■□□□□ 0.12
NSE3Q05541 PUS2YGL063W 1113 nt15.73■□□□□ 0.11
NSE3Q05541 WHI5YOR083W 888 nt15.71■□□□□ 0.11
NSE3Q05541 CCT6YDR188W 1641 nt15.7■□□□□ 0.1
NSE3Q05541 ALF1YNL148C 765 nt15.64■□□□□ 0.09
NSE3Q05541 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.58■□□□□ 0.08
NSE3Q05541 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.58■□□□□ 0.08
NSE3Q05541 YPS1YLR120C 1710 nt15.56■□□□□ 0.08
NSE3Q05541 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.52■□□□□ 0.08
NSE3Q05541 YDR095CYDR095C 411 nt15.5■□□□□ 0.07
NSE3Q05541 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.41■□□□□ 0.06
NSE3Q05541 DSK2YMR276W 1122 nt15.4■□□□□ 0.06
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