Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.85■■□□□ 1.73
NOP53Q12080 NSR1YGR159C 1245 nt25.31■■□□□ 1.64
NOP53Q12080 NOP1YDL014W 984 nt25.25■■□□□ 1.63
NOP53Q12080 YKL036CYKL036C 393 nt23.69■■□□□ 1.38
NOP53Q12080 Q0297Q0297 156 nt22.23■■□□□ 1.15
NOP53Q12080 YJL027CYJL027C 417 nt22.2■■□□□ 1.14
NOP53Q12080 MDJ1YFL016C 1536 nt22.15■■□□□ 1.14
NOP53Q12080 SRX1YKL086W 384 nt22.07■■□□□ 1.12
NOP53Q12080 SCS3YGL126W 1143 nt21.77■■□□□ 1.08
NOP53Q12080 YCR051WYCR051W 669 nt21■□□□□ 0.95
NOP53Q12080 YOL085CYOL085C 342 nt20.52■□□□□ 0.88
NOP53Q12080 PKP1YIL042C 1185 nt20.2■□□□□ 0.82
NOP53Q12080 RPP1BYDL130W 321 nt19.96■□□□□ 0.79
NOP53Q12080 DBP2YNL112W 1641 nt19.73■□□□□ 0.75
NOP53Q12080 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.73■□□□□ 0.75
NOP53Q12080 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.73■□□□□ 0.75
NOP53Q12080 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.73■□□□□ 0.75
NOP53Q12080 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.73■□□□□ 0.75
NOP53Q12080 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.73■□□□□ 0.75
NOP53Q12080 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.73■□□□□ 0.75
NOP53Q12080 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.73■□□□□ 0.75
NOP53Q12080 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.73■□□□□ 0.75
NOP53Q12080 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.73■□□□□ 0.75
NOP53Q12080 SCJ1YMR214W 1134 nt19.73■□□□□ 0.75
NOP53Q12080 ATS1YAL020C 1002 nt19.58■□□□□ 0.72
NOP53Q12080 CCC1YLR220W 969 nt19.58■□□□□ 0.72
NOP53Q12080 PET122YER153C 765 nt19.05■□□□□ 0.64
NOP53Q12080 SCR1SCR1 522 nt18.93■□□□□ 0.62
NOP53Q12080 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.81■□□□□ 0.6
NOP53Q12080 YBR190WYBR190W 312 nt18.73■□□□□ 0.59
NOP53Q12080 RVS167YDR388W 1449 nt18.62■□□□□ 0.57
NOP53Q12080 RRN5YLR141W 1092 nt18.55■□□□□ 0.56
NOP53Q12080 RTC3YHR087W 336 nt18.38■□□□□ 0.53
NOP53Q12080 RSB1YOR049C 1065 nt18.28■□□□□ 0.52
NOP53Q12080 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.18■□□□□ 0.5
NOP53Q12080 YDJ1YNL064C 1230 nt18.17■□□□□ 0.5
NOP53Q12080 SHR5YOL110W 714 nt18.07■□□□□ 0.48
NOP53Q12080 PST2YDR032C 597 nt18.06■□□□□ 0.48
NOP53Q12080 GAR1YHR089C 618 nt17.75■□□□□ 0.43
NOP53Q12080 SSA3YBL075C 1950 nt17.66■□□□□ 0.42
NOP53Q12080 YKL097CYKL097C 411 nt17.56■□□□□ 0.4
NOP53Q12080 DEP1YAL013W 1218 nt17.48■□□□□ 0.39
NOP53Q12080 URN1YPR152C 1398 nt17.34■□□□□ 0.37
NOP53Q12080 SHU1YHL006C 453 nt17.25■□□□□ 0.35
NOP53Q12080 YNL208WYNL208W 600 nt17.21■□□□□ 0.35
NOP53Q12080 RPN10YHR200W 807 nt17.15■□□□□ 0.34
NOP53Q12080 TIR1YER011W 765 nt17.11■□□□□ 0.33
NOP53Q12080 OPI9YLR338W 858 nt16.99■□□□□ 0.31
NOP53Q12080 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.9■□□□□ 0.3
NOP53Q12080 Q0182Q0182 405 nt16.87■□□□□ 0.29
NOP53Q12080 SSA1YAL005C 1929 nt16.83■□□□□ 0.28
NOP53Q12080 SAH1YER043C 1350 nt16.8■□□□□ 0.28
NOP53Q12080 YOR139CYOR139C 393 nt16.8■□□□□ 0.28
NOP53Q12080 MOT3YMR070W 1473 nt16.74■□□□□ 0.27
NOP53Q12080 PUT4YOR348C 1884 nt16.71■□□□□ 0.27
NOP53Q12080 SRB2YHR041C 633 nt16.66■□□□□ 0.26
NOP53Q12080 NPL3YDR432W 1245 nt16.56■□□□□ 0.24
NOP53Q12080 YJR018WYJR018W 363 nt16.56■□□□□ 0.24
NOP53Q12080 YGR139WYGR139W 339 nt16.55■□□□□ 0.24
NOP53Q12080 ARE1YCR048W 1833 nt16.54■□□□□ 0.24
NOP53Q12080 PUN1YLR414C 792 nt16.5■□□□□ 0.23
NOP53Q12080 WWM1YFL010C 636 nt16.44■□□□□ 0.22
NOP53Q12080 MNP1YGL068W 585 nt16.42■□□□□ 0.22
NOP53Q12080 YGR021WYGR021W 873 nt16.42■□□□□ 0.22
NOP53Q12080 HOM6YJR139C 1080 nt16.42■□□□□ 0.22
NOP53Q12080 YJR120WYJR120W 351 nt16.41■□□□□ 0.22
NOP53Q12080 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.34■□□□□ 0.21
NOP53Q12080 RPP2BYDR382W 333 nt16.32■□□□□ 0.2
NOP53Q12080 YOL037CYOL037C 354 nt16.26■□□□□ 0.19
NOP53Q12080 POA1YBR022W 534 nt16.25■□□□□ 0.19
NOP53Q12080 PTC2YER089C 1395 nt16.25■□□□□ 0.19
NOP53Q12080 RKM5YLR137W 1104 nt16.18■□□□□ 0.18
NOP53Q12080 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.14■□□□□ 0.17
NOP53Q12080 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.11■□□□□ 0.17
NOP53Q12080 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.11■□□□□ 0.17
NOP53Q12080 IMT3tM(CAU)J3 72 nt16.11■□□□□ 0.17
NOP53Q12080 IMT1tM(CAU)O1 72 nt16.11■□□□□ 0.17
NOP53Q12080 IMT2tM(CAU)P 72 nt16.11■□□□□ 0.17
NOP53Q12080 BDH2YAL061W 1254 nt16.07■□□□□ 0.16
NOP53Q12080 BUD23YCR047C 828 nt16.01■□□□□ 0.15
NOP53Q12080 NAB2YGL122C 1578 nt15.96■□□□□ 0.14
NOP53Q12080 LSM3YLR438C-A 270 nt15.93■□□□□ 0.14
NOP53Q12080 INM2YDR287W 879 nt15.9■□□□□ 0.14
NOP53Q12080 PUS2YGL063W 1113 nt15.87■□□□□ 0.13
NOP53Q12080 YLR281CYLR281C 468 nt15.86■□□□□ 0.13
NOP53Q12080 FPR4YLR449W 1179 nt15.85■□□□□ 0.13
NOP53Q12080 DAL1YIR027C 1383 nt15.84■□□□□ 0.13
NOP53Q12080 YBL100CYBL100C 315 nt15.83■□□□□ 0.12
NOP53Q12080 BSC6YOL137W 1494 nt15.81■□□□□ 0.12
NOP53Q12080 FIS1YIL065C 468 nt15.78■□□□□ 0.12
NOP53Q12080 WHI5YOR083W 888 nt15.77■□□□□ 0.12
NOP53Q12080 NME1NME1 340 nt15.72■□□□□ 0.11
NOP53Q12080 TRM9YML014W 840 nt15.7■□□□□ 0.1
NOP53Q12080 PHO4YFR034C 939 nt15.68■□□□□ 0.1
NOP53Q12080 FUN26YAL022C 1554 nt15.66■□□□□ 0.1
NOP53Q12080 YPR011CYPR011C 981 nt15.51■□□□□ 0.07
NOP53Q12080 CCT6YDR188W 1641 nt15.5■□□□□ 0.07
NOP53Q12080 FMP45YDL222C 930 nt15.48■□□□□ 0.07
NOP53Q12080 DSK2YMR276W 1122 nt15.47■□□□□ 0.07
NOP53Q12080 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28 ms