Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.73■■□□□ 1.71
NYV1Q12255 NOP1YDL014W 984 nt25.14■■□□□ 1.62
NYV1Q12255 NSR1YGR159C 1245 nt25.05■■□□□ 1.6
NYV1Q12255 YKL036CYKL036C 393 nt23.72■■□□□ 1.39
NYV1Q12255 YJL027CYJL027C 417 nt22.26■■□□□ 1.15
NYV1Q12255 Q0297Q0297 156 nt22.19■■□□□ 1.14
NYV1Q12255 SRX1YKL086W 384 nt21.99■■□□□ 1.11
NYV1Q12255 SCS3YGL126W 1143 nt21.87■■□□□ 1.09
NYV1Q12255 MDJ1YFL016C 1536 nt21.84■■□□□ 1.09
NYV1Q12255 YCR051WYCR051W 669 nt20.97■□□□□ 0.95
NYV1Q12255 YOL085CYOL085C 342 nt20.56■□□□□ 0.88
NYV1Q12255 PKP1YIL042C 1185 nt20.26■□□□□ 0.83
NYV1Q12255 SCJ1YMR214W 1134 nt19.97■□□□□ 0.79
NYV1Q12255 RPP1BYDL130W 321 nt19.93■□□□□ 0.78
NYV1Q12255 ATS1YAL020C 1002 nt19.71■□□□□ 0.75
NYV1Q12255 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.58■□□□□ 0.72
NYV1Q12255 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.58■□□□□ 0.72
NYV1Q12255 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.58■□□□□ 0.72
NYV1Q12255 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.58■□□□□ 0.72
NYV1Q12255 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.58■□□□□ 0.72
NYV1Q12255 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.58■□□□□ 0.72
NYV1Q12255 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.58■□□□□ 0.72
NYV1Q12255 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.58■□□□□ 0.72
NYV1Q12255 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.58■□□□□ 0.72
NYV1Q12255 DBP2YNL112W 1641 nt19.51■□□□□ 0.71
NYV1Q12255 CCC1YLR220W 969 nt19.49■□□□□ 0.71
NYV1Q12255 PET122YER153C 765 nt19.02■□□□□ 0.64
NYV1Q12255 SCR1SCR1 522 nt18.91■□□□□ 0.62
NYV1Q12255 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.73■□□□□ 0.59
NYV1Q12255 RRN5YLR141W 1092 nt18.54■□□□□ 0.56
NYV1Q12255 YBR190WYBR190W 312 nt18.41■□□□□ 0.54
NYV1Q12255 RVS167YDR388W 1449 nt18.4■□□□□ 0.54
NYV1Q12255 RSB1YOR049C 1065 nt18.3■□□□□ 0.52
NYV1Q12255 RTC3YHR087W 336 nt18.24■□□□□ 0.51
NYV1Q12255 PST2YDR032C 597 nt18.17■□□□□ 0.5
NYV1Q12255 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.17■□□□□ 0.5
NYV1Q12255 YDJ1YNL064C 1230 nt18.05■□□□□ 0.48
NYV1Q12255 SHR5YOL110W 714 nt17.89■□□□□ 0.45
NYV1Q12255 YKL097CYKL097C 411 nt17.71■□□□□ 0.43
NYV1Q12255 GAR1YHR089C 618 nt17.66■□□□□ 0.42
NYV1Q12255 SHU1YHL006C 453 nt17.34■□□□□ 0.37
NYV1Q12255 DEP1YAL013W 1218 nt17.33■□□□□ 0.36
NYV1Q12255 URN1YPR152C 1398 nt17.12■□□□□ 0.33
NYV1Q12255 TIR1YER011W 765 nt17.01■□□□□ 0.31
NYV1Q12255 YNL208WYNL208W 600 nt17.01■□□□□ 0.31
NYV1Q12255 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.99■□□□□ 0.31
NYV1Q12255 YOR139CYOR139C 393 nt16.94■□□□□ 0.3
NYV1Q12255 RPN10YHR200W 807 nt16.91■□□□□ 0.3
NYV1Q12255 OPI9YLR338W 858 nt16.73■□□□□ 0.27
NYV1Q12255 SSA1YAL005C 1929 nt16.72■□□□□ 0.27
NYV1Q12255 NPL3YDR432W 1245 nt16.65■□□□□ 0.26
NYV1Q12255 SRB2YHR041C 633 nt16.6■□□□□ 0.25
NYV1Q12255 SAH1YER043C 1350 nt16.55■□□□□ 0.24
NYV1Q12255 MNP1YGL068W 585 nt16.42■□□□□ 0.22
NYV1Q12255 WWM1YFL010C 636 nt16.39■□□□□ 0.21
NYV1Q12255 HOM6YJR139C 1080 nt16.37■□□□□ 0.21
NYV1Q12255 YJR018WYJR018W 363 nt16.36■□□□□ 0.21
NYV1Q12255 YGR021WYGR021W 873 nt16.35■□□□□ 0.21
NYV1Q12255 PUT4YOR348C 1884 nt16.33■□□□□ 0.21
NYV1Q12255 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.25■□□□□ 0.19
NYV1Q12255 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.25■□□□□ 0.19
NYV1Q12255 IMT3tM(CAU)J3 72 nt16.25■□□□□ 0.19
NYV1Q12255 IMT1tM(CAU)O1 72 nt16.25■□□□□ 0.19
NYV1Q12255 IMT2tM(CAU)P 72 nt16.25■□□□□ 0.19
NYV1Q12255 YOL037CYOL037C 354 nt16.25■□□□□ 0.19
NYV1Q12255 YJR120WYJR120W 351 nt16.24■□□□□ 0.19
NYV1Q12255 PUN1YLR414C 792 nt16.22■□□□□ 0.19
NYV1Q12255 ARE1YCR048W 1833 nt16.22■□□□□ 0.19
NYV1Q12255 RKM5YLR137W 1104 nt16.13■□□□□ 0.17
NYV1Q12255 RPP2BYDR382W 333 nt16.12■□□□□ 0.17
NYV1Q12255 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.03■□□□□ 0.16
NYV1Q12255 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.01■□□□□ 0.15
NYV1Q12255 PTC2YER089C 1395 nt16■□□□□ 0.15
NYV1Q12255 PUS2YGL063W 1113 nt15.96■□□□□ 0.15
NYV1Q12255 SSA3YBL075C 1950 nt15.95■□□□□ 0.14
NYV1Q12255 POA1YBR022W 534 nt15.93■□□□□ 0.14
NYV1Q12255 BDH2YAL061W 1254 nt15.9■□□□□ 0.14
NYV1Q12255 YLR281CYLR281C 468 nt15.9■□□□□ 0.14
NYV1Q12255 MOT3YMR070W 1473 nt15.8■□□□□ 0.12
NYV1Q12255 WHI5YOR083W 888 nt15.79■□□□□ 0.12
NYV1Q12255 LSM3YLR438C-A 270 nt15.78■□□□□ 0.12
NYV1Q12255 BUD23YCR047C 828 nt15.73■□□□□ 0.11
NYV1Q12255 BSC6YOL137W 1494 nt15.72■□□□□ 0.11
NYV1Q12255 NAB2YGL122C 1578 nt15.67■□□□□ 0.1
NYV1Q12255 INM2YDR287W 879 nt15.67■□□□□ 0.1
NYV1Q12255 FPR4YLR449W 1179 nt15.63■□□□□ 0.09
NYV1Q12255 YBL100CYBL100C 315 nt15.63■□□□□ 0.09
NYV1Q12255 YPR011CYPR011C 981 nt15.59■□□□□ 0.09
NYV1Q12255 DAL1YIR027C 1383 nt15.57■□□□□ 0.08
NYV1Q12255 FMP45YDL222C 930 nt15.55■□□□□ 0.08
NYV1Q12255 TRM9YML014W 840 nt15.54■□□□□ 0.08
NYV1Q12255 FIS1YIL065C 468 nt15.51■□□□□ 0.07
NYV1Q12255 DSK2YMR276W 1122 nt15.48■□□□□ 0.07
NYV1Q12255 FUN26YAL022C 1554 nt15.48■□□□□ 0.07
NYV1Q12255 YLR236CYLR236C 324 nt15.46■□□□□ 0.07
NYV1Q12255 PHO4YFR034C 939 nt15.43■□□□□ 0.06
NYV1Q12255 YCH1YGR203W 447 nt15.39■□□□□ 0.05
NYV1Q12255 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.39■□□□□ 0.05
NYV1Q12255 IMP2'YIL154C 1041 nt15.33■□□□□ 0.04
NYV1Q12255 MRPL8YJL063C 717 nt15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.1 ms