Protein–RNA interactions for Protein: Q01454

CTF4, DNA polymerase alpha-binding protein, yeastyeast

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Length 927 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF4Q01454 YML009W-BYML009W-B 477 nt26.39■■□□□ 1.82
CTF4Q01454 NSR1YGR159C 1245 nt25.86■■□□□ 1.73
CTF4Q01454 NOP1YDL014W 984 nt25.76■■□□□ 1.71
CTF4Q01454 YKL036CYKL036C 393 nt24.04■■□□□ 1.44
CTF4Q01454 MDJ1YFL016C 1536 nt22.71■■□□□ 1.23
CTF4Q01454 Q0297Q0297 156 nt22.56■■□□□ 1.2
CTF4Q01454 YJL027CYJL027C 417 nt22.54■■□□□ 1.2
CTF4Q01454 SRX1YKL086W 384 nt22.45■■□□□ 1.18
CTF4Q01454 SCS3YGL126W 1143 nt22■■□□□ 1.11
CTF4Q01454 YCR051WYCR051W 669 nt21.44■■□□□ 1.02
CTF4Q01454 YOL085CYOL085C 342 nt20.79■□□□□ 0.92
CTF4Q01454 PKP1YIL042C 1185 nt20.52■□□□□ 0.88
CTF4Q01454 RPP1BYDL130W 321 nt20.28■□□□□ 0.84
CTF4Q01454 DBP2YNL112W 1641 nt20.12■□□□□ 0.81
CTF4Q01454 TRN1tP(UGG)A 72 nt20.08■□□□□ 0.81
CTF4Q01454 SUF9tP(UGG)F 72 nt20.08■□□□□ 0.81
CTF4Q01454 SUF8tP(UGG)H 72 nt20.08■□□□□ 0.81
CTF4Q01454 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt20.08■□□□□ 0.81
CTF4Q01454 SUF7tP(UGG)M 72 nt20.08■□□□□ 0.81
CTF4Q01454 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt20.08■□□□□ 0.81
CTF4Q01454 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt20.08■□□□□ 0.81
CTF4Q01454 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt20.08■□□□□ 0.81
CTF4Q01454 SUF11tP(UGG)O2 72 nt20.08■□□□□ 0.81
CTF4Q01454 CCC1YLR220W 969 nt20.05■□□□□ 0.8
CTF4Q01454 SCJ1YMR214W 1134 nt19.82■□□□□ 0.76
CTF4Q01454 ATS1YAL020C 1002 nt19.77■□□□□ 0.76
CTF4Q01454 PET122YER153C 765 nt19.35■□□□□ 0.69
CTF4Q01454 SCR1SCR1 522 nt19.3■□□□□ 0.68
CTF4Q01454 YBR190WYBR190W 312 nt19.24■□□□□ 0.67
CTF4Q01454 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt19.15■□□□□ 0.66
CTF4Q01454 RVS167YDR388W 1449 nt19.13■□□□□ 0.65
CTF4Q01454 RTC3YHR087W 336 nt18.98■□□□□ 0.63
CTF4Q01454 RRN5YLR141W 1092 nt18.86■□□□□ 0.61
CTF4Q01454 RSB1YOR049C 1065 nt18.61■□□□□ 0.57
CTF4Q01454 YDJ1YNL064C 1230 nt18.48■□□□□ 0.55
CTF4Q01454 SHR5YOL110W 714 nt18.47■□□□□ 0.55
CTF4Q01454 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.46■□□□□ 0.55
CTF4Q01454 PST2YDR032C 597 nt18.22■□□□□ 0.51
CTF4Q01454 GAR1YHR089C 618 nt18.13■□□□□ 0.49
CTF4Q01454 DEP1YAL013W 1218 nt17.94■□□□□ 0.46
CTF4Q01454 URN1YPR152C 1398 nt17.8■□□□□ 0.44
CTF4Q01454 YKL097CYKL097C 411 nt17.74■□□□□ 0.43
CTF4Q01454 RPN10YHR200W 807 nt17.63■□□□□ 0.41
CTF4Q01454 YNL208WYNL208W 600 nt17.63■□□□□ 0.41
CTF4Q01454 TIR1YER011W 765 nt17.46■□□□□ 0.39
CTF4Q01454 SHU1YHL006C 453 nt17.44■□□□□ 0.38
CTF4Q01454 OPI9YLR338W 858 nt17.41■□□□□ 0.38
CTF4Q01454 SAH1YER043C 1350 nt17.28■□□□□ 0.36
CTF4Q01454 PUT4YOR348C 1884 nt17.17■□□□□ 0.34
CTF4Q01454 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt17.16■□□□□ 0.34
CTF4Q01454 SSA1YAL005C 1929 nt17.14■□□□□ 0.33
CTF4Q01454 YJR018WYJR018W 363 nt17■□□□□ 0.31
CTF4Q01454 ARE1YCR048W 1833 nt16.98■□□□□ 0.31
CTF4Q01454 PUN1YLR414C 792 nt16.95■□□□□ 0.3
CTF4Q01454 YOR139CYOR139C 393 nt16.89■□□□□ 0.29
CTF4Q01454 SRB2YHR041C 633 nt16.87■□□□□ 0.29
CTF4Q01454 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.83■□□□□ 0.28
CTF4Q01454 NPL3YDR432W 1245 nt16.8■□□□□ 0.28
CTF4Q01454 RPP2BYDR382W 333 nt16.79■□□□□ 0.28
CTF4Q01454 POA1YBR022W 534 nt16.78■□□□□ 0.28
CTF4Q01454 WWM1YFL010C 636 nt16.76■□□□□ 0.27
CTF4Q01454 YGR021WYGR021W 873 nt16.73■□□□□ 0.27
CTF4Q01454 PTC2YER089C 1395 nt16.72■□□□□ 0.27
CTF4Q01454 YJR120WYJR120W 351 nt16.67■□□□□ 0.26
CTF4Q01454 MNP1YGL068W 585 nt16.66■□□□□ 0.26
CTF4Q01454 HOM6YJR139C 1080 nt16.65■□□□□ 0.26
CTF4Q01454 BUD23YCR047C 828 nt16.56■□□□□ 0.24
CTF4Q01454 YOL037CYOL037C 354 nt16.48■□□□□ 0.23
CTF4Q01454 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.44■□□□□ 0.22
CTF4Q01454 BDH2YAL061W 1254 nt16.43■□□□□ 0.22
CTF4Q01454 NAB2YGL122C 1578 nt16.43■□□□□ 0.22
CTF4Q01454 RKM5YLR137W 1104 nt16.42■□□□□ 0.22
CTF4Q01454 FPR4YLR449W 1179 nt16.38■□□□□ 0.21
CTF4Q01454 INM2YDR287W 879 nt16.35■□□□□ 0.21
CTF4Q01454 BSC6YOL137W 1494 nt16.3■□□□□ 0.2
CTF4Q01454 DAL1YIR027C 1383 nt16.26■□□□□ 0.19
CTF4Q01454 LSM3YLR438C-A 270 nt16.26■□□□□ 0.19
CTF4Q01454 YBL100CYBL100C 315 nt16.26■□□□□ 0.19
CTF4Q01454 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.24■□□□□ 0.19
CTF4Q01454 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.24■□□□□ 0.19
CTF4Q01454 IMT3tM(CAU)J3 72 nt16.24■□□□□ 0.19
CTF4Q01454 IMT1tM(CAU)O1 72 nt16.24■□□□□ 0.19
CTF4Q01454 IMT2tM(CAU)P 72 nt16.24■□□□□ 0.19
CTF4Q01454 SSA3YBL075C 1950 nt16.2■□□□□ 0.18
CTF4Q01454 TRM9YML014W 840 nt16.15■□□□□ 0.18
CTF4Q01454 FIS1YIL065C 468 nt16.14■□□□□ 0.17
CTF4Q01454 PHO4YFR034C 939 nt16.11■□□□□ 0.17
CTF4Q01454 PUS2YGL063W 1113 nt16.1■□□□□ 0.17
CTF4Q01454 FUN26YAL022C 1554 nt16.06■□□□□ 0.16
CTF4Q01454 YLR281CYLR281C 468 nt16.06■□□□□ 0.16
CTF4Q01454 WHI5YOR083W 888 nt16.02■□□□□ 0.16
CTF4Q01454 ALF1YNL148C 765 nt15.85■□□□□ 0.13
CTF4Q01454 CCT6YDR188W 1641 nt15.85■□□□□ 0.13
CTF4Q01454 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.78■□□□□ 0.12
CTF4Q01454 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.78■□□□□ 0.12
CTF4Q01454 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.77■□□□□ 0.12
CTF4Q01454 MOT3YMR070W 1473 nt15.72■□□□□ 0.11
CTF4Q01454 DSK2YMR276W 1122 nt15.71■□□□□ 0.11
CTF4Q01454 FMP45YDL222C 930 nt15.7■□□□□ 0.1
CTF4Q01454 YJL152WYJL152W 360 nt15.67■□□□□ 0.1
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