Protein–RNA interactions for Protein: Q08965

BMS1, Ribosome biogenesis protein BMS1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BMS1Q08965 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.82■■□□□ 1.72
BMS1Q08965 NSR1YGR159C 1245 nt25.48■■□□□ 1.67
BMS1Q08965 NOP1YDL014W 984 nt25.1■■□□□ 1.61
BMS1Q08965 YKL036CYKL036C 393 nt23.35■■□□□ 1.33
BMS1Q08965 MDJ1YFL016C 1536 nt22.53■■□□□ 1.2
BMS1Q08965 Q0297Q0297 156 nt22.06■■□□□ 1.12
BMS1Q08965 SRX1YKL086W 384 nt21.96■■□□□ 1.11
BMS1Q08965 YJL027CYJL027C 417 nt21.85■■□□□ 1.09
BMS1Q08965 SCS3YGL126W 1143 nt21.37■■□□□ 1.01
BMS1Q08965 YCR051WYCR051W 669 nt20.88■□□□□ 0.93
BMS1Q08965 YOL085CYOL085C 342 nt20.26■□□□□ 0.83
BMS1Q08965 DBP2YNL112W 1641 nt20.01■□□□□ 0.79
BMS1Q08965 PKP1YIL042C 1185 nt19.97■□□□□ 0.79
BMS1Q08965 RPP1BYDL130W 321 nt19.8■□□□□ 0.76
BMS1Q08965 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.77■□□□□ 0.76
BMS1Q08965 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.77■□□□□ 0.76
BMS1Q08965 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.77■□□□□ 0.76
BMS1Q08965 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.77■□□□□ 0.76
BMS1Q08965 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.77■□□□□ 0.76
BMS1Q08965 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.77■□□□□ 0.76
BMS1Q08965 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.77■□□□□ 0.76
BMS1Q08965 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.77■□□□□ 0.76
BMS1Q08965 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.77■□□□□ 0.76
BMS1Q08965 CCC1YLR220W 969 nt19.63■□□□□ 0.73
BMS1Q08965 ATS1YAL020C 1002 nt19.16■□□□□ 0.66
BMS1Q08965 YBR190WYBR190W 312 nt19.1■□□□□ 0.65
BMS1Q08965 SCJ1YMR214W 1134 nt19.05■□□□□ 0.64
BMS1Q08965 PET122YER153C 765 nt18.93■□□□□ 0.62
BMS1Q08965 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.78■□□□□ 0.6
BMS1Q08965 RVS167YDR388W 1449 nt18.76■□□□□ 0.59
BMS1Q08965 RTC3YHR087W 336 nt18.72■□□□□ 0.59
BMS1Q08965 SCR1SCR1 522 nt18.71■□□□□ 0.59
BMS1Q08965 RRN5YLR141W 1092 nt18.41■□□□□ 0.54
BMS1Q08965 SHR5YOL110W 714 nt18.17■□□□□ 0.5
BMS1Q08965 YDJ1YNL064C 1230 nt18.12■□□□□ 0.49
BMS1Q08965 RSB1YOR049C 1065 nt18.06■□□□□ 0.48
BMS1Q08965 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.04■□□□□ 0.48
BMS1Q08965 GAR1YHR089C 618 nt17.75■□□□□ 0.43
BMS1Q08965 PST2YDR032C 597 nt17.72■□□□□ 0.43
BMS1Q08965 DEP1YAL013W 1218 nt17.68■□□□□ 0.42
BMS1Q08965 URN1YPR152C 1398 nt17.59■□□□□ 0.41
BMS1Q08965 YNL208WYNL208W 600 nt17.34■□□□□ 0.37
BMS1Q08965 RPN10YHR200W 807 nt17.3■□□□□ 0.36
BMS1Q08965 OPI9YLR338W 858 nt17.28■□□□□ 0.36
BMS1Q08965 PUT4YOR348C 1884 nt17.26■□□□□ 0.35
BMS1Q08965 SAH1YER043C 1350 nt17.17■□□□□ 0.34
BMS1Q08965 TIR1YER011W 765 nt17.13■□□□□ 0.33
BMS1Q08965 YKL097CYKL097C 411 nt17.08■□□□□ 0.32
BMS1Q08965 ARE1YCR048W 1833 nt17.02■□□□□ 0.31
BMS1Q08965 SHU1YHL006C 453 nt16.98■□□□□ 0.31
BMS1Q08965 SSA1YAL005C 1929 nt16.92■□□□□ 0.3
BMS1Q08965 SSA3YBL075C 1950 nt16.86■□□□□ 0.29
BMS1Q08965 YJR018WYJR018W 363 nt16.78■□□□□ 0.28
BMS1Q08965 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.77■□□□□ 0.28
BMS1Q08965 PUN1YLR414C 792 nt16.76■□□□□ 0.27
BMS1Q08965 POA1YBR022W 534 nt16.76■□□□□ 0.27
BMS1Q08965 SRB2YHR041C 633 nt16.73■□□□□ 0.27
BMS1Q08965 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.71■□□□□ 0.27
BMS1Q08965 YJR120WYJR120W 351 nt16.61■□□□□ 0.25
BMS1Q08965 PTC2YER089C 1395 nt16.58■□□□□ 0.24
BMS1Q08965 RPP2BYDR382W 333 nt16.44■□□□□ 0.22
BMS1Q08965 WWM1YFL010C 636 nt16.44■□□□□ 0.22
BMS1Q08965 BUD23YCR047C 828 nt16.42■□□□□ 0.22
BMS1Q08965 YOR139CYOR139C 393 nt16.42■□□□□ 0.22
BMS1Q08965 BSC6YOL137W 1494 nt16.34■□□□□ 0.21
BMS1Q08965 HOM6YJR139C 1080 nt16.31■□□□□ 0.2
BMS1Q08965 NAB2YGL122C 1578 nt16.3■□□□□ 0.2
BMS1Q08965 YGR021WYGR021W 873 nt16.3■□□□□ 0.2
BMS1Q08965 MNP1YGL068W 585 nt16.29■□□□□ 0.2
BMS1Q08965 NPL3YDR432W 1245 nt16.19■□□□□ 0.18
BMS1Q08965 BDH2YAL061W 1254 nt16.17■□□□□ 0.18
BMS1Q08965 INM2YDR287W 879 nt16.13■□□□□ 0.17
BMS1Q08965 FPR4YLR449W 1179 nt16.13■□□□□ 0.17
BMS1Q08965 DAL1YIR027C 1383 nt16.13■□□□□ 0.17
BMS1Q08965 FIS1YIL065C 468 nt16.11■□□□□ 0.17
BMS1Q08965 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.1■□□□□ 0.17
BMS1Q08965 RKM5YLR137W 1104 nt16.07■□□□□ 0.16
BMS1Q08965 YBL100CYBL100C 315 nt16.03■□□□□ 0.16
BMS1Q08965 YOL037CYOL037C 354 nt16■□□□□ 0.15
BMS1Q08965 PHO4YFR034C 939 nt15.99■□□□□ 0.15
BMS1Q08965 LSM3YLR438C-A 270 nt15.98■□□□□ 0.15
BMS1Q08965 FUN26YAL022C 1554 nt15.86■□□□□ 0.13
BMS1Q08965 TRM9YML014W 840 nt15.85■□□□□ 0.13
BMS1Q08965 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.76■□□□□ 0.11
BMS1Q08965 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.76■□□□□ 0.11
BMS1Q08965 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.76■□□□□ 0.11
BMS1Q08965 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.76■□□□□ 0.11
BMS1Q08965 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.76■□□□□ 0.11
BMS1Q08965 YLR281CYLR281C 468 nt15.67■□□□□ 0.1
BMS1Q08965 CCT6YDR188W 1641 nt15.67■□□□□ 0.1
BMS1Q08965 YPS1YLR120C 1710 nt15.62■□□□□ 0.09
BMS1Q08965 WHI5YOR083W 888 nt15.61■□□□□ 0.09
BMS1Q08965 PUS2YGL063W 1113 nt15.59■□□□□ 0.09
BMS1Q08965 ALF1YNL148C 765 nt15.57■□□□□ 0.08
BMS1Q08965 YDR095CYDR095C 411 nt15.53■□□□□ 0.08
BMS1Q08965 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.49■□□□□ 0.07
BMS1Q08965 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.49■□□□□ 0.07
BMS1Q08965 SPT5YML010W 3192 nt15.45■□□□□ 0.06
BMS1Q08965 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.44■□□□□ 0.06
BMS1Q08965 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.43■□□□□ 0.06
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