RNA–Protein interactions for RNA: YMR308C

PSE1, Transcript of Karyopherin/importin that interacts with the nuclear pore complex, yeast

Gene PSE1, Length 3,270 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSE1	YMR308C	YNL058C	P53947	316 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	YPR172W	Q06608	200 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	RPC82	P32349	654 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	CMP2	P14747	604 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	CTF4	Q01454	927 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	NFI1	Q12216	726 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	CHD1	P32657	1468 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.84	□□□□□ -1.47	not detected
PSE1	YMR308C	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	RAD26	P40352	1085 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	GGA1	Q06336	557 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PSE1	YMR308C	OPI1	P21957	404 aa		5.84	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	ERP2	P39704	215 aa		5.84	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	TOM20	P35180	183 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	NPR3	P38742	1146 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	RSC2	Q06488	889 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	BYE1	P36106	594 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	MET10	P39692	1035 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	HSP42	Q12329	375 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	BFA1	P47113	574 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	VTC3	Q02725	835 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	AVO1	Q08236	1176 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	PTP3	P40048	928 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	PRI1	P10363	409 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	PHO87	P25360	923 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	DSF2	P38213	736 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	MGA2	P40578	1113 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	MUM2	P38236	366 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	PRY3	P47033	881 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	ALD2	P47771	506 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	YAF9	P53930	226 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	CTR9	P89105	1077 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	MAM3	Q12296	706 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	ERP4	Q12450	207 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	IME2	P32581	645 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	SEC6	P32844	805 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	LAM1	P38851	1228 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	CLN1	P20437	546 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	MAL31	P38156	614 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	MEP1	P40260	492 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	AAD16	Q02895	342 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	CEX1	Q12453	761 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	PPX1	P38698	397 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	TPM2	P40414	161 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	STE5	P32917	917 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	ESL2	P36168	1195 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	BLI1	P35727	113 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	DNM1	P54861	757 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PSE1	YMR308C	RKM3	P38222	552 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	MPH3	P0CE00	602 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	RAD17	P48581	401 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	YHR218W	P38899	603 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	COG4	Q06096	861 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	ERV41	Q04651	352 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	PEX5	P35056	612 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	APC5	Q08683	685 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	PPH3	P32345	308 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	RRN6	P32786	894 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	YOR389W	Q08912	624 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	GLE1	Q12315	538 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	DSN1	P40568	576 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	GYP7	P48365	746 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSE1	YMR308C	GPI8	P49018	411 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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