Protein–RNA interactions for Protein: Q12450

ERP4, Protein ERP4, yeastyeast

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ERP4Q12450 NSR1YGR159C 1245 nt17.5■□□□□ 0.39
ERP4Q12450 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.27■□□□□ 0.36
ERP4Q12450 NOP1YDL014W 984 nt16.91■□□□□ 0.3
ERP4Q12450 MDJ1YFL016C 1536 nt15.76■□□□□ 0.11
ERP4Q12450 YKL036CYKL036C 393 nt15.59■□□□□ 0.09
ERP4Q12450 Q0297Q0297 156 nt14.7□□□□□ -0.06
ERP4Q12450 SRX1YKL086W 384 nt14.66□□□□□ -0.06
ERP4Q12450 YJL027CYJL027C 417 nt14.58□□□□□ -0.08
ERP4Q12450 Q0182Q0182 405 nt14.29□□□□□ -0.12
ERP4Q12450 SCS3YGL126W 1143 nt14.12□□□□□ -0.15
ERP4Q12450 YCR051WYCR051W 669 nt13.95□□□□□ -0.18
ERP4Q12450 DBP2YNL112W 1641 nt13.89□□□□□ -0.19
ERP4Q12450 YBR190WYBR190W 312 nt13.57□□□□□ -0.24
ERP4Q12450 YOL085CYOL085C 342 nt13.44□□□□□ -0.26
ERP4Q12450 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.41□□□□□ -0.26
ERP4Q12450 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.41□□□□□ -0.26
ERP4Q12450 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.41□□□□□ -0.26
ERP4Q12450 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.41□□□□□ -0.26
ERP4Q12450 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.41□□□□□ -0.26
ERP4Q12450 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.41□□□□□ -0.26
ERP4Q12450 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.41□□□□□ -0.26
ERP4Q12450 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.41□□□□□ -0.26
ERP4Q12450 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.41□□□□□ -0.26
ERP4Q12450 SSA1YAL005C 1929 nt13.4□□□□□ -0.26
ERP4Q12450 MOT3YMR070W 1473 nt13.39□□□□□ -0.27
ERP4Q12450 SSA3YBL075C 1950 nt13.3□□□□□ -0.28
ERP4Q12450 RPP1BYDL130W 321 nt13.21□□□□□ -0.29
ERP4Q12450 PKP1YIL042C 1185 nt13.18□□□□□ -0.3
ERP4Q12450 RTC3YHR087W 336 nt13.16□□□□□ -0.3
ERP4Q12450 CCC1YLR220W 969 nt13.16□□□□□ -0.3
ERP4Q12450 RVS167YDR388W 1449 nt12.95□□□□□ -0.34
ERP4Q12450 SCJ1YMR214W 1134 nt12.85□□□□□ -0.35
ERP4Q12450 FPS1YLL043W 2010 nt12.75□□□□□ -0.37
ERP4Q12450 ATS1YAL020C 1002 nt12.72□□□□□ -0.37
ERP4Q12450 SCR1SCR1 522 nt12.61□□□□□ -0.39
ERP4Q12450 PUT4YOR348C 1884 nt12.57□□□□□ -0.4
ERP4Q12450 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.55□□□□□ -0.4
ERP4Q12450 PET122YER153C 765 nt12.52□□□□□ -0.41
ERP4Q12450 SHR5YOL110W 714 nt12.45□□□□□ -0.42
ERP4Q12450 URN1YPR152C 1398 nt12.26□□□□□ -0.45
ERP4Q12450 ARE1YCR048W 1833 nt12.25□□□□□ -0.45
ERP4Q12450 RRN5YLR141W 1092 nt12.23□□□□□ -0.45
ERP4Q12450 YDJ1YNL064C 1230 nt12.19□□□□□ -0.46
ERP4Q12450 OPI9YLR338W 858 nt12.18□□□□□ -0.46
ERP4Q12450 NVJ2YPR091C 2313 nt12.16□□□□□ -0.46
ERP4Q12450 SAH1YER043C 1350 nt12.14□□□□□ -0.47
ERP4Q12450 DEP1YAL013W 1218 nt12.11□□□□□ -0.47
ERP4Q12450 POA1YBR022W 534 nt12.08□□□□□ -0.48
ERP4Q12450 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.04□□□□□ -0.48
ERP4Q12450 RSB1YOR049C 1065 nt12.04□□□□□ -0.48
ERP4Q12450 RPN10YHR200W 807 nt12.02□□□□□ -0.49
ERP4Q12450 RPM1RPM1 483 nt11.98□□□□□ -0.49
ERP4Q12450 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.97□□□□□ -0.49
ERP4Q12450 YNL208WYNL208W 600 nt11.96□□□□□ -0.49
ERP4Q12450 BSC6YOL137W 1494 nt11.91□□□□□ -0.5
ERP4Q12450 GAR1YHR089C 618 nt11.89□□□□□ -0.51
ERP4Q12450 PAC11YDR488C 1602 nt11.83□□□□□ -0.52
ERP4Q12450 PUN1YLR414C 792 nt11.82□□□□□ -0.52
ERP4Q12450 PST2YDR032C 597 nt11.74□□□□□ -0.53
ERP4Q12450 SPT5YML010W 3192 nt11.7□□□□□ -0.54
ERP4Q12450 PTC2YER089C 1395 nt11.69□□□□□ -0.54
ERP4Q12450 BUD23YCR047C 828 nt11.69□□□□□ -0.54
ERP4Q12450 YJR018WYJR018W 363 nt11.67□□□□□ -0.54
ERP4Q12450 NAB2YGL122C 1578 nt11.6□□□□□ -0.55
ERP4Q12450 FRE6YLL051C 2139 nt11.58□□□□□ -0.56
ERP4Q12450 TIR1YER011W 765 nt11.53□□□□□ -0.56
ERP4Q12450 YJR120WYJR120W 351 nt11.49□□□□□ -0.57
ERP4Q12450 FIS1YIL065C 468 nt11.45□□□□□ -0.58
ERP4Q12450 DAL1YIR027C 1383 nt11.41□□□□□ -0.58
ERP4Q12450 YKL097CYKL097C 411 nt11.39□□□□□ -0.59
ERP4Q12450 RPP2BYDR382W 333 nt11.35□□□□□ -0.59
ERP4Q12450 SSA4YER103W 1929 nt11.33□□□□□ -0.6
ERP4Q12450 INM2YDR287W 879 nt11.32□□□□□ -0.6
ERP4Q12450 PHO4YFR034C 939 nt11.29□□□□□ -0.6
ERP4Q12450 FPR4YLR449W 1179 nt11.27□□□□□ -0.61
ERP4Q12450 MEP2YNL142W 1500 nt11.24□□□□□ -0.61
ERP4Q12450 SRB2YHR041C 633 nt11.23□□□□□ -0.61
ERP4Q12450 YPS1YLR120C 1710 nt11.2□□□□□ -0.62
ERP4Q12450 SHU1YHL006C 453 nt11.19□□□□□ -0.62
ERP4Q12450 YBL100CYBL100C 315 nt11.14□□□□□ -0.63
ERP4Q12450 BDH2YAL061W 1254 nt11.11□□□□□ -0.63
ERP4Q12450 YDR095CYDR095C 411 nt11.09□□□□□ -0.63
ERP4Q12450 UME6YDR207C 2511 nt11.04□□□□□ -0.64
ERP4Q12450 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.03□□□□□ -0.64
ERP4Q12450 DCW1YKL046C 1350 nt11.03□□□□□ -0.64
ERP4Q12450 FUN26YAL022C 1554 nt11.01□□□□□ -0.65
ERP4Q12450 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11□□□□□ -0.65
ERP4Q12450 SSN3YPL042C 1668 nt11□□□□□ -0.65
ERP4Q12450 BDF1YLR399C 2061 nt10.97□□□□□ -0.65
ERP4Q12450 YGR021WYGR021W 873 nt10.97□□□□□ -0.65
ERP4Q12450 WWM1YFL010C 636 nt10.96□□□□□ -0.65
ERP4Q12450 BSP1YPR171W 1731 nt10.94□□□□□ -0.66
ERP4Q12450 LSM3YLR438C-A 270 nt10.93□□□□□ -0.66
ERP4Q12450 TRM9YML014W 840 nt10.91□□□□□ -0.66
ERP4Q12450 EMI2YDR516C 1503 nt10.89□□□□□ -0.67
ERP4Q12450 CCT6YDR188W 1641 nt10.88□□□□□ -0.67
ERP4Q12450 ALF1YNL148C 765 nt10.88□□□□□ -0.67
ERP4Q12450 PTP1YDL230W 1008 nt10.87□□□□□ -0.67
ERP4Q12450 RPP2AYOL039W 321 nt10.85□□□□□ -0.67
ERP4Q12450 NPL3YDR432W 1245 nt10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms