Protein–RNA interactions for Protein: P40260

MEP1, Ammonium transporter MEP1, yeastyeast

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MEP1P40260 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.17■□□□□ 0.82
MEP1P40260 NSR1YGR159C 1245 nt20.06■□□□□ 0.8
MEP1P40260 NOP1YDL014W 984 nt19.62■□□□□ 0.73
MEP1P40260 YKL036CYKL036C 393 nt17.98■□□□□ 0.47
MEP1P40260 MDJ1YFL016C 1536 nt17.85■□□□□ 0.45
MEP1P40260 SRX1YKL086W 384 nt17.06■□□□□ 0.32
MEP1P40260 Q0297Q0297 156 nt17.04■□□□□ 0.32
MEP1P40260 YJL027CYJL027C 417 nt16.8■□□□□ 0.28
MEP1P40260 SCS3YGL126W 1143 nt16.26■□□□□ 0.19
MEP1P40260 YCR051WYCR051W 669 nt16.25■□□□□ 0.19
MEP1P40260 DBP2YNL112W 1641 nt15.67■□□□□ 0.1
MEP1P40260 YOL085CYOL085C 342 nt15.53■□□□□ 0.08
MEP1P40260 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MEP1P40260 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MEP1P40260 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MEP1P40260 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MEP1P40260 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MEP1P40260 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MEP1P40260 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MEP1P40260 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MEP1P40260 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MEP1P40260 CCC1YLR220W 969 nt15.38■□□□□ 0.05
MEP1P40260 PKP1YIL042C 1185 nt15.34■□□□□ 0.05
MEP1P40260 RPP1BYDL130W 321 nt15.32■□□□□ 0.04
MEP1P40260 YBR190WYBR190W 312 nt15.27■□□□□ 0.04
MEP1P40260 RTC3YHR087W 336 nt15.02■□□□□ -0
MEP1P40260 RVS167YDR388W 1449 nt14.92□□□□□ -0.02
MEP1P40260 SCJ1YMR214W 1134 nt14.65□□□□□ -0.06
MEP1P40260 PET122YER153C 765 nt14.62□□□□□ -0.07
MEP1P40260 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.61□□□□□ -0.07
MEP1P40260 SCR1SCR1 522 nt14.56□□□□□ -0.08
MEP1P40260 ATS1YAL020C 1002 nt14.54□□□□□ -0.08
MEP1P40260 SHR5YOL110W 714 nt14.31□□□□□ -0.12
MEP1P40260 RRN5YLR141W 1092 nt14.22□□□□□ -0.13
MEP1P40260 YDJ1YNL064C 1230 nt14.12□□□□□ -0.15
MEP1P40260 URN1YPR152C 1398 nt13.96□□□□□ -0.17
MEP1P40260 RSB1YOR049C 1065 nt13.96□□□□□ -0.17
MEP1P40260 DEP1YAL013W 1218 nt13.95□□□□□ -0.18
MEP1P40260 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.92□□□□□ -0.18
MEP1P40260 GAR1YHR089C 618 nt13.87□□□□□ -0.19
MEP1P40260 PUT4YOR348C 1884 nt13.82□□□□□ -0.2
MEP1P40260 RPN10YHR200W 807 nt13.81□□□□□ -0.2
MEP1P40260 OPI9YLR338W 858 nt13.74□□□□□ -0.21
MEP1P40260 YNL208WYNL208W 600 nt13.73□□□□□ -0.21
MEP1P40260 SAH1YER043C 1350 nt13.67□□□□□ -0.22
MEP1P40260 SSA3YBL075C 1950 nt13.66□□□□□ -0.22
MEP1P40260 ARE1YCR048W 1833 nt13.55□□□□□ -0.24
MEP1P40260 POA1YBR022W 534 nt13.48□□□□□ -0.25
MEP1P40260 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.46□□□□□ -0.25
MEP1P40260 PST2YDR032C 597 nt13.44□□□□□ -0.26
MEP1P40260 PUN1YLR414C 792 nt13.39□□□□□ -0.27
MEP1P40260 TIR1YER011W 765 nt13.38□□□□□ -0.27
MEP1P40260 YJR018WYJR018W 363 nt13.32□□□□□ -0.28
MEP1P40260 PTC2YER089C 1395 nt13.22□□□□□ -0.29
MEP1P40260 BUD23YCR047C 828 nt13.21□□□□□ -0.29
MEP1P40260 SSA1YAL005C 1929 nt13.19□□□□□ -0.3
MEP1P40260 Q0182Q0182 405 nt13.18□□□□□ -0.3
MEP1P40260 BSC6YOL137W 1494 nt13.16□□□□□ -0.3
MEP1P40260 RPP2BYDR382W 333 nt13.12□□□□□ -0.31
MEP1P40260 NAB2YGL122C 1578 nt13.06□□□□□ -0.32
MEP1P40260 YKL097CYKL097C 411 nt12.95□□□□□ -0.34
MEP1P40260 YJR120WYJR120W 351 nt12.94□□□□□ -0.34
MEP1P40260 FPR4YLR449W 1179 nt12.93□□□□□ -0.34
MEP1P40260 SHU1YHL006C 453 nt12.92□□□□□ -0.34
MEP1P40260 INM2YDR287W 879 nt12.88□□□□□ -0.35
MEP1P40260 DAL1YIR027C 1383 nt12.87□□□□□ -0.35
MEP1P40260 SRB2YHR041C 633 nt12.84□□□□□ -0.35
MEP1P40260 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.78□□□□□ -0.36
MEP1P40260 FIS1YIL065C 468 nt12.77□□□□□ -0.37
MEP1P40260 WWM1YFL010C 636 nt12.76□□□□□ -0.37
MEP1P40260 FPS1YLL043W 2010 nt12.76□□□□□ -0.37
MEP1P40260 BDH2YAL061W 1254 nt12.75□□□□□ -0.37
MEP1P40260 YBL100CYBL100C 315 nt12.74□□□□□ -0.37
MEP1P40260 PHO4YFR034C 939 nt12.73□□□□□ -0.37
MEP1P40260 YGR021WYGR021W 873 nt12.72□□□□□ -0.37
MEP1P40260 HOM6YJR139C 1080 nt12.59□□□□□ -0.39
MEP1P40260 TRM9YML014W 840 nt12.59□□□□□ -0.39
MEP1P40260 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.58□□□□□ -0.4
MEP1P40260 LSM3YLR438C-A 270 nt12.58□□□□□ -0.4
MEP1P40260 FUN26YAL022C 1554 nt12.56□□□□□ -0.4
MEP1P40260 MNP1YGL068W 585 nt12.53□□□□□ -0.4
MEP1P40260 ALF1YNL148C 765 nt12.48□□□□□ -0.41
MEP1P40260 YPS1YLR120C 1710 nt12.47□□□□□ -0.41
MEP1P40260 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.44□□□□□ -0.42
MEP1P40260 RKM5YLR137W 1104 nt12.43□□□□□ -0.42
MEP1P40260 NPL3YDR432W 1245 nt12.4□□□□□ -0.42
MEP1P40260 YDR095CYDR095C 411 nt12.38□□□□□ -0.43
MEP1P40260 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.37□□□□□ -0.43
MEP1P40260 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.37□□□□□ -0.43
MEP1P40260 CCT6YDR188W 1641 nt12.37□□□□□ -0.43
MEP1P40260 SPT5YML010W 3192 nt12.36□□□□□ -0.43
MEP1P40260 MEP2YNL142W 1500 nt12.35□□□□□ -0.43
MEP1P40260 YOR139CYOR139C 393 nt12.34□□□□□ -0.43
MEP1P40260 YOL037CYOL037C 354 nt12.33□□□□□ -0.44
MEP1P40260 NVJ2YPR091C 2313 nt12.3□□□□□ -0.44
MEP1P40260 MOT3YMR070W 1473 nt12.22□□□□□ -0.45
MEP1P40260 RPP2AYOL039W 321 nt12.2□□□□□ -0.46
MEP1P40260 SIS1YNL007C 1059 nt12.17□□□□□ -0.46
MEP1P40260 DCW1YKL046C 1350 nt12.12□□□□□ -0.47
MEP1P40260 SSA4YER103W 1929 nt12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.1 ms