Protein–RNA interactions for Protein: Q03338

PRP3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP3Q03338 NSR1YGR159C 1245 nt18.38■□□□□ 0.53
PRP3Q03338 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.97■□□□□ 0.47
PRP3Q03338 NOP1YDL014W 984 nt17.21■□□□□ 0.35
PRP3Q03338 MDJ1YFL016C 1536 nt17.14■□□□□ 0.33
PRP3Q03338 SSA3YBL075C 1950 nt16.85■□□□□ 0.29
PRP3Q03338 YJL027CYJL027C 417 nt15.67■□□□□ 0.1
PRP3Q03338 YKL036CYKL036C 393 nt15.34■□□□□ 0.05
PRP3Q03338 SRX1YKL086W 384 nt15.06■□□□□ 0
PRP3Q03338 YBR190WYBR190W 312 nt14.96□□□□□ -0.01
PRP3Q03338 Q0297Q0297 156 nt14.91□□□□□ -0.02
PRP3Q03338 DBP2YNL112W 1641 nt14.74□□□□□ -0.05
PRP3Q03338 PUT4YOR348C 1884 nt14.59□□□□□ -0.07
PRP3Q03338 RTC3YHR087W 336 nt14.5□□□□□ -0.09
PRP3Q03338 SSA4YER103W 1929 nt14.46□□□□□ -0.09
PRP3Q03338 SPT5YML010W 3192 nt14.34□□□□□ -0.11
PRP3Q03338 PAC11YDR488C 1602 nt14.21□□□□□ -0.13
PRP3Q03338 YCR051WYCR051W 669 nt14.19□□□□□ -0.14
PRP3Q03338 BDF1YLR399C 2061 nt14.07□□□□□ -0.16
PRP3Q03338 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PRP3Q03338 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PRP3Q03338 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PRP3Q03338 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PRP3Q03338 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PRP3Q03338 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PRP3Q03338 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PRP3Q03338 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PRP3Q03338 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PRP3Q03338 NVJ2YPR091C 2313 nt14□□□□□ -0.17
PRP3Q03338 POA1YBR022W 534 nt13.98□□□□□ -0.17
PRP3Q03338 BSC6YOL137W 1494 nt13.95□□□□□ -0.18
PRP3Q03338 ARE1YCR048W 1833 nt13.92□□□□□ -0.18
PRP3Q03338 TAT1YBR069C 1860 nt13.85□□□□□ -0.19
PRP3Q03338 CCC1YLR220W 969 nt13.76□□□□□ -0.21
PRP3Q03338 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.73□□□□□ -0.21
PRP3Q03338 RVS167YDR388W 1449 nt13.67□□□□□ -0.22
PRP3Q03338 SCS3YGL126W 1143 nt13.67□□□□□ -0.22
PRP3Q03338 SCJ1YMR214W 1134 nt13.56□□□□□ -0.24
PRP3Q03338 FPS1YLL043W 2010 nt13.53□□□□□ -0.24
PRP3Q03338 URN1YPR152C 1398 nt13.47□□□□□ -0.25
PRP3Q03338 SAH1YER043C 1350 nt13.45□□□□□ -0.26
PRP3Q03338 RPP1BYDL130W 321 nt13.36□□□□□ -0.27
PRP3Q03338 YOL085CYOL085C 342 nt13.3□□□□□ -0.28
PRP3Q03338 BUD23YCR047C 828 nt13.27□□□□□ -0.29
PRP3Q03338 MEP2YNL142W 1500 nt13.24□□□□□ -0.29
PRP3Q03338 Q0182Q0182 405 nt13.23□□□□□ -0.29
PRP3Q03338 OPI9YLR338W 858 nt13.23□□□□□ -0.29
PRP3Q03338 SSA1YAL005C 1929 nt13.17□□□□□ -0.3
PRP3Q03338 PKP1YIL042C 1185 nt13.15□□□□□ -0.3
PRP3Q03338 SHR5YOL110W 714 nt13.09□□□□□ -0.31
PRP3Q03338 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.02□□□□□ -0.33
PRP3Q03338 YBR220CYBR220C 1683 nt13.01□□□□□ -0.33
PRP3Q03338 DCW1YKL046C 1350 nt13□□□□□ -0.33
PRP3Q03338 UME6YDR207C 2511 nt12.97□□□□□ -0.33
PRP3Q03338 PCH2YBR186W 1695 nt12.89□□□□□ -0.35
PRP3Q03338 NAB2YGL122C 1578 nt12.89□□□□□ -0.35
PRP3Q03338 GUT2YIL155C 1950 nt12.89□□□□□ -0.35
PRP3Q03338 PTC2YER089C 1395 nt12.87□□□□□ -0.35
PRP3Q03338 DEP1YAL013W 1218 nt12.86□□□□□ -0.35
PRP3Q03338 PET122YER153C 765 nt12.85□□□□□ -0.35
PRP3Q03338 PUN1YLR414C 792 nt12.82□□□□□ -0.36
PRP3Q03338 YMR090WYMR090W 684 nt12.78□□□□□ -0.36
PRP3Q03338 EMI2YDR516C 1503 nt12.78□□□□□ -0.36
PRP3Q03338 RPN10YHR200W 807 nt12.73□□□□□ -0.37
PRP3Q03338 SEC11YIR022W 504 nt12.73□□□□□ -0.37
PRP3Q03338 SDH1YKL148C 1923 nt12.68□□□□□ -0.38
PRP3Q03338 PIB2YGL023C 1908 nt12.66□□□□□ -0.38
PRP3Q03338 YNL208WYNL208W 600 nt12.63□□□□□ -0.39
PRP3Q03338 FIS1YIL065C 468 nt12.62□□□□□ -0.39
PRP3Q03338 YDJ1YNL064C 1230 nt12.61□□□□□ -0.39
PRP3Q03338 YPS1YLR120C 1710 nt12.6□□□□□ -0.39
PRP3Q03338 YDL221WYDL221W 552 nt12.58□□□□□ -0.4
PRP3Q03338 BOR1YNL275W 1731 nt12.57□□□□□ -0.4
PRP3Q03338 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.51□□□□□ -0.41
PRP3Q03338 SCR1SCR1 522 nt12.5□□□□□ -0.41
PRP3Q03338 DAL1YIR027C 1383 nt12.48□□□□□ -0.41
PRP3Q03338 YJR018WYJR018W 363 nt12.45□□□□□ -0.42
PRP3Q03338 RTF1YGL244W 1677 nt12.42□□□□□ -0.42
PRP3Q03338 MCH5YOR306C 1566 nt12.42□□□□□ -0.42
PRP3Q03338 SCC4YER147C 1875 nt12.39□□□□□ -0.43
PRP3Q03338 PHO4YFR034C 939 nt12.37□□□□□ -0.43
PRP3Q03338 GAR1YHR089C 618 nt12.37□□□□□ -0.43
PRP3Q03338 RRN5YLR141W 1092 nt12.37□□□□□ -0.43
PRP3Q03338 FPR4YLR449W 1179 nt12.37□□□□□ -0.43
PRP3Q03338 CAC2YML102W 1407 nt12.32□□□□□ -0.44
PRP3Q03338 YDR095CYDR095C 411 nt12.32□□□□□ -0.44
PRP3Q03338 YJL225CYJL225C 5277 nt12.32□□□□□ -0.44
PRP3Q03338 ATS1YAL020C 1002 nt12.3□□□□□ -0.44
PRP3Q03338 YSC84YHR016C 1407 nt12.28□□□□□ -0.44
PRP3Q03338 PTK1YKL198C 1989 nt12.27□□□□□ -0.45
PRP3Q03338 BOP3YNL042W 1191 nt12.21□□□□□ -0.45
PRP3Q03338 PTP1YDL230W 1008 nt12.2□□□□□ -0.46
PRP3Q03338 YJR120WYJR120W 351 nt12.19□□□□□ -0.46
PRP3Q03338 YHL050CYHL050C 2094 nt12.18□□□□□ -0.46
PRP3Q03338 INM2YDR287W 879 nt12.17□□□□□ -0.46
PRP3Q03338 IRC15YPL017C 1500 nt12.16□□□□□ -0.46
PRP3Q03338 MOT3YMR070W 1473 nt12.15□□□□□ -0.46
PRP3Q03338 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.14□□□□□ -0.47
PRP3Q03338 ALG12YNR030W 1656 nt12.13□□□□□ -0.47
PRP3Q03338 GIS3YLR094C 1509 nt12.09□□□□□ -0.47
PRP3Q03338 RPP2AYOL039W 321 nt12.07□□□□□ -0.48
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