Protein–RNA interactions for Protein: Q12453

CEX1, Cytoplasmic export protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEX1Q12453 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.24■■□□□ 1.31
CEX1Q12453 NSR1YGR159C 1245 nt23.09■■□□□ 1.29
CEX1Q12453 NOP1YDL014W 984 nt22.6■■□□□ 1.21
CEX1Q12453 YKL036CYKL036C 393 nt20.8■□□□□ 0.92
CEX1Q12453 MDJ1YFL016C 1536 nt20.53■□□□□ 0.88
CEX1Q12453 Q0297Q0297 156 nt19.71■□□□□ 0.75
CEX1Q12453 SRX1YKL086W 384 nt19.69■□□□□ 0.74
CEX1Q12453 YJL027CYJL027C 417 nt19.43■□□□□ 0.7
CEX1Q12453 SCS3YGL126W 1143 nt18.88■□□□□ 0.61
CEX1Q12453 YCR051WYCR051W 669 nt18.74■□□□□ 0.59
CEX1Q12453 DBP2YNL112W 1641 nt18.09■□□□□ 0.49
CEX1Q12453 YOL085CYOL085C 342 nt17.99■□□□□ 0.47
CEX1Q12453 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.8■□□□□ 0.44
CEX1Q12453 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.8■□□□□ 0.44
CEX1Q12453 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.8■□□□□ 0.44
CEX1Q12453 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.8■□□□□ 0.44
CEX1Q12453 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.8■□□□□ 0.44
CEX1Q12453 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.8■□□□□ 0.44
CEX1Q12453 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.8■□□□□ 0.44
CEX1Q12453 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.8■□□□□ 0.44
CEX1Q12453 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.8■□□□□ 0.44
CEX1Q12453 PKP1YIL042C 1185 nt17.75■□□□□ 0.43
CEX1Q12453 RPP1BYDL130W 321 nt17.71■□□□□ 0.43
CEX1Q12453 CCC1YLR220W 969 nt17.71■□□□□ 0.43
CEX1Q12453 YBR190WYBR190W 312 nt17.51■□□□□ 0.39
CEX1Q12453 RTC3YHR087W 336 nt17.19■□□□□ 0.34
CEX1Q12453 RVS167YDR388W 1449 nt17.12■□□□□ 0.33
CEX1Q12453 SCJ1YMR214W 1134 nt16.93■□□□□ 0.3
CEX1Q12453 PET122YER153C 765 nt16.91■□□□□ 0.3
CEX1Q12453 ATS1YAL020C 1002 nt16.88■□□□□ 0.29
CEX1Q12453 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.86■□□□□ 0.29
CEX1Q12453 SCR1SCR1 522 nt16.78■□□□□ 0.28
CEX1Q12453 SHR5YOL110W 714 nt16.46■□□□□ 0.23
CEX1Q12453 RRN5YLR141W 1092 nt16.43■□□□□ 0.22
CEX1Q12453 YDJ1YNL064C 1230 nt16.3■□□□□ 0.2
CEX1Q12453 RSB1YOR049C 1065 nt16.12■□□□□ 0.17
CEX1Q12453 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.1■□□□□ 0.17
CEX1Q12453 DEP1YAL013W 1218 nt16.04■□□□□ 0.16
CEX1Q12453 URN1YPR152C 1398 nt16.03■□□□□ 0.16
CEX1Q12453 GAR1YHR089C 618 nt15.98■□□□□ 0.15
CEX1Q12453 PUT4YOR348C 1884 nt15.86■□□□□ 0.13
CEX1Q12453 RPN10YHR200W 807 nt15.83■□□□□ 0.12
CEX1Q12453 OPI9YLR338W 858 nt15.79■□□□□ 0.12
CEX1Q12453 YNL208WYNL208W 600 nt15.77■□□□□ 0.12
CEX1Q12453 SAH1YER043C 1350 nt15.7■□□□□ 0.1
CEX1Q12453 PST2YDR032C 597 nt15.62■□□□□ 0.09
CEX1Q12453 ARE1YCR048W 1833 nt15.58■□□□□ 0.08
CEX1Q12453 TIR1YER011W 765 nt15.43■□□□□ 0.06
CEX1Q12453 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.43■□□□□ 0.06
CEX1Q12453 POA1YBR022W 534 nt15.42■□□□□ 0.06
CEX1Q12453 PUN1YLR414C 792 nt15.35■□□□□ 0.05
CEX1Q12453 YJR018WYJR018W 363 nt15.3■□□□□ 0.04
CEX1Q12453 SSA1YAL005C 1929 nt15.22■□□□□ 0.03
CEX1Q12453 PTC2YER089C 1395 nt15.17■□□□□ 0.02
CEX1Q12453 BUD23YCR047C 828 nt15.12■□□□□ 0.01
CEX1Q12453 BSC6YOL137W 1494 nt15.08■□□□□ 0
CEX1Q12453 YKL097CYKL097C 411 nt15.03■□□□□ -0
CEX1Q12453 RPP2BYDR382W 333 nt15.02■□□□□ -0
CEX1Q12453 SHU1YHL006C 453 nt15□□□□□ -0.01
CEX1Q12453 NAB2YGL122C 1578 nt14.97□□□□□ -0.01
CEX1Q12453 YJR120WYJR120W 351 nt14.96□□□□□ -0.01
CEX1Q12453 SRB2YHR041C 633 nt14.91□□□□□ -0.02
CEX1Q12453 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.82□□□□□ -0.04
CEX1Q12453 FPR4YLR449W 1179 nt14.79□□□□□ -0.04
CEX1Q12453 DAL1YIR027C 1383 nt14.77□□□□□ -0.04
CEX1Q12453 SSA3YBL075C 1950 nt14.77□□□□□ -0.04
CEX1Q12453 INM2YDR287W 879 nt14.76□□□□□ -0.05
CEX1Q12453 WWM1YFL010C 636 nt14.74□□□□□ -0.05
CEX1Q12453 FIS1YIL065C 468 nt14.7□□□□□ -0.06
CEX1Q12453 BDH2YAL061W 1254 nt14.67□□□□□ -0.06
CEX1Q12453 YGR021WYGR021W 873 nt14.66□□□□□ -0.06
CEX1Q12453 YBL100CYBL100C 315 nt14.62□□□□□ -0.07
CEX1Q12453 PHO4YFR034C 939 nt14.61□□□□□ -0.07
CEX1Q12453 HOM6YJR139C 1080 nt14.56□□□□□ -0.08
CEX1Q12453 MNP1YGL068W 585 nt14.51□□□□□ -0.09
CEX1Q12453 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.5□□□□□ -0.09
CEX1Q12453 LSM3YLR438C-A 270 nt14.48□□□□□ -0.09
CEX1Q12453 TRM9YML014W 840 nt14.44□□□□□ -0.1
CEX1Q12453 FUN26YAL022C 1554 nt14.43□□□□□ -0.1
CEX1Q12453 YOR139CYOR139C 393 nt14.38□□□□□ -0.11
CEX1Q12453 RKM5YLR137W 1104 nt14.37□□□□□ -0.11
CEX1Q12453 NPL3YDR432W 1245 nt14.35□□□□□ -0.11
CEX1Q12453 YPS1YLR120C 1710 nt14.32□□□□□ -0.12
CEX1Q12453 ALF1YNL148C 765 nt14.28□□□□□ -0.12
CEX1Q12453 YOL037CYOL037C 354 nt14.27□□□□□ -0.13
CEX1Q12453 CCT6YDR188W 1641 nt14.24□□□□□ -0.13
CEX1Q12453 SPT5YML010W 3192 nt14.24□□□□□ -0.13
CEX1Q12453 YDR095CYDR095C 411 nt14.22□□□□□ -0.13
CEX1Q12453 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.22□□□□□ -0.13
CEX1Q12453 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.17□□□□□ -0.14
CEX1Q12453 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.17□□□□□ -0.14
CEX1Q12453 MEP2YNL142W 1500 nt14.14□□□□□ -0.15
CEX1Q12453 SIS1YNL007C 1059 nt13.99□□□□□ -0.17
CEX1Q12453 RPP2AYOL039W 321 nt13.99□□□□□ -0.17
CEX1Q12453 YLR281CYLR281C 468 nt13.92□□□□□ -0.18
CEX1Q12453 DCW1YKL046C 1350 nt13.92□□□□□ -0.18
CEX1Q12453 WHI5YOR083W 888 nt13.91□□□□□ -0.18
CEX1Q12453 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.89□□□□□ -0.19
CEX1Q12453 PTP1YDL230W 1008 nt13.87□□□□□ -0.19
CEX1Q12453 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.9 ms