Protein–RNA interactions for Protein: P38899

YHR218W, Putative uncharacterized protein YHR218W, yeastyeast

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR218WP38899 NSR1YGR159C 1245 nt19.33■□□□□ 0.68
YHR218WP38899 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.14■□□□□ 0.65
YHR218WP38899 NOP1YDL014W 984 nt18.41■□□□□ 0.54
YHR218WP38899 MDJ1YFL016C 1536 nt17.57■□□□□ 0.4
YHR218WP38899 YKL036CYKL036C 393 nt16.64■□□□□ 0.25
YHR218WP38899 YJL027CYJL027C 417 nt16.16■□□□□ 0.18
YHR218WP38899 SRX1YKL086W 384 nt16.09■□□□□ 0.17
YHR218WP38899 Q0297Q0297 156 nt15.99■□□□□ 0.15
YHR218WP38899 DBP2YNL112W 1641 nt15.38■□□□□ 0.05
YHR218WP38899 YCR051WYCR051W 669 nt15.26■□□□□ 0.03
YHR218WP38899 YBR190WYBR190W 312 nt15.05■□□□□ -0
YHR218WP38899 SCS3YGL126W 1143 nt14.94□□□□□ -0.02
YHR218WP38899 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YHR218WP38899 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YHR218WP38899 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YHR218WP38899 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YHR218WP38899 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YHR218WP38899 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YHR218WP38899 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YHR218WP38899 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YHR218WP38899 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YHR218WP38899 RTC3YHR087W 336 nt14.72□□□□□ -0.05
YHR218WP38899 CCC1YLR220W 969 nt14.66□□□□□ -0.06
YHR218WP38899 YOL085CYOL085C 342 nt14.44□□□□□ -0.1
YHR218WP38899 RPP1BYDL130W 321 nt14.35□□□□□ -0.11
YHR218WP38899 RVS167YDR388W 1449 nt14.34□□□□□ -0.11
YHR218WP38899 PKP1YIL042C 1185 nt14.29□□□□□ -0.12
YHR218WP38899 SCJ1YMR214W 1134 nt14.23□□□□□ -0.13
YHR218WP38899 SSA3YBL075C 1950 nt14.15□□□□□ -0.14
YHR218WP38899 PUT4YOR348C 1884 nt13.98□□□□□ -0.17
YHR218WP38899 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.87□□□□□ -0.19
YHR218WP38899 PET122YER153C 765 nt13.78□□□□□ -0.2
YHR218WP38899 SHR5YOL110W 714 nt13.76□□□□□ -0.21
YHR218WP38899 URN1YPR152C 1398 nt13.63□□□□□ -0.23
YHR218WP38899 ARE1YCR048W 1833 nt13.62□□□□□ -0.23
YHR218WP38899 DEP1YAL013W 1218 nt13.54□□□□□ -0.24
YHR218WP38899 SAH1YER043C 1350 nt13.54□□□□□ -0.24
YHR218WP38899 POA1YBR022W 534 nt13.53□□□□□ -0.24
YHR218WP38899 OPI9YLR338W 858 nt13.5□□□□□ -0.25
YHR218WP38899 SCR1SCR1 522 nt13.5□□□□□ -0.25
YHR218WP38899 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.45□□□□□ -0.26
YHR218WP38899 YDJ1YNL064C 1230 nt13.4□□□□□ -0.26
YHR218WP38899 RRN5YLR141W 1092 nt13.35□□□□□ -0.27
YHR218WP38899 RPN10YHR200W 807 nt13.32□□□□□ -0.28
YHR218WP38899 BSC6YOL137W 1494 nt13.3□□□□□ -0.28
YHR218WP38899 ATS1YAL020C 1002 nt13.25□□□□□ -0.29
YHR218WP38899 YNL208WYNL208W 600 nt13.25□□□□□ -0.29
YHR218WP38899 GAR1YHR089C 618 nt13.19□□□□□ -0.3
YHR218WP38899 BUD23YCR047C 828 nt13.11□□□□□ -0.31
YHR218WP38899 PUN1YLR414C 792 nt13.1□□□□□ -0.31
YHR218WP38899 SSA1YAL005C 1929 nt13.09□□□□□ -0.31
YHR218WP38899 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.07□□□□□ -0.32
YHR218WP38899 PTC2YER089C 1395 nt13.04□□□□□ -0.32
YHR218WP38899 YJR018WYJR018W 363 nt12.97□□□□□ -0.33
YHR218WP38899 SPT5YML010W 3192 nt12.95□□□□□ -0.34
YHR218WP38899 RSB1YOR049C 1065 nt12.95□□□□□ -0.34
YHR218WP38899 NAB2YGL122C 1578 nt12.9□□□□□ -0.35
YHR218WP38899 Q0182Q0182 405 nt12.8□□□□□ -0.36
YHR218WP38899 TIR1YER011W 765 nt12.76□□□□□ -0.37
YHR218WP38899 FPS1YLL043W 2010 nt12.74□□□□□ -0.37
YHR218WP38899 YJR120WYJR120W 351 nt12.72□□□□□ -0.37
YHR218WP38899 FIS1YIL065C 468 nt12.69□□□□□ -0.38
YHR218WP38899 SSA4YER103W 1929 nt12.68□□□□□ -0.38
YHR218WP38899 DAL1YIR027C 1383 nt12.66□□□□□ -0.38
YHR218WP38899 FPR4YLR449W 1179 nt12.64□□□□□ -0.39
YHR218WP38899 RPP2BYDR382W 333 nt12.59□□□□□ -0.39
YHR218WP38899 PHO4YFR034C 939 nt12.55□□□□□ -0.4
YHR218WP38899 INM2YDR287W 879 nt12.54□□□□□ -0.4
YHR218WP38899 MEP2YNL142W 1500 nt12.52□□□□□ -0.41
YHR218WP38899 SRB2YHR041C 633 nt12.44□□□□□ -0.42
YHR218WP38899 YPS1YLR120C 1710 nt12.43□□□□□ -0.42
YHR218WP38899 NVJ2YPR091C 2313 nt12.38□□□□□ -0.43
YHR218WP38899 YBL100CYBL100C 315 nt12.38□□□□□ -0.43
YHR218WP38899 DCW1YKL046C 1350 nt12.34□□□□□ -0.43
YHR218WP38899 PST2YDR032C 597 nt12.33□□□□□ -0.44
YHR218WP38899 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.33□□□□□ -0.44
YHR218WP38899 YDR095CYDR095C 411 nt12.3□□□□□ -0.44
YHR218WP38899 BDH2YAL061W 1254 nt12.28□□□□□ -0.44
YHR218WP38899 FUN26YAL022C 1554 nt12.22□□□□□ -0.45
YHR218WP38899 BDF1YLR399C 2061 nt12.22□□□□□ -0.45
YHR218WP38899 PAC11YDR488C 1602 nt12.21□□□□□ -0.46
YHR218WP38899 EMI2YDR516C 1503 nt12.16□□□□□ -0.46
YHR218WP38899 WWM1YFL010C 636 nt12.15□□□□□ -0.46
YHR218WP38899 ALF1YNL148C 765 nt12.13□□□□□ -0.47
YHR218WP38899 TRM9YML014W 840 nt12.12□□□□□ -0.47
YHR218WP38899 YMR090WYMR090W 684 nt12.08□□□□□ -0.48
YHR218WP38899 PTP1YDL230W 1008 nt12.07□□□□□ -0.48
YHR218WP38899 RPP2AYOL039W 321 nt12.07□□□□□ -0.48
YHR218WP38899 CAC2YML102W 1407 nt12.05□□□□□ -0.48
YHR218WP38899 YBR220CYBR220C 1683 nt12.05□□□□□ -0.48
YHR218WP38899 TAT1YBR069C 1860 nt12.05□□□□□ -0.48
YHR218WP38899 YDL221WYDL221W 552 nt12.03□□□□□ -0.48
YHR218WP38899 LSM3YLR438C-A 270 nt12.03□□□□□ -0.48
YHR218WP38899 CCT6YDR188W 1641 nt12□□□□□ -0.49
YHR218WP38899 SIS1YNL007C 1059 nt11.95□□□□□ -0.5
YHR218WP38899 SDH1YKL148C 1923 nt11.95□□□□□ -0.5
YHR218WP38899 SHU1YHL006C 453 nt11.94□□□□□ -0.5
YHR218WP38899 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.93□□□□□ -0.5
YHR218WP38899 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.93□□□□□ -0.5
YHR218WP38899 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.92□□□□□ -0.5
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