RNA–Protein interactions for RNA: YMR306W

FKS3, Transcript of Protein involved in spore wall assembly, yeast

Gene FKS3, Length 5,358 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FKS3	YMR306W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	GAL10	P04397	699 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	TKL2	P33315	681 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	not detected
FKS3	YMR306W	DAS1	P47005	663 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YDR344C	Q05510	147 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	PEX19	Q07418	342 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	DCS2	Q12123	353 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YPL150W	Q12152	901 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	HSP78	P33416	811 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MAL33	P38157	468 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	ATG12	P38316	186 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	UBP7	P40453	1071 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	ATH1	P48016	1211 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MUB1	Q03162	620 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YLR297W	Q05899	129 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	GPM2	Q12008	311 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	PTC5	Q12511	572 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	RGR1	P19263	1082 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	RAD55	P38953	406 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	UFE1	P41834	346 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YOL098C	Q12496	1037 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	GAC1	P28006	793 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	GPI10	P30777	616 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	KIC1	P38692	1080 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	ERC1	P38767	581 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	NUP60	P39705	539 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	DSN1	P40568	576 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	THI6	P41835	540 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YNR065C	P53751	1116 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YPR078C	Q06813	372 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MPC54	Q08550	464 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SVS1	Q12254	260 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MPD2	Q99316	277 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	HIS5	P07172	385 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	APL1	P27351	700 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YJR061W	P40355	935 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	BRE2	P43132	505 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	DAK2	P43550	591 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	BST1	P43571	1029 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	RSM7	P47150	247 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	JJJ1	P53863	590 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	GCN5	Q03330	439 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	AEP2	P22136	580 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MNN4	P36044	1178 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SAF1	P38352	637 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	RRM3	P38766	723 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	GUF1	P46943	645 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	PFD1	P46988	109 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	NUP84	P52891	726 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YER152C	P10356	443 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	RDS1	P25611	832 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MSH2	P25847	964 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YJL045W	P47052	634 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	VPS70	P47161	811 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	CTR1	P49573	406 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	HOP2	P53187	214 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	NMA2	P53204	395 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	NIS1	P53939	407 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.73	□□□□□ -1.97	not detected
FKS3	YMR306W	EEB1	Q02891	456 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YPR027C	Q12079	277 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	CTF3	Q12748	733 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	DAL7	P21826	554 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SAP190	P36123	1033 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MRPL40	P36534	297 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MUM2	P38236	366 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	VAC8	P39968	578 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	TUB4	P53378	473 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	ECM23	Q02710	187 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	KEX2	P13134	814 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SPC110	P32380	944 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	HIR1	P32479	840 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	FRE1	P32791	686 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	GDH3	P39708	457 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	HST1	P53685	503 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	GCS1	P35197	352 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SFB3	P38810	929 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	PSY2	P40164	858 aa		2.73	□□□□□ -1.97

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